28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3621 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_3621  uridine kinase  100 
 
 
219 aa  449  1e-125  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0464  hypothetical protein  29.61 
 
 
231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0478  hypothetical protein  29.61 
 
 
231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.997056  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4433  uridine kinase  30 
 
 
209 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.467538  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2183  uridine kinase  21.61 
 
 
221 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.630907  normal  0.666717 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2828  uridine kinase  24.16 
 
 
223 aa  52.8  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3064  uridine kinase  25 
 
 
223 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3070  uridine kinase  24.14 
 
 
223 aa  52.4  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2856  uridine kinase  24.14 
 
 
223 aa  52.4  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3079  uridine kinase  23.84 
 
 
223 aa  52  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2850  uridine kinase  23.04 
 
 
220 aa  50.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00158944  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2538  phosphoribulokinase / uridine kinase family  20.42 
 
 
222 aa  50.1  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.551598 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2788  uridine kinase  23.78 
 
 
223 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0330  uridine kinase-like  24.34 
 
 
240 aa  48.9  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0269818 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4128  uridine kinase  25.78 
 
 
230 aa  45.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.229142  normal  0.752795 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1431  phosphoribulokinase/uridine kinase  29.23 
 
 
219 aa  46.2  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.2795 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3044  uridine kinase  22.1 
 
 
191 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11578  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2233  uridine kinase  23.12 
 
 
193 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.640057  hitchhiker  0.0000000180687 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3008  uridine kinase  22.83 
 
 
193 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6545  uridine kinase  24.19 
 
 
248 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0840301  normal  0.0502519 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3045  uridine kinase  21.02 
 
 
193 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.215805  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4970  uridine kinase  23.2 
 
 
268 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.552464 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4007  hypothetical protein  22.38 
 
 
180 aa  43.1  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2797  uridine kinase  22.4 
 
 
193 aa  42.7  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00104076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3009  uridine kinase  22.4 
 
 
193 aa  42.7  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0173  uridine kinase-like protein  27.4 
 
 
219 aa  42.4  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2728  uridine kinase  22.87 
 
 
193 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.138669  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2980  uridine kinase  25 
 
 
250 aa  41.6  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000350269 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>