170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0502 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0502  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  396  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2647  putative fructose transport system kinase  52.91 
 
 		 198 aa  176  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0986  putative fructose transport system kinase  52.91 
 
 		 198 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0237  putative fructose transport system kinase  54.7 
 
 		 198 aa  175  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.719506 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0371  putative fructose transport system kinase  51.79 
 
 		 207 aa  174  6e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3564  hypothetical protein  51.58 
 
 		 217 aa  166  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0062  putative fructose transport system kinase  48.74 
 
 		 232 aa  165  4e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0072  putative fructose transport system kinase  47.74 
 
 		 213 aa  165  4e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0061  putative fructose transport system kinase  48.24 
 
 		 232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.484173  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5968  putative fructose transport system kinase  46.27 
 
 		 211 aa  155  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.682486  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3611  putative fructose transport system kinase  53.8 
 
 		 208 aa  149  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.66248 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0642  putative fructose transport system kinase  50.28 
 
 		 237 aa  148  4e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.426606  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0128  putative fructose transport system kinase  44.44 
 
 		 210 aa  148  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0105  putative fructose transport system kinase  44.78 
 
 		 206 aa  148  5e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0129  putative fructose transport system kinase  43.94 
 
 		 210 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0988  phosphoribulokinase/uridine kinase  47.03 
 
 		 207 aa  138  7e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0166528  normal  0.062689 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2554  putative fructose transport system kinase  48.91 
 
 		 213 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.225368  normal  0.62572 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29260  panthothenate kinase  47.59 
 
 		 221 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3755  hypothetical protein  47.67 
 
 		 210 aa  128  5.0000000000000004e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0716  putative fructose transport system kinase  45.9 
 
 		 213 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436559  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2255  hypothetical protein  43.94 
 
 		 216 aa  125  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal  0.941975 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38330  hypothetical protein  43.96 
 
 		 211 aa  125  6e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.741273  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3554  putative fructose transport system kinase  44.57 
 
 		 205 aa  124  9e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3249  putative fructose transport system kinase  43.65 
 
 		 238 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.545767  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2601  putative fructose transport system kinase  50 
 
 		 226 aa  123  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.208404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05970  hypothetical protein  44.74 
 
 		 215 aa  122  3e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.413524  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4807  putative fructose transport system kinase  48.72 
 
 		 217 aa  122  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.969066  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2867  putative fructose transport system kinase  48.22 
 
 		 229 aa  121  7e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3493  phosphoribulokinase/uridine kinase  44.94 
 
 		 208 aa  121  7e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3316  putative fructose transport system kinase  42.64 
 
 		 238 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4137  hypothetical protein  48.13 
 
 		 215 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24358  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1238  putative fructose transport system kinase  44.15 
 
 		 210 aa  114  8.999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.45072 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3839  phosphoribulokinase/uridine kinase  45.08 
 
 		 193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6929  hypothetical protein  44.28 
 
 		 211 aa  112  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1741  phosphoribulokinase/uridine kinase  43.82 
 
 		 226 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1788  phosphoribulokinase/uridine kinase  43.82 
 
 		 226 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3270  putative fructose transport system kinase  42.53 
 
 		 212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587247  normal  0.995863 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4229  putative fructose transport system kinase  38.89 
 
 		 237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_88056  predicted protein  38.83 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2550  putative fructose transport system kinase  40.8 
 
 		 219 aa  109  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3357  putative fructose transport system kinase  39.39 
 
 		 237 aa  109  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1817  hypothetical protein  40.64 
 
 		 215 aa  108  7.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02759  hypothetical protein  39 
 
 		 237 aa  106  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.505091  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0765  putative fructose transport system kinase  39 
 
 		 237 aa  106  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.297171  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02722  hypothetical protein  39 
 
 		 237 aa  106  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.455616  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3086  putative fructose transport system kinase  39 
 
 		 237 aa  106  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.949121  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0782  putative fructose transport system kinase  39 
 
 		 237 aa  106  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.311661  normal  0.23532 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3262  putative fructose transport system kinase  39.7 
 
 		 237 aa  106  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.658229  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3069  putative fructose transport system kinase  38.38 
 
 		 237 aa  104  7e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0292125 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0781  hypothetical protein  41.67 
 
 		 213 aa  104  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2086  putative fructose transport system kinase  40.31 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4825  putative fructose transport system kinase  41.55 
 
