284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0013 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0004  recombination protein F  94.21 
 
 		 363 aa  672    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000368793 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1344  recombination protein F  98.07 
 
 		 368 aa  699    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0013  recombination protein F  100 
 
 		 363 aa  711    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0003  recombination protein F  65.55 
 
 		 375 aa  458  9.999999999999999e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0003  recombination protein F  63.28 
 
 		 357 aa  417  9.999999999999999e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0791811  normal  0.40226 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2835  recombination protein F  59.04 
 
 		 358 aa  374  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3375  recombination protein F  54.24 
 
 		 361 aa  365  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0005  DNA replication and repair protein RecF  54.03 
 
 		 412 aa  321  9.999999999999999e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0464034  hitchhiker  1.0596299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4412  recombination protein F  47.14 
 
 		 374 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4092  recombination protein F  47.96 
 
 		 374 aa  290  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0311  recombination protein F  46.99 
 
 		 374 aa  284  2.0000000000000002e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.406883  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0003  recombination protein F  47.28 
 
 		 391 aa  276  4e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.671854  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3395  recombination protein F  47.95 
 
 		 409 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.714394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0003  recombination protein F  49.46 
 
 		 384 aa  271  1e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.0080717  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0003  recombination protein F  49.46 
 
 		 384 aa  270  2.9999999999999997e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0003  recombination protein F  45.9 
 
 		 379 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0005  recombination protein F  48.77 
 
 		 387 aa  266  5e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0004  recombination protein F  46.45 
 
 		 378 aa  263  4e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.949729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0003  recombination protein F  46.72 
 
 		 378 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.552608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0003  DNA replication and repair protein RecF  45.7 
 
 		 382 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.45272  normal  0.393317 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1277  recombination protein F  44.12 
 
 		 378 aa  251  1e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  1.19843e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0003  recombination protein F  44.29 
 
 		 385 aa  251  2e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0004  recombination protein F  44.79 
 
 		 378 aa  249  7e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.914523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0003  recombination protein F  44.54 
 
 		 379 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0004  DNA replication and repair protein RecF  44.39 
 
 		 385 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.350342  normal  0.69961 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2800  recombination protein F  47.5 
 
 		 356 aa  245  8e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0004  DNA replication and repair protein RecF  44.39 
 
 		 385 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.615543  normal  0.382944 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0003  DNA replication and repair protein RecF  44.92 
 
 		 384 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.64703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0158  recombination protein F  47.46 
 
 		 392 aa  242  6e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.43131  normal  0.105898 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0003  DNA replication and repair protein RecF  45.88 
 
 		 384 aa  239  6.999999999999999e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000323741  normal  0.930359 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0003  recombination protein F  44.66 
 
 		 379 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0714428  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2240  DNA replication and repair protein RecF  43.21 
 
 		 384 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0003  DNA replication and repair protein RecF  43.13 
 
 		 382 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241044  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1153  recombination protein F  48.08 
 
 		 357 aa  229  6e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.409843  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0003  recombination protein F  43.55 
 
 		 378 aa  223  4e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.322535  hitchhiker  0.000000874576 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3222  DNA replication and repair protein RecF  42.93 
 
 		 398 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505165 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0003  recombination protein F  43.51 
 
 		 375 aa  216  5e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1707  recombination protein F  43.68 
 
 		 369 aa  213  5.999999999999999e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.812314  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1286  recombination protein F  31.83 
 
 		 365 aa  195  1e-48  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3146  DNA replication and repair protein RecF  40.38 
 
 		 403 aa  189  7e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.522741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0003  recombination protein F  41.08 
 
 		 373 aa  179  4.999999999999999e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0582  recombination protein F  41.81 
 
 		 379 aa  176  8e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.829059  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0045  recombination protein F  30.65 
 
 		 372 aa  175  9e-43  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.498392  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0076  recombination protein F  30.77 
 
 		 372 aa  166  8e-40  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0004  DNA replication and repair protein RecF  26.99 
 
 		 376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0199  putative DNA replication and repair protein RecF  32.31 
 
 		 349 aa  127  2.0000000000000002e-28  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00154503  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0004  DNA replication and repair protein RecF  27.3 
 
 		 372 aa  126  7e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370076  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0004  recombination protein F  26.51 
 
 		 362 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2374  DNA replication and repair protein RecF  27.68 
 
 		 369 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0004  DNA replication and repair protein RecF  27 
 
 		 386 aa  118  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00780262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0003  DNA replication and repair protein RecF  32.16 
 
