160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2550 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2550  putative fructose transport system kinase  100 
 
 		 219 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3270  putative fructose transport system kinase  72.82 
 
 		 212 aa  312  1.9999999999999998e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587247  normal  0.995863 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4807  putative fructose transport system kinase  61.19 
 
 		 217 aa  248  7e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.969066  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1238  putative fructose transport system kinase  61.05 
 
 		 210 aa  231  5e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.45072 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0716  putative fructose transport system kinase  57.14 
 
 		 213 aa  217  8.999999999999998e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0781  hypothetical protein  58.42 
 
 		 213 aa  207  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2601  putative fructose transport system kinase  51.27 
 
 		 226 aa  203  2e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.208404  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2554  putative fructose transport system kinase  53.5 
 
 		 213 aa  201  9e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.225368  normal  0.62572 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38330  hypothetical protein  49.75 
 
 		 211 aa  197  9e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.741273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0988  phosphoribulokinase/uridine kinase  54.64 
 
 		 207 aa  194  6e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0166528  normal  0.062689 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29260  panthothenate kinase  55.43 
 
 		 221 aa  193  2e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2867  putative fructose transport system kinase  50 
 
 		 229 aa  186  3e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05970  hypothetical protein  47.85 
 
 		 215 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.413524  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3611  putative fructose transport system kinase  52.46 
 
 		 208 aa  182  3e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.66248 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4137  hypothetical protein  52.75 
 
 		 215 aa  181  7e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24358  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3493  phosphoribulokinase/uridine kinase  49.74 
 
 		 208 aa  179  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3554  putative fructose transport system kinase  47.57 
 
 		 205 aa  177  7e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6929  hypothetical protein  48.47 
 
 		 211 aa  175  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3755  hypothetical protein  50 
 
 		 210 aa  174  8e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4825  putative fructose transport system kinase  47.72 
 
 		 228 aa  169  3e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1741  phosphoribulokinase/uridine kinase  46.96 
 
 		 226 aa  169  4e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1788  phosphoribulokinase/uridine kinase  46.96 
 
 		 226 aa  169  4e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2086  putative fructose transport system kinase  46.52 
 
 		 216 aa  165  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3839  phosphoribulokinase/uridine kinase  47.28 
 
 		 193 aa  164  6.9999999999999995e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1817  hypothetical protein  45.86 
 
 		 215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3768  phosphoribulokinase/uridine kinase  50 
 
 		 199 aa  161  6e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2255  hypothetical protein  45.25 
 
 		 216 aa  160  9e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal  0.941975 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4273  putative fructose transport system kinase  46.96 
 
 		 224 aa  159  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1720  phosphoribulokinase/uridine kinase  47.8 
 
 		 226 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0062  putative fructose transport system kinase  41.5 
 
 		 232 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0061  putative fructose transport system kinase  41.5 
 
 		 232 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.484173  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0072  putative fructose transport system kinase  39.5 
 
 		 213 aa  132  6e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0642  putative fructose transport system kinase  39.05 
 
 		 237 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.426606  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1293  hypothetical protein  34.98 
 
 		 226 aa  125  7e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0986  putative fructose transport system kinase  42.53 
 
 		 198 aa  123  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2647  putative fructose transport system kinase  42.53 
 
 		 198 aa  123  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0128  putative fructose transport system kinase  40.34 
 
 		 210 aa  122  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0848  hypothetical protein  42.7 
 
 		 212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0129  putative fructose transport system kinase  38.64 
 
 		 210 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0237  putative fructose transport system kinase  39.2 
 
 		 198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.719506 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5968  putative fructose transport system kinase  36.76 
 
 		 211 aa  112  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.682486  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04382  kinase-related protein (AFU_orthologue; AFUA_4G06710)  35.43 
 
 		 234 aa  112  4.0000000000000004e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.608845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0105  putative fructose transport system kinase  38.25 
 
 		 206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39804  Predicted panthothenate kinase/uridine kinase-related protein  33.18 
 
 		 229 aa  112  6e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0416913 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0371  putative fructose transport system kinase  40.74 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3564  hypothetical protein  35.6 
 
 		 217 aa  109  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0502  hypothetical protein  40.8 
 
 		 204 aa  109  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47307  pantothenate kinase-like protein  31.89 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.169433 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2803  phosphoribulokinase/uridine kinase family protein  35.2 
 
 		 212 aa  106  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.700623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_88056  predicted protein  33.33 
 
