287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0003 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_0003  recombination protein F  100 
 
 		 375 aa  757    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1344  recombination protein F  65.3 
 
 		 368 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0004  recombination protein F  65.27 
 
 		 363 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000368793 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0013  recombination protein F  65.55 
 
 		 363 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0003  recombination protein F  60.28 
 
 		 357 aa  429  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0791811  normal  0.40226 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3375  recombination protein F  57.02 
 
 		 361 aa  397  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2835  recombination protein F  55.83 
 
 		 358 aa  377  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0005  DNA replication and repair protein RecF  49.72 
 
 		 412 aa  303  3.0000000000000004e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0464034  hitchhiker  1.0596299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0311  recombination protein F  43.72 
 
 		 374 aa  280  3e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.406883  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4412  recombination protein F  44.81 
 
 		 374 aa  279  6e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4092  recombination protein F  44.84 
 
 		 374 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0003  recombination protein F  44.09 
 
 		 391 aa  269  5e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.671854  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0003  recombination protein F  43.29 
 
 		 385 aa  265  8.999999999999999e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3395  recombination protein F  44.32 
 
 		 409 aa  260  3e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.714394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0003  recombination protein F  42.01 
 
 		 379 aa  260  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0003  recombination protein F  42.74 
 
 		 379 aa  252  7e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0004  recombination protein F  40.66 
 
 		 378 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.949729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0004  recombination protein F  40.93 
 
 		 378 aa  249  6e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.914523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0003  recombination protein F  43.44 
 
 		 384 aa  249  7e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.0080717  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0003  recombination protein F  43.44 
 
 		 384 aa  248  2e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0003  DNA replication and repair protein RecF  44.05 
 
 		 382 aa  247  3e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.45272  normal  0.393317 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0003  recombination protein F  41.21 
 
 		 378 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.552608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0158  recombination protein F  43.23 
 
 		 392 aa  245  8e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.43131  normal  0.105898 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0005  recombination protein F  41.67 
 
 		 387 aa  245  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0003  DNA replication and repair protein RecF  43.96 
 
 		 384 aa  244  9.999999999999999e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000323741  normal  0.930359 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0004  DNA replication and repair protein RecF  43.05 
 
 		 385 aa  242  7e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.615543  normal  0.382944 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3222  DNA replication and repair protein RecF  42.39 
 
 		 398 aa  242  9e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505165 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0003  DNA replication and repair protein RecF  42.39 
 
 		 382 aa  241  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241044  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0003  DNA replication and repair protein RecF  42.78 
 
 		 384 aa  241  2e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.64703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0003  recombination protein F  42.74 
 
 		 379 aa  238  1e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0714428  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0004  DNA replication and repair protein RecF  42.23 
 
 		 385 aa  238  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.350342  normal  0.69961 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2240  DNA replication and repair protein RecF  41.46 
 
 		 384 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1277  recombination protein F  41.62 
 
 		 378 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  1.19843e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0003  recombination protein F  41.05 
 
 		 375 aa  229  5e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0003  recombination protein F  41.96 
 
 		 378 aa  228  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.322535  hitchhiker  0.000000874576 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2800  recombination protein F  43.64 
 
 		 356 aa  224  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1153  recombination protein F  41.52 
 
 		 357 aa  208  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.409843  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1707  recombination protein F  42.61 
 
 		 369 aa  202  9.999999999999999e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.812314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0003  recombination protein F  40.73 
 
 		 373 aa  200  3.9999999999999996e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1286  recombination protein F  31.89 
 
 		 365 aa  199  9e-50  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3146  DNA replication and repair protein RecF  37.99 
 
 		 403 aa  191  2.9999999999999997e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.522741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0582  recombination protein F  39.61 
 
 		 379 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.829059  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0045  recombination protein F  30.66 
 
 		 372 aa  187  2e-46  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.498392  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0076  recombination protein F  30.12 
 
 		 372 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0004  DNA replication and repair protein RecF  27.09 
 
 		 372 aa  133  5e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370076  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2374  DNA replication and repair protein RecF  26.12 
 
 		 369 aa  129  6e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0199  putative DNA replication and repair protein RecF  26.4 
 
 		 349 aa  128  1.0000000000000001e-28  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00154503  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0004  DNA replication and repair protein RecF  24.43 
 
 		 376 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2156  recombination protein F  25.55 
 