 		 382 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0003  DNA replication and repair protein RecF  22.13 
 
 		 362 aa  114  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000115018  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0004  recombination protein F  24.79 
 
 		 375 aa  113  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000104808  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0004  recombination protein F  24.79 
 
 		 375 aa  113  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.864622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0004  recombination protein F  24.79 
 
 		 375 aa  113  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0214  DNA replication and repair protein RecF  25.86 
 
 		 359 aa  112  8.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.613838  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0004  recombination protein F  24.79 
 
 		 375 aa  112  9e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.340003 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0004  recombination protein F  24.79 
 
 		 375 aa  112  9e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5316  recombination protein F  24.79 
 
 		 375 aa  112  9e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0155044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0004  recombination protein F  24.79 
 
 		 375 aa  112  9e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0004  recombination protein F  24.79 
 
 		 375 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1991  recombination protein F  26.72 
 
 		 366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0004  recombination protein F  24.79 
 
 		 375 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0003  recombination protein F  27.78 
 
 		 360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000366734  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0003  recombination protein F  29.43 
 
 		 370 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.715959  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0434  DNA replication and repair protein RecF  29.79 
 
 		 392 aa  110  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.626531  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2156  recombination protein F  26.55 
 
 		 369 aa  109  6e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000779125  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0004  recombination protein F  25.5 
 
 		 375 aa  109  6e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0498  hypothetical protein  25.31 
 
 		 370 aa  108  1e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0004  recombination protein F  25.71 
 
 		 373 aa  108  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.177605  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0003  recombination protein F  26.76 
 
 		 360 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133569  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0003  recombination protein F  26.76 
 
 		 360 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0219866  hitchhiker  0.0042678 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0003  recombination protein F  26.84 
 
 		 360 aa  108  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0384357  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0003  recombination protein F  26.25 
 
 		 360 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0851424  hitchhiker  0.00000000117147 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0005  DNA replication and repair protein RecF  31.52 
 
 		 370 aa  107  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000369508  hitchhiker  0.000000145417 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0003  recombination protein F  26.47 
 
 		 360 aa  107  5e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00706398  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0346  recombination protein F  27.07 
 
 		 365 aa  106  6e-22  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0003  recombination protein F  26.25 
 
 		 360 aa  106  8e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0977543  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0004  DNA replication and repair protein RecF  26.37 
 
 		 360 aa  105  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5508  DNA replication and repair protein RecF  26.04 
 
 		 368 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1620  recombination protein F  30.94 
 
 		 358 aa  105  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.251361 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3886  DNA replication and repair protein RecF  29.01 
 
 		 365 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00040  DNA replication and repair protein RecF  26.76 
 
 		 375 aa  104  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0003  recombination protein F  26.02 
 
 		 360 aa  105  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.316978  hitchhiker  0.00705664 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0003  recombination protein F  25.59 
 
 		 360 aa  104  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.029356  unclonable  0.0000000000200533 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0004  recombination protein F  26.91 
 
 		 374 aa  104  3e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0011  recombination protein F  25.59 
 
 		 360 aa  104  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00668622  hitchhiker  0.00000000141072 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0003  recombination protein F  25.75 
 
 		 364 aa  103  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0003  recombination protein F  28.32 
 
 		 368 aa  103  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000843052  unclonable  0.00000000000512174 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0004  DNA replication and repair protein RecF  32.78 
 
 		 377 aa  103  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.780515  decreased coverage  0.00205006 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1183  DNA replication and repair protein RecF  25.51 
 
 		 373 aa  103  6e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00164356  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09773  putative DNA replication and repair protein  25.14 
 
 		 359 aa  103  7e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.753312  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0010  recombination protein F  25.15 
 
 		 360 aa  102  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0004  recombination protein F  27.07 
 
 		 374 aa  102  1e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.60396e-25 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0004  DNA replication and repair protein RecF  31.51 
 
 		 378 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.332828  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0008  recombination protein F  26.47 
 
 		 360 aa  101  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0621721  hitchhiker  0.00000000274736 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0015  recombination protein F  25.61 
 
 		 360 aa  101  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00214178  hitchhiker  0.000779425 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00030  recF protein  27.98 
 
 		 376 aa  100  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000612951  decreased coverage  0.0000132668 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2436  DNA replication and repair protein RecF  28.98 
 
 		 398 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.532549  normal  0.0198697 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0004  recombination protein F  29.12 
 
 		 401 aa  100  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.582462  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>