More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0582 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0582  recombination protein F  100 
 
 		 379 aa  726    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.829059  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0003  recombination protein F  53.66 
 
 		 373 aa  303  3.0000000000000004e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0005  DNA replication and repair protein RecF  46.39 
 
 		 412 aa  265  7e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0464034  hitchhiker  1.0596299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0003  recombination protein F  47.73 
 
 		 375 aa  261  2e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4092  recombination protein F  43.36 
 
 		 374 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4412  recombination protein F  43.87 
 
 		 374 aa  253  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0003  recombination protein F  43.49 
 
 		 391 aa  243  3e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.671854  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2800  recombination protein F  44.62 
 
 		 356 aa  239  5.999999999999999e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3222  DNA replication and repair protein RecF  43.3 
 
 		 398 aa  238  1e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505165 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0311  recombination protein F  41.46 
 
 		 374 aa  234  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.406883  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0003  DNA replication and repair protein RecF  43.5 
 
 		 382 aa  229  7e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.45272  normal  0.393317 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0003  recombination protein F  42.78 
 
 		 379 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3395  recombination protein F  41.39 
 
 		 409 aa  228  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.714394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0003  recombination protein F  43.5 
 
 		 385 aa  227  2e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0003  recombination protein F  43.24 
 
 		 378 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.552608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0003  recombination protein F  43.06 
 
 		 379 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0004  recombination protein F  42.63 
 
 		 378 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.949729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1707  recombination protein F  48.01 
 
 		 369 aa  223  3e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.812314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0004  recombination protein F  43.06 
 
 		 378 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.914523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0003  recombination protein F  43.4 
 
 		 378 aa  223  4.9999999999999996e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.322535  hitchhiker  0.000000874576 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1153  recombination protein F  43.6 
 
 		 357 aa  219  5e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.409843  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0003  recombination protein F  42.12 
 
 		 384 aa  219  7.999999999999999e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.0080717  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0158  recombination protein F  41.76 
 
 		 392 aa  216  4e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.43131  normal  0.105898 
 
 
-
 
NC_004310  BR0003  recombination protein F  41.85 
 
 		 384 aa  215  9e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0003  DNA replication and repair protein RecF  41.76 
 
 		 382 aa  215  9e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241044  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0003  recombination protein F  40.17 
 
 		 375 aa  213  3.9999999999999995e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0003  recombination protein F  43.92 
 
 		 379 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0714428  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1277  recombination protein F  39.67 
 
 		 378 aa  213  5.999999999999999e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  1.19843e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0004  DNA replication and repair protein RecF  40.57 
 
 		 385 aa  211  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.615543  normal  0.382944 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0003  DNA replication and repair protein RecF  41.09 
 
 		 384 aa  212  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.64703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0004  DNA replication and repair protein RecF  41.81 
 
 		 385 aa  211  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.350342  normal  0.69961 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2240  DNA replication and repair protein RecF  41.93 
 
 		 384 aa  209  5e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0005  recombination protein F  40.32 
 
 		 387 aa  206  6e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0003  DNA replication and repair protein RecF  40.6 
 
 		 384 aa  199  5e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000323741  normal  0.930359 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1344  recombination protein F  42.78 
 
 		 368 aa  199  6e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2835  recombination protein F  41.45 
 
 		 358 aa  198  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0013  recombination protein F  42.54 
 
 		 363 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0004  recombination protein F  41.97 
 
 		 363 aa  197  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000368793 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3146  DNA replication and repair protein RecF  40.71 
 
 		 403 aa  193  4e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.522741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0003  recombination protein F  36.65 
 
 		 357 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0791811  normal  0.40226 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3375  recombination protein F  35.98 
 
 		 361 aa  177  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0045  recombination protein F  26.7 
 
 		 372 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.498392  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0076  recombination protein F  26.59 
 
 		 372 aa  160  3e-38  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1286  recombination protein F  26.33 
 
 		 365 aa  139  7e-32  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0199  putative DNA replication and repair protein RecF  27.25 
 
 		 349 aa  125  2e-27  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00154503  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0003  recombination protein F  29.14 
 
 		 370 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.715959  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2374  DNA replication and repair protein RecF  24.93 
 
 		 369 aa  110  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0003  recombination protein F  27.93 
 
 		 364 aa  108  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0003  DNA replication and repair protein RecF  27.75 
 
 		 360 aa  107  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.447101  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0004  DNA replication and repair protein RecF  22.05 
 
 		 376 aa  107  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0003  DNA replication and repair protein RecF  27.47 
 
 		 364 aa  105  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0003  DNA replication and repair protein RecF  25.33 
 
 		 363 aa  104  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0004  DNA replication and repair protein RecF  22.63 
 
