More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3793 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3793  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
261 aa  524  1e-148  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0543422  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0074  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  63.92 
 
 
258 aa  319  3e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1428  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  58.23 
 
 
263 aa  292  3e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.489476  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4497  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59.24 
 
 
268 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.163163 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4099  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  58.8 
 
 
254 aa  273  2.0000000000000002e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0303  cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.05 
 
 
260 aa  250  2e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1681  cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.53 
 
 
260 aa  240  1e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00843819  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0219  cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.53 
 
 
260 aa  238  5.999999999999999e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.321933  normal  0.962999 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1010  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.42 
 
 
261 aa  236  2e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04470  Carbon monoxide dehydrogenae assesory protein, CooC  46.92 
 
 
266 aa  236  3e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.788733  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0797  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.01 
 
 
260 aa  235  6e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.123163  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1029  cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.32 
 
 
252 aa  232  4.0000000000000004e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.554413  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0554  cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.58 
 
 
263 aa  226  4e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0371044  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1269  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.55 
 
 
253 aa  225  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.328604  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0038  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.66 
 
 
260 aa  217  2e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0143  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.66 
 
 
274 aa  211  7e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1204  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.69 
 
 
249 aa  205  5e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0107  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.57 
 
 
251 aa  203  2e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.94 
 
 
255 aa  202  4e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0692  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.87 
 
 
259 aa  188  1e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00303671  normal  0.102031 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1276  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.19 
 
 
272 aa  182  6e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.954733 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1313  CODH nickel-insertion accessory protein  46.54 
 
 
213 aa  179  4e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.880069  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2256  CODH nickel-insertion accessory protein  43.52 
 
 
223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197048  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0846  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.65 
 
 
300 aa  169  5e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0221899  normal  0.32789 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0885  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.43 
 
 
281 aa  169  5e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.810765  normal  0.749714 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1375  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.05 
 
 
265 aa  165  6.9999999999999995e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.316103 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0058  CO dehydrogenase maturation factor  41.5 
 
 
290 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000462787  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2097  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein, putative  39.64 
 
 
284 aa  158  9e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0617  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  39.5 
 
 
290 aa  152  5e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1235  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.93 
 
 
258 aa  149  6e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00902647  normal  0.593653 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0933  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.95 
 
 
258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.7514  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0381  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.09 
 
 
275 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2232  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein CooC, putative  39 
 
 
283 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3029  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein CooC, putative  38.68 
 
 
268 aa  136  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1676  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.14 
 
 
250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.91 
 
 
250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0224  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.75 
 
 
250 aa  129  6e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.534474  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0802  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.38 
 
 
250 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0308  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.71 
 
 
250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0704532  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0289  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.84 
 
 
253 aa  127  3e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.11 
 
 
250 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000822608  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0431  carbon-monoxide dehydrogenase accessory protein  36.96 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.118892  normal  0.958218 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1885  CODH nickel-insertion accessory protein  31.95 
 
 
254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  0.650281 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1132  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.5 
 
 
293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.382082  normal  0.362539 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0201  nitrogenase iron protein  35.41 
 
 
253 aa  118  7e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000834701  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2391  hypothetical protein  32.86 
 
 
262 aa  115  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.597516  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0059  CODH nickel-insertion accessory protein  32.72 
 
 
271 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.79352 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0244  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.58 
 
 
258 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0713791  normal  0.92182 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0511  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.06 
 
 
249 aa  108  6e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357895  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0808  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.19 
 
 
274 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131067  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0506  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.22 
 
 
258 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1780  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.67 
 
 
259 aa  105  9e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.183966  hitchhiker  0.000314302 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1463  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.67 
 
 
259 aa  105  9e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.886751  normal  0.0311446 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0606  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.67 
 
 
259 aa  105  9e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119561  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1191  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.25 
 
 
258 aa  104  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0163515 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1488  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.2 
 
 
252 aa  104  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000754699  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2510  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.06 
 
 
257 aa  103  4e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.510145  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0339  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.24 
 
 
250 aa  103  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1413  nitrogenase reductase related protein  27.45 
 
 
258 aa  102  9e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.475078  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1199  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.8 
 
 
249 aa  98.2  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0874  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.31 
 
 
258 aa  98.2  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2848  hypothetical protein  33.33 
 
 
325 aa  97.8  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.933644  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2794  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.89 
 
 
251 aa  96.7  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1274  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.23 
 
 
252 aa  95.9  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000167527  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1091  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.2 
 
 
254 aa  95.9  6e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000055289  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0072  hypothetical protein  32.61 
 
 
325 aa  95.9  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3613  putative ATP-binding protein  32.22 
 
 
319 aa  92.8  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7191  hypothetical protein  32.02 
 
 
334 aa  91.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4886  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  30.71 
 
 
327 aa  91.7  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0754  putative ATP-binding protein  31.6 
 
 
324 aa  90.1  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.546644  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3517  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  31.86 
 
 
314 aa  88.2  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2777  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.64 
 
 
260 aa  87.8  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9286  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  31 
 
 
321 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0331  nitrogenase reductase related protein  25.41 
 
 
212 aa  82  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.3746  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1355  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.14 
 
 
318 aa  81.3  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0638  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  30.91 
 
 
260 aa  80.9  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1096  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.2 
 
 
265 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0669  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  31.86 
 
 
260 aa  77  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0703  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  31.86 
 
 
260 aa  77  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0342  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.9 
 
 
259 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_607  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  31.86 
 
 
260 aa  76.6  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2761  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.11 
 
 
250 aa  70.5  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2542  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.95 
 
 
146 aa  69.7  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.2409 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1374  CODH nickel-insertion accessory protein  28.51 
 
 
259 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.329731 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4571  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.24 
 
 
404 aa  62.4  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0691  CODH nickel-insertion accessory protein  24.27 
 
 
260 aa  62  0.000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.071672  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5555  plasmid partitioning protein RepA  32.98 
 
 
405 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.661673 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6317  plasmid partitioning protein RepA  32.98 
 
 
405 aa  59.7  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3257  cellulose synthase operon protein YhjQ  53.85 
 
 
262 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116604  normal  0.940064 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9501  replication protein A  32.63 
 
 
405 aa  57.4  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222629  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3561  plasmid partitioning protein RepA  28.91 
 
 
405 aa  57  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0949194  normal  0.167025 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5615  plasmid partitioning protein RepA  28.25 
 
 
408 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  0.199114 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4711  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.73 
 
 
404 aa  56.2  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3276  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.16 
 
 
410 aa  55.5  0.0000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7789  plasmid partitioning protein RepA  29.32 
 
 
405 aa  55.5  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.45198  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9001  replication protein A  37.5 
 
 
399 aa  53.1  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1763  septum site-determining protein MinD  28.64 
 
 
271 aa  53.1  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000014274  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5193  plasmid partitioning protein RepA  29.67 
 
 
397 aa  52.8  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0372499  normal  0.16282 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6017  plasmid partitioning protein RepA  29.84 
 
 
398 aa  52.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0237613  normal  0.19813 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4543  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  58 
 
 
404 aa  52.4  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>