186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4825 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4825  putative fructose transport system kinase  100 
 
 
228 aa  450  1.0000000000000001e-126  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2086  putative fructose transport system kinase  58.6 
 
 
216 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4273  putative fructose transport system kinase  57.41 
 
 
224 aa  230  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0716  putative fructose transport system kinase  53.62 
 
 
213 aa  193  2e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436559  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3839  phosphoribulokinase/uridine kinase  55.26 
 
 
193 aa  189  4e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3554  putative fructose transport system kinase  52.91 
 
 
205 aa  186  3e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2550  putative fructose transport system kinase  47.72 
 
 
219 aa  180  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38330  hypothetical protein  50.72 
 
 
211 aa  179  4e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.741273  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4807  putative fructose transport system kinase  49.75 
 
 
217 aa  176  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.969066  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3270  putative fructose transport system kinase  47.76 
 
 
212 aa  176  4e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587247  normal  0.995863 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6929  hypothetical protein  47.32 
 
 
211 aa  172  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29260  panthothenate kinase  50 
 
 
221 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0988  phosphoribulokinase/uridine kinase  47.14 
 
 
207 aa  172  3.9999999999999995e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0166528  normal  0.062689 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1817  hypothetical protein  46.81 
 
 
215 aa  170  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1741  phosphoribulokinase/uridine kinase  47.62 
 
 
226 aa  168  8e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1788  phosphoribulokinase/uridine kinase  47.62 
 
 
226 aa  168  8e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05970  hypothetical protein  51.31 
 
 
215 aa  167  1e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.413524  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2554  putative fructose transport system kinase  49.01 
 
 
213 aa  165  4e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.225368  normal  0.62572 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2601  putative fructose transport system kinase  48.24 
 
 
226 aa  158  6e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.208404  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3611  putative fructose transport system kinase  51.63 
 
 
208 aa  158  6e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.66248 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2255  hypothetical protein  44.68 
 
 
216 aa  155  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal  0.941975 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3755  hypothetical protein  46.34 
 
 
210 aa  155  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3493  phosphoribulokinase/uridine kinase  50.28 
 
 
208 aa  155  4e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4137  hypothetical protein  47.92 
 
 
215 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24358  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0781  hypothetical protein  47.64 
 
 
213 aa  154  9e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1238  putative fructose transport system kinase  49.49 
 
 
210 aa  153  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.45072 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2867  putative fructose transport system kinase  47.52 
 
 
229 aa  149  3e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1720  phosphoribulokinase/uridine kinase  47.34 
 
 
226 aa  148  6e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3768  phosphoribulokinase/uridine kinase  45.74 
 
 
199 aa  147  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0062  putative fructose transport system kinase  43.81 
 
 
232 aa  140  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0061  putative fructose transport system kinase  43.81 
 
 
232 aa  140  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.484173  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0072  putative fructose transport system kinase  43.81 
 
 
213 aa  138  6e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0848  hypothetical protein  47.28 
 
 
212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3564  hypothetical protein  42.63 
 
 
217 aa  124  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5968  putative fructose transport system kinase  38.54 
 
 
211 aa  119  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.682486  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39804  Predicted panthothenate kinase/uridine kinase-related protein  35.8 
 
 
229 aa  116  3e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0416913 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0105  putative fructose transport system kinase  38.02 
 
 
206 aa  112  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0128  putative fructose transport system kinase  38.97 
 
 
210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496094  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0986  putative fructose transport system kinase  38.5 
 
 
198 aa  106  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0502  hypothetical protein  41.55 
 
 
204 aa  105  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1293  hypothetical protein  34.16 
 
 
226 aa  105  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2647  putative fructose transport system kinase  38 
 
 
198 aa  105  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0129  putative fructose transport system kinase  37.23 
 
 
210 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0642  putative fructose transport system kinase  36.49 
 
 
237 aa  103  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.426606  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47307  pantothenate kinase-like protein  34.97 
 
 
240 aa  102  4e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.169433 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0371  putative fructose transport system kinase  40.64 
 
 
207 aa  102  6e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0237  putative fructose transport system kinase  38.38 
 
 
198 aa  94.7  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.719506 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04382  kinase-related protein (AFU_orthologue; AFUA_4G06710)  31.46 
 
 
234 aa  92.4  5e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.608845  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2803  phosphoribulokinase/uridine kinase family protein  33.7 
 