 		 228 aa  102  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2803  phosphoribulokinase/uridine kinase family protein  37.23 
 
 		 212 aa  102  5e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.700623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47307  pantothenate kinase-like protein  34.52 
 
 		 240 aa  101  8e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.169433 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3768  phosphoribulokinase/uridine kinase  40.54 
 
 		 199 aa  100  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1720  phosphoribulokinase/uridine kinase  43.26 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4273  putative fructose transport system kinase  38.83 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1293  hypothetical protein  35.71 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001416  uridine kinase  33.82 
 
 		 244 aa  96.7  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.922177  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43766  predicted protein  35.98 
 
 		 240 aa  89.4  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39804  Predicted panthothenate kinase/uridine kinase-related protein  32.02 
 
 		 229 aa  87.4  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0416913 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08109  conserved hypothetical protein  33.16 
 
 		 583 aa  85.1  6e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.401765  normal  0.665757 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04382  kinase-related protein (AFU_orthologue; AFUA_4G06710)  31.03 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.608845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0848  hypothetical protein  41.84 
 
 		 212 aa  81.3  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_15134  predicted protein  32.5 
 
 		 173 aa  77  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM02590  conserved hypothetical protein  31.71 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.162258  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2721  pantothenate kinase  32.75 
 
 		 320 aa  58.2  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0606  pantothenate kinase  27.72 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.582007  normal  0.380558 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0269  pantothenate kinase  26.63 
 
 		 316 aa  55.1  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000212467  normal  0.0135399 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2610  pantothenate kinase  28.83 
 
 		 314 aa  54.7  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.787423  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1603  pantothenate kinase  26.77 
 
 		 229 aa  54.7  0.0000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07340  pantothenate kinase  31.65 
 
 		 316 aa  53.5  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.325871 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2058  pantothenate kinase  28.25 
 
 		 312 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0682645 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3870  pantothenate kinase  26.63 
 
 		 316 aa  53.9  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000776602  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3395  pantothenate kinase  26.63 
 
 		 316 aa  53.9  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0824651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0328  pantothenate kinase  26.63 
 
 		 316 aa  53.9  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.126944  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2606  pantothenate kinase  28.79 
 
 		 315 aa  53.1  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1012  pantothenate kinase  30.06 
 
 		 329 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.298454  normal  0.191008 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0241  pantothenate kinase  25.29 
 
 		 330 aa  53.1  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.557377  normal  0.720192 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3894  pantothenate kinase  26.01 
 
 		 316 aa  52.4  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0154939  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4658  pantothenate kinase  28.12 
 
 		 312 aa  52  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00324704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2317  pantothenate kinase  25.27 
 
 		 313 aa  51.2  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0791342  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3739  pantothenate kinase  25.54 
 
 		 316 aa  50.8  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000067417  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0851  pantothenate kinase  22.73 
 
 		 306 aa  50.8  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00289921  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23200  pantothenate kinase  27.84 
 
 		 318 aa  51.2  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0786463  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4148  pantothenate kinase  26.67 
 
 		 314 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3064  uridine kinase  26.51 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4469  pantothenate kinase  27.17 
 
 		 316 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00581383  hitchhiker  0.00102546 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4472  pantothenate kinase  27.17 
 
 		 316 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000380876  hitchhiker  0.0000000000000312054 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4547  pantothenate kinase  27.17 
 
 		 316 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000536563  hitchhiker  0.0000000000433914 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4382  pantothenate kinase  27.17 
 
 		 316 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000000669891  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_68496  predicted protein  25.79 
 
 		 244 aa  50.4  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0633704 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2718  pantothenate kinase  26.74 
 
 		 375 aa  50.4  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203511  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4350  pantothenate kinase  27.17 
 
 		 316 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000140084  normal  0.823568 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3563  uridine kinase  26.62 
 
 		 213 aa  49.3  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.933791  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4274  pantothenate kinase  25.93 
 
 		 312 aa  49.3  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.2268  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0339  uridine kinase  24.84 
 
 		 207 aa  48.9  0.00005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4128  uridine kinase  31.55 
 
 		 230 aa  48.9  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.229142  normal  0.752795 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1229  pantothenate kinase  27.44 
 
 		 326 aa  48.9  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.978811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29310  pantothenate kinase  28.14 
 
 		 316 aa  48.5  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>