212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A3316 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A3316  putative fructose transport system kinase  100 
 
 		 238 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3249  putative fructose transport system kinase  98.32 
 
 		 238 aa  485  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.545767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4229  putative fructose transport system kinase  73.73 
 
 		 237 aa  372  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3262  putative fructose transport system kinase  73.31 
 
 		 237 aa  368  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.658229  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3069  putative fructose transport system kinase  72.88 
 
 		 237 aa  364  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0292125 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3357  putative fructose transport system kinase  72.34 
 
 		 237 aa  363  2e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0782  putative fructose transport system kinase  69.1 
 
 		 237 aa  343  2e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.311661  normal  0.23532 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02759  hypothetical protein  69.1 
 
 		 237 aa  343  2e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.505091  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0765  putative fructose transport system kinase  69.1 
 
 		 237 aa  343  2e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.297171  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3086  putative fructose transport system kinase  69.1 
 
 		 237 aa  343  2e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.949121  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02722  hypothetical protein  69.1 
 
 		 237 aa  343  2e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.455616  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001416  uridine kinase  42.62 
 
 		 244 aa  217  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.922177  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0502  hypothetical protein  42.64 
 
 		 204 aa  120  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0237  putative fructose transport system kinase  41.8 
 
 		 198 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.719506 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0986  putative fructose transport system kinase  44.04 
 
 		 198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2647  putative fructose transport system kinase  44.04 
 
 		 198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0105  putative fructose transport system kinase  38.05 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5968  putative fructose transport system kinase  35.38 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.682486  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0128  putative fructose transport system kinase  36.14 
 
 		 210 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0371  putative fructose transport system kinase  39.46 
 
 		 207 aa  103  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0129  putative fructose transport system kinase  36.98 
 
 		 210 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0072  putative fructose transport system kinase  35.94 
 
 		 213 aa  99.8  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3839  phosphoribulokinase/uridine kinase  37.63 
 
 		 193 aa  96.3  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0062  putative fructose transport system kinase  34.9 
 
 		 232 aa  94.7  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3564  hypothetical protein  37.69 
 
 		 217 aa  94.7  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3611  putative fructose transport system kinase  37.08 
 
 		 208 aa  94.7  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.66248 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47307  pantothenate kinase-like protein  30.47 
 
 		 240 aa  93.6  2e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.169433 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0642  putative fructose transport system kinase  36.23 
 
 		 237 aa  92.4  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.426606  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2867  putative fructose transport system kinase  35.42 
 
 		 229 aa  92.8  5e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3270  putative fructose transport system kinase  35.68 
 
 		 212 aa  92  8e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587247  normal  0.995863 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0061  putative fructose transport system kinase  34.38 
 
 		 232 aa  91.7  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.484173  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1741  phosphoribulokinase/uridine kinase  33.85 
 
 		 226 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29260  panthothenate kinase  34.98 
 
 		 221 aa  90.9  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1788  phosphoribulokinase/uridine kinase  33.85 
 
 		 226 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3493  phosphoribulokinase/uridine kinase  34.09 
 
 		 208 aa  89.7  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0988  phosphoribulokinase/uridine kinase  33.33 
 
 		 207 aa  89.7  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0166528  normal  0.062689 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1817  hypothetical protein  30.39 
 
 		 215 aa  89.7  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4273  putative fructose transport system kinase  32.5 
 
 		 224 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2550  putative fructose transport system kinase  33.51 
 
 		 219 aa  85.9  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2803  phosphoribulokinase/uridine kinase family protein  32.97 
 
 		 212 aa  85.5  7e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.700623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1238  putative fructose transport system kinase  34.57 
 
 		 210 aa  84.3  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.45072 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_88056  predicted protein  29.96 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6929  hypothetical protein  33.81 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0716  putative fructose transport system kinase  33.51 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1293  hypothetical protein  30.14 
 
 		 226 aa  83.2  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2601  putative fructose transport system kinase  33.86 
 
 		 226 aa  81.6  0.000000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.208404  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2255  hypothetical protein  34.48 
 
 		 216 aa  81.3  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal  0.941975 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2086  putative fructose transport system kinase  32.23 
 
