133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0173 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0173  uridine kinase-like protein  100 
 
 		 219 aa  447  1e-125  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1431  phosphoribulokinase/uridine kinase  77.17 
 
 		 219 aa  357  9e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.2795 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0330  uridine kinase-like  62.96 
 
 		 240 aa  282  3.0000000000000004e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0269818 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2184  phosphoribulokinase/uridine kinase  57.87 
 
 		 233 aa  267  8e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0659  phosphoribulokinase/uridine kinase  56.94 
 
 		 237 aa  255  4e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0052  uridine kinase-like  56.57 
 
 		 193 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00730  uridine kinase  29.01 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0558456  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1330  uridine kinase  30.77 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.60785 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0339  uridine kinase  30.3 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0533  uridine kinase  26.32 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1825  uridine kinase  23.66 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1881  pantothenate kinase  29.45 
 
 		 229 aa  54.7  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1668  uridine kinase  28.57 
 
 		 207 aa  54.7  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1702  uridine kinase  28.57 
 
 		 207 aa  54.7  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.69825  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1848  uridine kinase  29.01 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81319  uridine kinase  25.19 
 
 		 504 aa  53.1  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0146953  normal  0.484619 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1175  uridine kinase  28.83 
 
 		 207 aa  52.4  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3054  uridine kinase  33.04 
 
 		 201 aa  52  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.654412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0202  uridine kinase  25.22 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2054  uridine kinase  24.82 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1934  phosphoribulokinase/uridine kinase  26.47 
 
 		 340 aa  50.4  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0863853  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1215  uridine kinase  23.85 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000175656  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1281  uridine kinase  23.85 
 
 		 209 aa  49.3  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0044  uridine kinase  27.34 
 
 		 211 aa  49.3  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1819  uridine kinase  32.56 
 
 		 232 aa  48.5  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1820  uridine kinase  32.56 
 
 		 232 aa  48.1  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0464  hypothetical protein  24.22 
 
 		 231 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0478  hypothetical protein  24.22 
 
 		 231 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.997056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0178  phosphoribulokinase/uridine kinase  23.26 
 
 		 555 aa  48.1  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.871097  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0823  uridine kinase  24.24 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3519  phosphoribulokinase/uridine kinase  23.23 
 
 		 553 aa  47.8  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3054  phosphoribulokinase/uridine kinase  24.83 
 
 		 462 aa  48.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0176  phosphoribulokinase/uridine kinase  23.26 
 
 		 555 aa  48.1  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0833476  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1588  protein of unknown function DUF59  50 
 
 		 363 aa  47.8  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4429  phosphoribulokinase  27.33 
 
 		 313 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000782103  normal  0.086912 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0167  phosphoribulokinase  26.8 
 
 		 322 aa  47.4  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0318519  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4546  phosphoribulokinase/uridine kinase  26.95 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.896481 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0113  phosphoribulokinase/uridine kinase  27.69 
 
 		 312 aa  46.6  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1447  phosphoribulokinase/uridine kinase  23.7 
 
 		 325 aa  46.6  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2218  uridine kinase  23.48 
 
 		 212 aa  46.2  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.428302  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0275  phosphoribulokinase/uridine kinase  24.43 
 
 		 321 aa  46.2  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0719547  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1974  uridine kinase  24.24 
 
 		 216 aa  46.2  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.308367  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2617  uridine kinase  25.56 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0576  hypothetical protein  39.44 
 
 		 363 aa  46.2  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0440999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1888  uridine kinase  25.56 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000127737  normal  0.0259304 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1657  uridine kinase  25.56 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0722731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1732  uridine kinase  25.56 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000414727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2244  uridine kinase  24.06 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1762  uridine kinase  25.56 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0067733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2463  uridine kinase  23.48 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000426115  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2456  uridine kinase  25.56 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000511378  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2576  uridine kinase  25.56 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0976754  normal  0.0423229 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2228  uridine kinase  24.81 
 
