More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0003 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0003  DNA replication and repair protein RecF  100 
 
 		 384 aa  751    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000323741  normal  0.930359 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0005  DNA replication and repair protein RecF  49.48 
 
 		 412 aa  299  7e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0464034  hitchhiker  1.0596299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0003  recombination protein F  47.55 
 
 		 391 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.671854  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3395  recombination protein F  48.05 
 
 		 409 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.714394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0311  recombination protein F  45.41 
 
 		 374 aa  266  5e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.406883  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4412  recombination protein F  44.8 
 
 		 374 aa  265  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0003  recombination protein F  45.7 
 
 		 384 aa  264  2e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.0080717  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4092  recombination protein F  44.53 
 
 		 374 aa  264  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0158  recombination protein F  49.48 
 
 		 392 aa  263  4e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.43131  normal  0.105898 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0005  recombination protein F  43.96 
 
 		 387 aa  261  1e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0003  recombination protein F  45.43 
 
 		 384 aa  260  2e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0004  recombination protein F  45.74 
 
 		 378 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.949729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0003  recombination protein F  43.55 
 
 		 375 aa  256  4e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0003  recombination protein F  46.84 
 
 		 378 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.322535  hitchhiker  0.000000874576 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0003  recombination protein F  44.27 
 
 		 379 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0003  recombination protein F  45.87 
 
 		 378 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.552608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1344  recombination protein F  45.92 
 
 		 368 aa  251  2e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0013  recombination protein F  45.92 
 
 		 363 aa  249  5e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0003  recombination protein F  45.91 
 
 		 375 aa  248  1e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0003  recombination protein F  45.12 
 
 		 379 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0004  recombination protein F  43.6 
 
 		 378 aa  245  8e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.914523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0003  recombination protein F  43.04 
 
 		 385 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3222  DNA replication and repair protein RecF  43.72 
 
 		 398 aa  243  5e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505165 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0004  DNA replication and repair protein RecF  46.01 
 
 		 385 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.350342  normal  0.69961 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0003  recombination protein F  42.35 
 
 		 357 aa  239  5e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0791811  normal  0.40226 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2800  recombination protein F  44.08 
 
 		 356 aa  239  5.999999999999999e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0003  DNA replication and repair protein RecF  43.95 
 
 		 382 aa  237  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.45272  normal  0.393317 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0004  recombination protein F  43.75 
 
 		 363 aa  236  6e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000368793 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0003  DNA replication and repair protein RecF  45.79 
 
 		 384 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.64703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2240  DNA replication and repair protein RecF  46.3 
 
 		 384 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0004  DNA replication and repair protein RecF  45.79 
 
 		 385 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.615543  normal  0.382944 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2835  recombination protein F  45.45 
 
 		 358 aa  233  3e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3375  recombination protein F  42.42 
 
 		 361 aa  233  5e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1277  recombination protein F  39.14 
 
 		 378 aa  231  1e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  1.19843e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0003  DNA replication and repair protein RecF  44.41 
 
 		 382 aa  229  7e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241044  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1707  recombination protein F  43.68 
 
 		 369 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.812314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0003  recombination protein F  44.06 
 
 		 379 aa  220  3.9999999999999997e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0714428  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0045  recombination protein F  31.64 
 
 		 372 aa  209  1e-52  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.498392  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1286  recombination protein F  31.42 
 
 		 365 aa  201  1.9999999999999998e-50  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0076  recombination protein F  31.36 
 
 		 372 aa  200  3e-50  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3146  DNA replication and repair protein RecF  41.98 
 
 		 403 aa  196  4.0000000000000005e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.522741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1153  recombination protein F  43.05 
 
 		 357 aa  196  8.000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.409843  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0582  recombination protein F  40.58 
 
 		 379 aa  191  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.829059  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0003  recombination protein F  37.57 
 
 		 373 aa  155  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0199  putative DNA replication and repair protein RecF  29.33 
 
 		 349 aa  125  1e-27  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00154503  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0434  DNA replication and repair protein RecF  31.44 
 
 		 392 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.626531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0003  DNA replication and repair protein RecF  32.76 
 
 		 397 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0003  recombination protein F  28.69 
 
 		 360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0851424  hitchhiker  0.00000000117147 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0003  recombination protein F  27.71 
 
 		 360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00706398  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0015  recombination protein F  29.55 
 
 		 360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00214178  hitchhiker  0.000779425 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0003  recombination protein F  28.69 
 
 		 360 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0977543  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0003  recombination protein F  28.69 
 