 		 216 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1720  phosphoribulokinase/uridine kinase  33.85 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3768  phosphoribulokinase/uridine kinase  30.85 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05970  hypothetical protein  32.81 
 
 		 215 aa  78.6  0.00000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.413524  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39804  Predicted panthothenate kinase/uridine kinase-related protein  25.46 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0416913 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_15134  predicted protein  33.95 
 
 		 173 aa  77  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4807  putative fructose transport system kinase  32.78 
 
 		 217 aa  77.8  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.969066  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08109  conserved hypothetical protein  26.38 
 
 		 583 aa  75.9  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.401765  normal  0.665757 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0781  hypothetical protein  31.44 
 
 		 213 aa  74.7  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2554  putative fructose transport system kinase  33.33 
 
 		 213 aa  74.7  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.225368  normal  0.62572 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43766  predicted protein  30.56 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4825  putative fructose transport system kinase  30.5 
 
 		 228 aa  73.6  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3554  putative fructose transport system kinase  37.75 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38330  hypothetical protein  30.32 
 
 		 211 aa  72  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.741273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0848  hypothetical protein  32.16 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0294  pantothenate kinase  29.71 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1896  pantothenate kinase  29.71 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2875  pantothenate kinase  22.12 
 
 		 307 aa  65.5  0.0000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04382  kinase-related protein (AFU_orthologue; AFUA_4G06710)  26.15 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.608845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2718  pantothenate kinase  25.87 
 
 		 375 aa  65.1  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203511  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5036  pantothenate kinase  30.53 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3755  hypothetical protein  30.29 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0312  pantothenate kinase  28.93 
 
 		 317 aa  62.4  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07340  pantothenate kinase  30 
 
 		 316 aa  62.4  0.000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.325871 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0895  pantothenate kinase  27.17 
 
 		 329 aa  62.4  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4137  hypothetical protein  30.73 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24358  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23200  pantothenate kinase  26.34 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0786463  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00238  pantothenate kinase  27.33 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0143  pantothenate kinase  26.9 
 
 		 316 aa  59.3  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000477456  normal  0.0338371 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2317  pantothenate kinase  25.2 
 
 		 313 aa  59.3  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0791342  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2606  pantothenate kinase  29.31 
 
 		 315 aa  58.9  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0140  pantothenate kinase  31.21 
 
 		 318 aa  58.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1229  pantothenate kinase  30.57 
 
 		 326 aa  57.8  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.978811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0666  pantothenate kinase  26.53 
 
 		 343 aa  57.4  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.755072  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0120  pantothenate kinase  28.05 
 
 		 318 aa  57  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0935797  normal  0.132558 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0156  pantothenate kinase  25.1 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000580126  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0409  pantothenate kinase  31.21 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0128  pantothenate kinase  28.79 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.814867  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0185  pantothenate kinase  28.19 
 
 		 316 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000128466  hitchhiker  0.000667129 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4071  pantothenate kinase  28.19 
 
 		 316 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.031551  normal  0.150968 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0183  pantothenate kinase  27.66 
 
 		 316 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000066395  normal  0.0569679 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0178  pantothenate kinase  27.66 
 
 		 316 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0139857  normal  0.0123189 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4705  pantothenate kinase  25.59 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000664944  hitchhiker  0.000162185 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4173  pantothenate kinase  28.19 
 
 		 316 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000219645  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0181  pantothenate kinase  28.19 
 
 		 316 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000275629  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4333  pantothenate kinase  24.79 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000268532  hitchhiker  0.00000000209416 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4148  pantothenate kinase  30.2 
 
 		 314 aa  57  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0411  pantothenate kinase  28.79 
 
 		 318 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.41646 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2913  pantothenate kinase  28.02 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.991902  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2610  pantothenate kinase  31.13 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.787423  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0169  pantothenate kinase  24.75 
 
 		 316 aa  56.2  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000325542  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0184  pantothenate kinase  27.13 
 
 		 316 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000868575  normal  0.167512 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1012  pantothenate kinase  30.77 
 
 		 329 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.298454  normal  0.191008 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>