 		 215 aa  45.8  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02924  uridine kinase  25.42 
 
 		 213 aa  45.1  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0402  MRP protein-like  40.35 
 
 		 358 aa  45.1  0.0008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.277305  normal  0.78996 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl306  uridine kinase  24.26 
 
 		 208 aa  45.1  0.0009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000466982  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0169  phosphoribulokinase  27.69 
 
 		 313 aa  44.7  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0629486  normal  0.335494 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1927  MRP protein-like  38.6 
 
 		 360 aa  44.3  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.789784  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3621  uridine kinase  28.08 
 
 		 219 aa  45.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5982  MRP protein-like protein  46 
 
 		 374 aa  44.3  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.141343  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0560  protein of unknown function DUF59  39.13 
 
 		 362 aa  44.7  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2349  uridine kinase  21.8 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2356  uridine kinase  21.8 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0747859  normal  0.616244 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2249  uridine kinase  21.8 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2463  uridine kinase  21.8 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.92076  normal  0.601786 
 
 
-
 
NC_002950  PG0959  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  34.07 
 
 		 372 aa  44.3  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.152007 
 
 
-
 
NC_002950  PG1781  uridine kinase  23.08 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0052  mrP protein  48.98 
 
 		 361 aa  43.5  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1845  phosphoribulokinase  27.73 
 
 		 311 aa  43.9  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0997041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2047  uridine kinase  26.32 
 
 		 212 aa  44.3  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.20095  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3563  uridine kinase  24.62 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.933791  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2680  uridine kinase  20.45 
 
 		 213 aa  44.3  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.381484 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2453  uridine kinase  22.22 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5025  Mrp protein  46 
 
 		 375 aa  43.5  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.27935 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1435  phosphoribulokinase/uridine kinase  24.58 
 
 		 553 aa  43.9  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3195  uridine kinase  22.22 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0472319  hitchhiker  0.00149984 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4565  MRP protein-like protein  46 
 
 		 378 aa  43.9  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2552  uridine kinase  22.22 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00760  hypothetical protein  38.46 
 
 		 376 aa  43.9  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.161739  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6493  phosphoribulokinase  35.82 
 
 		 290 aa  43.9  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0819827 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5082  MRP protein-like protein  48 
 
 		 373 aa  43.9  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01972  uridine kinase  21.21 
 
 		 213 aa  43.1  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1591  uridine kinase  21.21 
 
 		 213 aa  43.1  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00393606  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1154  hypothetical protein  29.79 
 
 		 313 aa  43.1  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.332851  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1831  protein of unknown function DUF59  31.76 
 
 		 345 aa  43.1  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.203374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3003  uridine kinase  21.21 
 
 		 213 aa  43.1  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.384394 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01961  hypothetical protein  21.21 
 
 		 213 aa  43.1  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1763  phosphoribulokinase/uridine kinase  22.83 
 
 		 559 aa  43.5  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.295373  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0134  phosphoribulokinase/uridine kinase  24.19 
 
 		 558 aa  43.5  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0935  uridine kinase  31.82 
 
 		 215 aa  43.5  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2206  uridine kinase  21.21 
 
 		 213 aa  43.1  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2359  uridine kinase  21.21 
 
 		 213 aa  43.1  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4333  pantothenate kinase  24.87 
 
 		 316 aa  43.5  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000268532  hitchhiker  0.00000000209416 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1576  uridine kinase  26.37 
 
 		 213 aa  43.1  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.435743 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1079  uridine kinase  31.82 
 
 		 215 aa  43.5  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.210616  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1575  uridine kinase  21.21 
 
 		 213 aa  43.1  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0267753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0994  uridine kinase  21.21 
 
 		 213 aa  43.1  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1979  uridine kinase  24.63 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000633687  hitchhiker  0.00165825 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1166  uridine kinase  21.21 
 
 		 213 aa  43.1  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3034  hypothetical protein  23.26 
 
 		 269 aa  43.1  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.615757  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>