222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1576 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1576  ArgK protein  100 
 
 		 320 aa  645    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000113447  normal  0.451299 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1579  LAO/AO transport system ATPase  83.33 
 
 		 319 aa  531  1e-150  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2027  LAO/AO transport system ATPase  78.21 
 
 		 316 aa  508  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00170815  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1549  LAO/AO transport system ATPase  71.06 
 
 		 314 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000360873 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2690  LAO/AO transport system ATPase  70.74 
 
 		 314 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249774  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0389  LAO/AO transport system ATPase  64.19 
 
 		 317 aa  402  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000146012  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1281  LAO/AO transport system ATPase  57.78 
 
 		 317 aa  355  3.9999999999999996e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.417761  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2160  LAO/AO transport system ATPase  54.22 
 
 		 341 aa  337  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.104519 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2209  LAO/AO transport system ATPase  52.38 
 
 		 344 aa  335  5.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.249756  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2297  LAO/AO transport system ATPase  52.38 
 
 		 344 aa  333  2e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.413391  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1649  LAO/AO transport system ATPase  51.79 
 
 		 344 aa  329  5.0000000000000004e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.840992  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3772  LAO/AO transport system ATPase  56.13 
 
 		 318 aa  318  7e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.339101 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0456  LAO/AO transport system ATPase  49.03 
 
 		 325 aa  304  2.0000000000000002e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.614853 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1853  LAO/AO transport system ATPase  47.59 
 
 		 309 aa  296  3e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1911  LAO/AO transport system ATPase  46.56 
 
 		 318 aa  293  3e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0463697  normal  0.161513 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1260  LAO/AO transport system ATPase  49.03 
 
 		 319 aa  292  4e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2025  LAO/AO transport system ATPase  48.05 
 
 		 312 aa  291  1e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82524  decreased coverage  0.000989669 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2365  LAO/AO transport system ATPase  48.86 
 
 		 318 aa  288  8e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1674  LAO/AO transport system ATPase  48.56 
 
 		 312 aa  288  9e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1770  LAO/AO transport system ATPase  44.09 
 
 		 322 aa  282  5.000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292624  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0358  LAO/AO transport system ATPase  47.12 
 
 		 318 aa  279  5e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2999  LAO/AO transport system ATPase  48.05 
 
 		 316 aa  276  4e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0943  LAO/AO transport system ATPase  46.3 
 
 		 314 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2170  LAO/AO transport system ATPase  50 
 
 		 341 aa  270  2e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300615  normal  0.661007 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3988  LAO/AO transport system ATPase  46.77 
 
 		 324 aa  270  2e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138367  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2806  LAO/AO transport system ATPase  46.62 
 
 		 326 aa  269  4e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0864794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1045  LAO/AO transport system ATPase  47.9 
 
 		 356 aa  267  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.172221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3609  LAO/AO transport system ATPase  44.41 
 
 		 345 aa  267  2e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0511  LAO/AO transport system ATPase  44.15 
 
 		 378 aa  264  1e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2473  LAO/AO transport system ATPase  42.77 
 
 		 375 aa  264  2e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4359  LAO/AO transport system ATPase  43.73 
 
 		 364 aa  263  3e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.460456  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1798  LAO/AO transport system ATPase  46.13 
 
 		 323 aa  263  4e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3990  LAO/AO transport system ATPase  43.91 
 
 		 329 aa  262  6.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0586  LAO/AO transport system ATPase  49.43 
 
 		 310 aa  259  6e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.585715  normal  0.982729 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3108  LAO/AO transport system ATPase  48.89 
 
 		 304 aa  258  1e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0453606 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4110  LAO/AO transport system ATPase  45.51 
 
 		 316 aa  257  2e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.162136  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5020  LAO/AO transport system ATPase  46.95 
 
 		 332 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0899  LAO/AO transport system ATPase  42.94 
 
 		 357 aa  254  2.0000000000000002e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2130  LAO/AO transport system ATPase  46.75 
 
 		 327 aa  251  1e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5998  LAO/AO transport system ATPase  49 
 
 		 307 aa  250  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0515982 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3009  LAO/AO transport system ATPase  47.41 
 
 		 308 aa  249  4e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.072512 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4647  LAO/AO transport system ATPase  43.83 
 
 		 325 aa  248  7e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0480374  normal  0.487392 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5042  LAO/AO transport system ATPase  55.19 
 
 		 329 aa  248  9e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2533  LAO/AO transport system ATPase  44.48 
 
 		 316 aa  247  1e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.227946  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1698  LAO/AO transport system ATPase  43.87 
 
 		 322 aa  246  4.9999999999999997e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238616  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2690  LAO/AO transport system ATPase  43.12 
 
 		 321 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1268  LAO/AO transport system ATPase  40.73 
 
 		 312 aa  244  1.9999999999999999e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2210  ArgK protein  41.31 
 
 		 330 aa  238  9e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000516978  normal  0.0100138 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3656  LAO/AO transport system ATPase  45.25 
 