 		 261 aa  101  8e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02759  hypothetical protein  34.86 
 
 		 237 aa  94  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.505091  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0765  putative fructose transport system kinase  34.86 
 
 		 237 aa  94  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.297171  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3086  putative fructose transport system kinase  34.86 
 
 		 237 aa  94  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.949121  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02722  hypothetical protein  34.86 
 
 		 237 aa  94  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.455616  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0782  putative fructose transport system kinase  34.86 
 
 		 237 aa  94  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.311661  normal  0.23532 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3357  putative fructose transport system kinase  33.68 
 
 		 237 aa  92  6e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4229  putative fructose transport system kinase  32.63 
 
 		 237 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3262  putative fructose transport system kinase  33.16 
 
 		 237 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.658229  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08109  conserved hypothetical protein  33.02 
 
 		 583 aa  89  5e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.401765  normal  0.665757 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3069  putative fructose transport system kinase  32.63 
 
 		 237 aa  88.2  9e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0292125 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3249  putative fructose transport system kinase  33.51 
 
 		 238 aa  86.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.545767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3316  putative fructose transport system kinase  33.51 
 
 		 238 aa  85.9  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_15134  predicted protein  30 
 
 		 173 aa  80.1  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001416  uridine kinase  27.03 
 
 		 244 aa  77  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.922177  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43766  predicted protein  29.02 
 
 		 240 aa  76.3  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM02590  conserved hypothetical protein  27.84 
 
 		 230 aa  74.3  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.162258  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4658  pantothenate kinase  31.39 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00324704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6788  pantothenate kinase  27.23 
 
 		 335 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.124263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1619  pantothenate kinase  30.77 
 
 		 307 aa  55.5  0.0000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2058  pantothenate kinase  29.93 
 
 		 312 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0682645 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29310  pantothenate kinase  28.35 
 
 		 316 aa  54.3  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7527  pantothenate kinase  31.86 
 
 		 336 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1896  pantothenate kinase  30.6 
 
 		 318 aa  53.1  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0294  pantothenate kinase  30.6 
 
 		 318 aa  53.1  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2275  pantothenate kinase  31.67 
 
 		 319 aa  52.8  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.336012  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0143  pantothenate kinase  29.12 
 
 		 316 aa  52.8  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000477456  normal  0.0338371 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0723  pantothenate kinase  32.2 
 
 		 328 aa  51.2  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0982  pantothenate kinase  29.2 
 
 		 330 aa  50.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  0.0147256 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0494  kinase-like  31 
 
 		 371 aa  49.7  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11113  pantothenate kinase  29.93 
 
 		 312 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.4585e-60  normal  0.287343 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2777  pantothenate kinase  32.46 
 
 		 337 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.518302  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3132  pantothenate kinase  29.71 
 
 		 307 aa  48.1  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.335211  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2485  pantothenate kinase  29.2 
 
 		 337 aa  48.1  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0196612 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2718  pantothenate kinase  27.65 
 
 		 375 aa  48.1  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203511  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1533  pantothenate kinase  26.87 
 
 		 306 aa  48.1  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00065793  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0198  pantothenate kinase  27.08 
 
 		 315 aa  48.1  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000383572  hitchhiker  0.000766195 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2547  pantothenate kinase  27.1 
 
 		 358 aa  48.1  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1067  dephospho-CoA kinase  23.81 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2554  pantothenate kinase  29.2 
 
 		 337 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.369959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3499  pantothenate kinase  24.59 
 
 		 330 aa  47  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4333  pantothenate kinase  27.87 
 
 		 316 aa  47.4  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000268532  hitchhiker  0.00000000209416 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07340  pantothenate kinase  31.93 
 
 		 316 aa  47.4  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.325871 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1012  pantothenate kinase  32.2 
 
 		 329 aa  47  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.298454  normal  0.191008 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4705  pantothenate kinase  28.73 
 
 		 316 aa  47  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000664944  hitchhiker  0.000162185 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3894  pantothenate kinase  25.31 
 
 		 316 aa  46.6  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0154939  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4133  pantothenate kinase  28.47 
 
 		 312 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.476027  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4208  pantothenate kinase  28.47 
 
 		 312 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10701  uridine kinase  29.46 
 
 		 202 aa  46.6  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0555332 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4364  pantothenate kinase  28.47 
 
 		 312 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.594897 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1603  pantothenate kinase  24.42 
 
 		 229 aa  46.2  0.0004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>