 		 360 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0219866  hitchhiker  0.0042678 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0003  recombination protein F  28.69 
 
 		 360 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133569  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0346  recombination protein F  28.1 
 
 		 365 aa  109  9.000000000000001e-23  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2374  DNA replication and repair protein RecF  25.74 
 
 		 369 aa  107  5e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0003  recombination protein F  28.81 
 
 		 360 aa  106  6e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0384357  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0003  recombination protein F  28.81 
 
 		 360 aa  106  6e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.316978  hitchhiker  0.00705664 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0010  recombination protein F  28.81 
 
 		 360 aa  106  7e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0003  recombination protein F  28.81 
 
 		 360 aa  106  7e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.029356  unclonable  0.0000000000200533 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0011  recombination protein F  28.81 
 
 		 360 aa  106  7e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00668622  hitchhiker  0.00000000141072 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0005  DNA replication and repair protein RecF  30.03 
 
 		 370 aa  105  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000369508  hitchhiker  0.000000145417 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0004  DNA replication and repair protein RecF  26.2 
 
 		 360 aa  105  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0003  DNA replication and repair protein RecF  20 
 
 		 362 aa  104  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000115018  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0003  recombination protein F  26.89 
 
 		 360 aa  104  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0188151  hitchhiker  0.0000523089 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0004  DNA replication and repair protein RecF  26.33 
 
 		 373 aa  103  6e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346024  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0003  recombination protein F  28.93 
 
 		 360 aa  103  7e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000366734  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3717  DNA replication and repair protein  27.48 
 
 		 377 aa  102  8e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.329241 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0004  DNA replication and repair protein RecF  23.4 
 
 		 376 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0534  DNA replication and repair protein RecF  24.54 
 
 		 367 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.921957  hitchhiker  0.00000000241058 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0004  recombination protein F  24.48 
 
 		 373 aa  101  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.177605  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0004  DNA replication and repair protein RecF  25.95 
 
 		 386 aa  100  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00780262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0138  recombination protein F  26.15 
 
 		 358 aa  100  6e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0005  recombination protein F  29.58 
 
 		 367 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0005  DNA replication and repair protein RecF  32.14 
 
 		 401 aa  99.8  7e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0003  recombination protein F  26.29 
 
 		 365 aa  99.4  9e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00186248  hitchhiker  0.000000180359 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0003  RecF protein  29.71 
 
 		 367 aa  98.6  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312936  normal  0.12892 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0004  recombination protein F  23.75 
 
 		 375 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.864622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0004  recombination protein F  23.75 
 
 		 375 aa  98.2  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0008  recombination protein F  26.78 
 
 		 360 aa  98.2  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0621721  hitchhiker  0.00000000274736 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0003  recombination protein F  27.68 
 
 		 360 aa  98.6  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0130388  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0004  recombination protein F  23.75 
 
 		 375 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000104808  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0824  recombination protein F  33.33 
 
 		 389 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0004  recombination protein F  23.75 
 
 		 375 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.340003 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0004  recombination protein F  23.75 
 
 		 375 aa  97.8  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0004  recombination protein F  23.75 
 
 		 375 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0004  recombination protein F  23.75 
 
 		 375 aa  97.8  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0004  recombination protein F  23.75 
 
 		 375 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0004  DNA replication and repair protein RecF  31.32 
 
 		 378 aa  97.4  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.332828  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0003  recombination protein F  29.58 
 
 		 367 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.510695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2436  DNA replication and repair protein RecF  30.11 
 
 		 398 aa  97.4  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.532549  normal  0.0198697 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0004  recombination protein F  32.22 
 
 		 386 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187663 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2750  DNA replication and repair protein RecF  30.79 
 
 		 387 aa  97.1  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.433504  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0003  recombination protein F  29.58 
 
 		 367 aa  96.7  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113705  normal  0.121048 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0004  recombination protein F  28.4 
 
 		 402 aa  96.3  9e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000215476 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0012  recombination protein F  29.58 
 
 		 367 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000250595 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2156  recombination protein F  23.51 
 
 		 369 aa  95.5  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000779125  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0011  recombination protein F  26.15 
 
 		 359 aa  95.9  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.10983  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0003  recombination protein F  28.24 
 
 		 368 aa  95.5  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000843052  unclonable  0.00000000000512174 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5316  recombination protein F  23.46 
 
 		 375 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0155044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0003  DNA replication and repair protein  25.5 
 
 		 357 aa  95.5  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0109066  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>