 		 323 aa  236  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.959092  normal  0.164513 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0540  putative transport system kinase  42.54 
 
 		 327 aa  235  8e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.167721  hitchhiker  0.00219183 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0673  LAO/AO transport system ATPase  45.55 
 
 		 340 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5087  LAO/AO transport system ATPase  44.63 
 
 		 333 aa  232  6e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3103  LAO/AO transport system ATPase  48.98 
 
 		 335 aa  229  5e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0011081  hitchhiker  0.0000652797 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0801  LAO/AO transport system ATPase  51.37 
 
 		 299 aa  224  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3795  LAO/AO transport system ATPase  44.67 
 
 		 290 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.203827  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3868  LAO/AO transport system ATPase  44.67 
 
 		 290 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.119113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3799  LAO/AO transport system ATPase  44.67 
 
 		 290 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.205117  normal  0.899663 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1321  LAO/AO transport system ATPase  41.52 
 
 		 312 aa  218  1e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4301  LAO/AO transport system ATPase  47.89 
 
 		 292 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.635078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0581  LAO/AO transport system ATPase  39.39 
 
 		 292 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.730832  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4250  LAO/AO transport system ATPase  45.49 
 
 		 322 aa  211  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0512  LAO/AO transport system ATPase  44.08 
 
 		 300 aa  208  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0153  LAO/AO transport system ATPase  41.28 
 
 		 296 aa  207  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.677625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1613  LAO/AO transport system ATPase  41 
 
 		 312 aa  206  4e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.375817 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2397  LAO/AO transport system ATPase  51.74 
 
 		 303 aa  206  5e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.73846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2056  LAO/AO transport system ATPase  38.6 
 
 		 314 aa  206  6e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0080  LAO/AO transport system ATPase  36.77 
 
 		 315 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1360  LAO/AO transport system ATPase  35.64 
 
 		 316 aa  199  3.9999999999999996e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000000108838  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1780  LAO/AO transport system ATPase  57.37 
 
 		 321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05690  arginine/ornithine transport system ATPase  36.88 
 
 		 333 aa  195  7e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2763  arginine/ornithine transport system ATPase  38.83 
 
 		 332 aa  194  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0551  ArgK protein  36.15 
 
 		 310 aa  193  4e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5546  LAO/AO transport system ATPase  42.29 
 
 		 372 aa  187  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1705  arginine/ornithine transport system ATPase  37.28 
 
 		 346 aa  186  4e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.476262  normal  0.0539762 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2490  arginine/ornithine transport system ATPase  37.58 
 
 		 328 aa  186  6e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4372  LAO/AO transport system ATPase  36.62 
 
 		 329 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3340  arginine/ornithine transport system ATPase  37.84 
 
 		 331 aa  182  6e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3245  arginine/ornithine transport system ATPase  37.84 
 
 		 331 aa  182  6e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0792  arginine/ornithine transport system ATPase  37.84 
 
 		 331 aa  182  6e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02749  arginine/ornithine transport system ATPase  37.84 
 
 		 331 aa  182  7e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0775  LAO/AO transport system ATPase  37.84 
 
 		 331 aa  182  7e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02712  hypothetical protein  37.84 
 
 		 331 aa  182  7e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3076  arginine/ornithine transport system ATPase  37.84 
 
 		 331 aa  182  7e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4214  arginine/ornithine transport system ATPase  37.84 
 
 		 331 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3054  arginine/ornithine transport system ATPase  38.22 
 
 		 331 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11526  arginine/ornithine transport system ATPase  38.32 
 
 		 334 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.139624 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0955  LAO/AO transport system ATPase  33.33 
 
 		 305 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0032483 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3480  arginine/ornithine transport system ATPase  36.04 
 
 		 328 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.46606  normal  0.0872871 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3004  arginine/ornithine transport system ATPase  38.62 
 
 		 364 aa  179  7e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.487769  normal  0.192606 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22160  LAO/AO transport system ATPase  38.85 
 
 		 330 aa  178  8e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.436585 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2504  LAO/AO transport system ATPase  38.06 
 
 		 329 aa  179  8e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000648266  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1945  arginine/ornithine transport system ATPase  38.01 
 
 		 332 aa  178  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.522383 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2478  arginine/ornithine transport system ATPase  36.81 
 
 		 333 aa  178  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.341293  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0374  arginine/ornithine transport system ATPase  38.98 
 
 		 329 aa  178  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3189  arginine/ornithine transport system ATPase  38.21 
 
 		 322 aa  176  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306084  normal  0.363793 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3121  arginine/ornithine transport system ATPase  38.01 
 
 		 325 aa  176  6e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3182  arginine/ornithine transport system ATPase  38.01 
 
 		 325 aa  176  6e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.968151  normal  0.139966 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1322  arginine/ornithine transport system ATPase  35.67 
 
 		 351 aa  175  7e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.822906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3132  arginine/ornithine transport system ATPase  38.01 
 
 		 325 aa  176  7e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.151852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2421  LAO/AO transport system ATPase  33.99 
 
 		 343 aa  175  9e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>