51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2184 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_2184  phosphoribulokinase/uridine kinase  100 
 
 		 233 aa  476  1e-133  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0330  uridine kinase-like  62.56 
 
 		 240 aa  282  3.0000000000000004e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0269818 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1431  phosphoribulokinase/uridine kinase  57.87 
 
 		 219 aa  272  4.0000000000000004e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.2795 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0659  phosphoribulokinase/uridine kinase  57.99 
 
 		 237 aa  265  5e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0173  uridine kinase-like protein  57.87 
 
 		 219 aa  258  8e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0052  uridine kinase-like  57.14 
 
 		 193 aa  212  4.9999999999999996e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0202  uridine kinase  29.85 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2509  hypothetical protein  26.67 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.170262  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81319  uridine kinase  23.72 
 
 		 504 aa  55.5  0.0000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0146953  normal  0.484619 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0464  hypothetical protein  24.52 
 
 		 231 aa  52.4  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0478  hypothetical protein  24.52 
 
 		 231 aa  52.4  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.997056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0533  uridine kinase  25.41 
 
 		 207 aa  52  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0339  uridine kinase  24.62 
 
 		 207 aa  49.7  0.00004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00730  uridine kinase  25.4 
 
 		 207 aa  48.9  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0558456  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2543  uridine kinase  25.56 
 
 		 198 aa  47.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000577655  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1881  pantothenate kinase  24.5 
 
 		 229 aa  47  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1154  hypothetical protein  23.24 
 
 		 313 aa  46.2  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.332851  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1327  chromosome partitioning ATPase  41.67 
 
 		 376 aa  46.6  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1007  phosphoribulokinase/uridine kinase family protein  25 
 
 		 219 aa  46.2  0.0005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.931754  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4025  hypothetical protein  36.49 
 
 		 379 aa  45.8  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1447  phosphoribulokinase/uridine kinase  27.38 
 
 		 325 aa  45.8  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1215  uridine kinase  23.08 
 
 		 218 aa  45.4  0.0007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000175656  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5982  MRP protein-like protein  31.71 
 
 		 374 aa  45.4  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.141343  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00760  hypothetical protein  40 
 
 		 376 aa  45.4  0.0008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.161739  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0402  MRP protein-like  40.26 
 
 		 358 aa  44.7  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.277305  normal  0.78996 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1603  pantothenate kinase  27.89 
 
 		 229 aa  44.3  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3793  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.65 
 
 		 261 aa  43.9  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0543422  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl306  uridine kinase  25.66 
 
 		 208 aa  44.3  0.002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000466982  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1825  uridine kinase  23.85 
 
 		 206 aa  44.3  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2048  MRP ATP/GTP-binding protein  31.67 
 
 		 372 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.224977 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1927  MRP protein-like  44.07 
 
 		 360 aa  43.5  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.789784  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1044  Mrp/Nbp35 family ATP-binding protein  40 
 
 		 373 aa  43.1  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3393  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  31.71 
 
 		 372 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_002950  PG0959  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  41.82 
 
 		 372 aa  42.7  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.152007 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1588  protein of unknown function DUF59  45.28 
 
 		 363 aa  42.7  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0044  uridine kinase  26.2 
 
 		 211 aa  42.7  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1482  phosphoribulokinase  21.94 
 
 		 291 aa  42.4  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.793248 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1290  phosphoribulokinase/uridine kinase  26.09 
 
 		 547 aa  42  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.297478  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4970  uridine kinase  26.79 
 
 		 268 aa  42.4  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.552464 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4128  uridine kinase  25.64 
 
 		 230 aa  42.4  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.229142  normal  0.752795 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1831  protein of unknown function DUF59  34.18 
 
 		 345 aa  42.4  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.203374  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0052  mrP protein  40.3 
 
 		 361 aa  42.4  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1110  ATPase-like, ParA/MinD  45.1 
 
 		 367 aa  42.4  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.559665 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2245  ATP-binding protein, Mrp/Nbp35 family protein  40 
 
 		 371 aa  42  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.615288  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5082  MRP protein-like protein  47.73 
 
 		 373 aa  42  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0031  phosphoribulokinase/uridine kinase  28.57 
 
 		 555 aa  42  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3054  phosphoribulokinase/uridine kinase  23.77 
 
 		 462 aa  42  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0691  hypothetical protein  47.17 
 
 		 357 aa  42  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0228073  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0560  protein of unknown function DUF59  42.59 
 
 		 362 aa  42  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1138  hypothetical protein  32.26 
 
 		 368 aa  41.6  0.01  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4546  phosphoribulokinase/uridine kinase  21.93 
 
 		 217 aa  41.6  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.896481 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>