 		 369 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000779125  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0003  recombination protein F  29.15 
 
 		 370 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.715959  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2436  DNA replication and repair protein RecF  28.29 
 
 		 398 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.532549  normal  0.0198697 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0004  DNA replication and repair protein RecF  25 
 
 		 360 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0004  recombination protein F  23.36 
 
 		 375 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.864622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0004  recombination protein F  23.36 
 
 		 375 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0434  DNA replication and repair protein RecF  28.05 
 
 		 392 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.626531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0004  recombination protein F  23.36 
 
 		 375 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000104808  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5316  recombination protein F  23.36 
 
 		 375 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0155044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0003  recombination protein F  26.57 
 
 		 360 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.029356  unclonable  0.0000000000200533 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0003  recombination protein F  26.57 
 
 		 360 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.316978  hitchhiker  0.00705664 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0011  recombination protein F  26.57 
 
 		 360 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00668622  hitchhiker  0.00000000141072 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0004  recombination protein F  23.36 
 
 		 375 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.340003 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0004  recombination protein F  23.36 
 
 		 375 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0004  recombination protein F  23.36 
 
 		 375 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0004  recombination protein F  23.36 
 
 		 375 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0004  recombination protein F  23.08 
 
 		 375 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0004  DNA replication and repair protein RecF  23.54 
 
 		 386 aa  112  7.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00780262  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0010  recombination protein F  25.97 
 
 		 360 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0004  recombination protein F  23.43 
 
 		 373 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.177605  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0003  DNA replication and repair protein RecF  31.32 
 
 		 372 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0004  recombination protein F  23.23 
 
 		 375 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0004  recombination protein F  23.85 
 
 		 362 aa  110  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1991  recombination protein F  24.58 
 
 		 366 aa  109  6e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1772  DNA replication and repair protein RecF  26.02 
 
 		 371 aa  109  8.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0034  recombination protein F  28.45 
 
 		 361 aa  109  9.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000927918  normal  0.243305 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0015  recombination protein F  25.96 
 
 		 360 aa  108  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00214178  hitchhiker  0.000779425 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0214  DNA replication and repair protein RecF  23.1 
 
 		 359 aa  107  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.613838  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0003  DNA replication and repair protein RecF  30.99 
 
 		 369 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.979634 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4151  recombination protein F  27.5 
 
 		 361 aa  107  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000332755  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0015  DNA replication and repair protein RecF  25.29 
 
 		 340 aa  107  4e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.486493  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0003  recombination protein F  27.12 
 
 		 361 aa  105  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0661286  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0003  DNA replication and repair protein RecF  31.32 
 
 		 372 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0003  recombination protein F  25.81 
 
 		 360 aa  105  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000366734  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0534  DNA replication and repair protein RecF  23.91 
 
 		 367 aa  104  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.921957  hitchhiker  0.00000000241058 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4175  recombination protein F  27.22 
 
 		 361 aa  105  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0239408  normal  0.0132322 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0003  recombination protein F  27.22 
 
 		 361 aa  105  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0003  recombination protein F  25.32 
 
 		 360 aa  103  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00706398  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0003  DNA replication and repair protein RecF  21.39 
 
 		 362 aa  104  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000115018  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0003  recombination protein F  26.97 
 
 		 361 aa  103  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0110624  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0003  recombination protein F  25.64 
 
 		 360 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0851424  hitchhiker  0.00000000117147 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2450  DNA replication and repair protein RecF  33.42 
 
 		 366 aa  104  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0003  recombination protein F  25.64 
 
 		 360 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0219866  hitchhiker  0.0042678 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0003  DNA replication and repair protein RecF  30.17 
 
 		 372 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0003  recombination protein F  25.64 
 
 		 360 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133569  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0003  recombination protein F  24.7 
 
 		 360 aa  103  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0130388  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0008  recombination protein F  25.73 
 
 		 360 aa  103  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0621721  hitchhiker  0.00000000274736 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00040  DNA replication and repair protein RecF  28.93 
 
 		 390 aa  103  7e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0003  recombination protein F  26.97 
 
 		 361 aa  102  8e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279219  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0003  DNA replication and repair protein RecF  28.46 
 
 		 362 aa  102  9e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000176519  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09773  putative DNA replication and repair protein  24.03 
 
 		 359 aa  102  9e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.753312  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0003  recombination protein F  25.64 
 
 		 360 aa  102  9e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0977543  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>