 
212 aa  92.4  5e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.700623  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_88056  predicted protein  31.8 
 
 
261 aa  87.4  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3316  putative fructose transport system kinase  31 
 
 
238 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43766  predicted protein  31.46 
 
 
240 aa  80.5  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08109  conserved hypothetical protein  28.97 
 
 
583 aa  79.7  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.401765  normal  0.665757 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3249  putative fructose transport system kinase  30.5 
 
 
238 aa  79.7  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.545767  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001416  uridine kinase  29.56 
 
 
244 aa  79  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.922177  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_15134  predicted protein  30.54 
 
 
173 aa  78.6  0.00000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02759  hypothetical protein  29.52 
 
 
237 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.505091  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0765  putative fructose transport system kinase  29.52 
 
 
237 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.297171  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0782  putative fructose transport system kinase  29.52 
 
 
237 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.311661  normal  0.23532 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3086  putative fructose transport system kinase  29.52 
 
 
237 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.949121  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02722  hypothetical protein  29.52 
 
 
237 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.455616  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM02590  conserved hypothetical protein  31.12 
 
 
230 aa  72.4  0.000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.162258  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4229  putative fructose transport system kinase  30.26 
 
 
237 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3262  putative fructose transport system kinase  28.87 
 
 
237 aa  65.1  0.0000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.658229  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3357  putative fructose transport system kinase  29.23 
 
 
237 aa  64.7  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3069  putative fructose transport system kinase  28.35 
 
 
237 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0292125 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1674  pantothenate kinase  32.91 
 
 
283 aa  58.5  0.00000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0576097 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2777  pantothenate kinase  37.5 
 
 
337 aa  57  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.518302  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2554  pantothenate kinase  37.5 
 
 
337 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.369959  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2485  pantothenate kinase  37.5 
 
 
337 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0196612 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6788  pantothenate kinase  43.42 
 
 
335 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.124263  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1619  pantothenate kinase  36.36 
 
 
307 aa  55.1  0.0000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7527  pantothenate kinase  43.42 
 
 
336 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3100  pantothenate kinase  36.71 
 
 
345 aa  53.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29310  pantothenate kinase  27.78 
 
 
316 aa  53.5  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2622  pantothenate kinase  31.25 
 
 
331 aa  53.5  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.345143 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1263  pantothenate kinase  38.16 
 
 
314 aa  52.8  0.000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0666  pantothenate kinase  33.75 
 
 
343 aa  52.4  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.755072  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1012  pantothenate kinase  37.5 
 
 
329 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.298454  normal  0.191008 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0982  pantothenate kinase  34.21 
 
 
330 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  0.0147256 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2913  pantothenate kinase  35 
 
 
305 aa  51.6  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.991902  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2606  pantothenate kinase  31.03 
 
 
315 aa  50.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0951  pantothenate kinase  29.46 
 
 
306 aa  49.7  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0633227  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1603  pantothenate kinase  23.21 
 
 
229 aa  50.1  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0895  pantothenate kinase  31.3 
 
 
329 aa  50.1  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2275  pantothenate kinase  39.47 
 
 
319 aa  49.7  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.336012  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1533  pantothenate kinase  30.36 
 
 
306 aa  49.7  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00065793  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0622  pantothenate kinase  33.65 
 
 
324 aa  49.7  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01170  pantothenate kinase  28.21 
 
 
310 aa  49.7  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0143  pantothenate kinase  37.35 
 
 
316 aa  49.3  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000477456  normal  0.0338371 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2287  pantothenate kinase  40.24 
 
 
323 aa  48.9  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.415075 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0120  pantothenate kinase  34.65 
 
 
318 aa  48.9  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0935797  normal  0.132558 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0494  kinase-like  33.66 
 
 
371 aa  48.5  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1576  ArgK protein  55.32 
 
 
320 aa  48.5  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000113447  normal  0.451299 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0039  pantothenate kinase  34.69 
 
 
330 aa  48.1  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0723  pantothenate kinase  31.03 
 
 
328 aa  47.8  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_004310  BR2087  pantothenate kinase  36.84 
 
 
322 aa  47.4  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.222061  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0312  pantothenate kinase  36.84 
 
 
317 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0294  pantothenate kinase  35.53 
 
 
318 aa  47.8  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16790  pantothenate kinase  31.73 
 
 
336 aa  47.4  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>