 		 386 aa  105  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00780262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0003  DNA replication and repair protein RecF  32.45 
 
 		 369 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.979634 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0534  DNA replication and repair protein RecF  23.02 
 
 		 367 aa  103  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.921957  hitchhiker  0.00000000241058 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2436  DNA replication and repair protein RecF  29.1 
 
 		 398 aa  102  8e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.532549  normal  0.0198697 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0003  DNA replication and repair protein RecF  29.05 
 
 		 359 aa  102  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00348761  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0003  DNA replication and repair protein RecF  31.91 
 
 		 372 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0003  DNA replication and repair protein RecF  25 
 
 		 369 aa  101  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0749386  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0003  DNA replication and repair protein RecF  31.38 
 
 		 372 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0003  DNA replication and repair protein RecF  28.8 
 
 		 382 aa  100  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0003  RecF protein  26.84 
 
 		 367 aa  99.8  7e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312936  normal  0.12892 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0004  recombination protein F  30.69 
 
 		 401 aa  99.4  8e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.582462  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2156  recombination protein F  22.37 
 
 		 369 aa  98.2  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000779125  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0005  DNA replication and repair protein RecF  29.49 
 
 		 370 aa  98.2  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000369508  hitchhiker  0.000000145417 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0003  DNA repair and genetic recombination protein  24.2 
 
 		 365 aa  98.6  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0003  recombination protein F  31.12 
 
 		 364 aa  97.8  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0323054 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0004  recombination protein F  23 
 
 		 370 aa  96.3  8e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.320094  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0004  recombination protein F  23 
 
 		 370 aa  96.3  8e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.188075  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00030  recF protein  27.73 
 
 		 376 aa  95.9  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000612951  decreased coverage  0.0000132668 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1225  DNA replication and repair protein RecF  30.14 
 
 		 349 aa  94.4  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.193168  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0003  DNA replication and repair protein RecF  28.49 
 
 		 358 aa  94.4  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0003  recombination protein F  24.78 
 
 		 360 aa  94  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0384357  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0004  recombination protein F  28.04 
 
 		 374 aa  93.6  6e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.60396e-25 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0003  DNA replication and repair protein RecF  30.85 
 
 		 372 aa  93.2  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0003  DNA replication and repair protein RecF  32.69 
 
 		 370 aa  93.2  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0003  recombination protein F  26.93 
 
 		 360 aa  92.8  8e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00706398  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0434  DNA replication and repair protein RecF  29.32 
 
 		 392 aa  92.8  9e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.626531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0004  DNA replication and repair protein RecF  32.23 
 
 		 381 aa  92  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.321306  normal  0.933031 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0003  recombination protein F  26.61 
 
 		 360 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0851424  hitchhiker  0.00000000117147 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0004  DNA replication and repair protein RecF  24.05 
 
 		 360 aa  91.7  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0003  recombination protein F  26.61 
 
 		 360 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133569  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00040  DNA replication and repair protein RecF  23.37 
 
 		 375 aa  91.7  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0003  recombination protein F  26.61 
 
 		 360 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0219866  hitchhiker  0.0042678 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0018  RecF protein  24.15 
 
 		 363 aa  90.9  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0003  recombination protein F  25.8 
 
 		 368 aa  90.5  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000843052  unclonable  0.00000000000512174 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0003  recombination protein F  26.61 
 
 		 360 aa  90.5  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0977543  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0011  recombination protein F  25.21 
 
 		 359 aa  90.5  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.10983  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2550  recombination protein F  23.72 
 
 		 371 aa  90.1  5e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0191996  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0004  DNA replication and repair protein RecF  21.92 
 
 		 372 aa  90.1  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370076  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00030  DNA replication and repair protein RecF  28.18 
 
 		 414 aa  90.1  6e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0950556  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0003  recombination protein F  26.02 
 
 		 360 aa  90.1  6e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.029356  unclonable  0.0000000000200533 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0004  recombination protein F  19.74 
 
 		 362 aa  89.7  7e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1362  DNA replication and repair protein RecF  23.81 
 
 		 339 aa  89.7  7e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0010  recombination protein F  25.73 
 
 		 360 aa  89.7  8e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0003  recombination protein F  22.66 
 
 		 364 aa  89.7  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0004  DNA replication and repair protein RecF  29.55 
 
 		 378 aa  89.4  9e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.332828  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0003  DNA replication and repair protein RecF  19.11 
 
 		 362 aa  89.4  9e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000115018  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0011  recombination protein F  25.73 
 
 		 360 aa  89.4  9e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00668622  hitchhiker  0.00000000141072 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0004  recombination protein F  23.33 
 
 		 373 aa  89  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.177605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>