92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_10701 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008819  NATL1_10701  uridine kinase  100 
 
 
202 aa  404  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0555332 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0388  uridine kinase  77.11 
 
 
204 aa  312  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00997727  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10701  ATP/GTP-binding motif-containing protein  37.65 
 
 
198 aa  98.6  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.201971  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0995  uridine kinase  37.63 
 
 
197 aa  94.4  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0443185  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10701  ATP/GTP-binding motif-containing protein  37.06 
 
 
198 aa  94.4  1e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10681  ATP/GTP-binding motif-containing protein  35.48 
 
 
201 aa  77.4  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.265902  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1820  uridine kinase  31.95 
 
 
232 aa  62.4  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1819  uridine kinase  31.95 
 
 
232 aa  62  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3054  uridine kinase  29.52 
 
 
201 aa  61.6  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.654412  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0044  uridine kinase  24.63 
 
 
211 aa  61.2  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1576  uridine kinase  30.36 
 
 
213 aa  58.5  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.435743 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0202  uridine kinase  26.42 
 
 
204 aa  57.4  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2453  uridine kinase  29.17 
 
 
213 aa  56.6  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2552  uridine kinase  29.17 
 
 
213 aa  56.6  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81319  uridine kinase  28.91 
 
 
504 aa  57.4  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0146953  normal  0.484619 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3195  uridine kinase  29.17 
 
 
213 aa  56.6  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0472319  hitchhiker  0.00149984 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1575  uridine kinase  31.76 
 
 
211 aa  57  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0823  uridine kinase  27.45 
 
 
219 aa  57  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1330  uridine kinase  25.81 
 
 
212 aa  56.6  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.60785 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00730  uridine kinase  28.66 
 
 
207 aa  56.2  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0558456  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2047  uridine kinase  31.18 
 
 
212 aa  56.2  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.20095  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21220  uridine kinase  27.33 
 
 
354 aa  55.8  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2680  uridine kinase  27.98 
 
 
213 aa  55.1  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.381484 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3042  uridine kinase  29.94 
 
 
213 aa  55.1  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1289  uridine kinase  29.94 
 
 
213 aa  54.7  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.731499  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0935  uridine kinase  29.34 
 
 
215 aa  54.3  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08140  uridine kinase  26.28 
 
 
223 aa  53.9  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.982733  normal  0.431984 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1079  uridine kinase  29.34 
 
 
215 aa  54.3  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.210616  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2349  uridine kinase  29.17 
 
 
213 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2356  uridine kinase  29.17 
 
 
213 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0747859  normal  0.616244 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2249  uridine kinase  29.17 
 
 
213 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2463  uridine kinase  29.17 
 
 
213 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.92076  normal  0.601786 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1197  uridine kinase  27.54 
 
 
213 aa  52.8  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2871  uridine kinase  27.54 
 
 
213 aa  53.1  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2305  uridine kinase  29.17 
 
 
213 aa  51.6  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0533  uridine kinase  27.54 
 
 
207 aa  51.6  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1591  uridine kinase  28.07 
 
 
213 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00393606  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2206  uridine kinase  28.07 
 
 
213 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2359  uridine kinase  28.07 
 
 
213 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1919  uridine kinase  29.48 
 
 
211 aa  50.8  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01961  hypothetical protein  28.07 
 
 
213 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2482  uridine kinase  28.75 
 
 
211 aa  50.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3003  uridine kinase  28.07 
 
 
213 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.384394 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1575  uridine kinase  28.07 
 
 
213 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0267753  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0994  uridine kinase  28.07 
 
 
213 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1166  uridine kinase  28.07 
 
 
213 aa  51.2  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01972  uridine kinase  28.07 
 
 
213 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1489  uridine kinase  31.76 
 
 
212 aa  50.8  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0501777  normal  0.122094 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1365  uridine kinase  30.94 
 
 
204 aa  50.4  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.759935  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2651  uridine kinase  30 
 
 
211 aa  50.4  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.212203 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1974  uridine kinase  28.25 
 
 
216 aa  50.1  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.308367  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1281  uridine kinase  28.48 
 
 
209 aa  49.7  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1979  uridine kinase  29.59 
 
 
211 aa  49.3  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000633687  hitchhiker  0.00165825 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2054  uridine kinase  29.76 
 
 
212 aa  48.5  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2364  uridine kinase  26.09 
 
 
219 aa  48.1  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2228  uridine kinase  28.14 
 
 
215 aa  48.1  0.00009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0450  uridine kinase-like protein  27.81 
 
 
198 aa  48.1  0.00009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.220272  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0537  uridine kinase  28.1 
 
 
242 aa  48.1  0.00009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0563702  hitchhiker  0.00000000000000916272 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2617  uridine kinase  30 
 
 
212 aa  48.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1175  uridine kinase  29.92 
 
 
207 aa  47.4  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0339  uridine kinase  27.39 
 
 
207 aa  47.8  0.0001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1732  uridine kinase  30 
 
 
212 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000414727  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1762  uridine kinase  30 
 
 
212 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0067733  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1657  uridine kinase  30 
 
 
212 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0722731  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2218  uridine kinase  28.82 
 
 
212 aa  48.1  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.428302  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0556  uridine kinase  26.95 
 
 
219 aa  46.6  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0365333  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2463  uridine kinase  29.59 
 
 
212 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000426115  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl306  uridine kinase  30.43 
 
 
208 aa  46.6  0.0002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000466982  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2550  putative fructose transport system kinase  29.46 
 
 
219 aa  46.6  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1422  uridine kinase  24.62 
 
 
236 aa  47  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0716  putative fructose transport system kinase  26.36 
 
 
213 aa  46.2  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436559  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1668  uridine kinase  29.37 
 
 
207 aa  46.6  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1702  uridine kinase  29.37 
 
 
207 aa  46.6  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.69825  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2244  uridine kinase  28.07 
 
 
212 aa  46.2  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1888  uridine kinase  29.59 
 
 
212 aa  45.8  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000127737  normal  0.0259304 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2576  uridine kinase  29.59 
 
 
212 aa  45.8  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0976754  normal  0.0423229 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2456  uridine kinase  29.59 
 
 
212 aa  45.8  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000511378  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0011  uridine kinase  29.24 
 
 
202 aa  45.8  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1825  uridine kinase  34.75 
 
 
206 aa  46.2  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0644  uridine kinase  27.74 
 
 
213 aa  44.3  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000687916  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2005  uridine kinase  32.35 
 
 
204 aa  44.7  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.679011  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02924  uridine kinase  27.38 
 
 
213 aa  44.3  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2386  uridine kinase  27.01 
 
 
209 aa  43.9  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000694748  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02150  uridine kinase, putative  23.67 
 
 
582 aa  43.9  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002983  uridine kinase (C1)  26.35 
 
 
213 aa  43.1  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.163408  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5650  hypothetical protein  21.93 
 
 
185 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.413213  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1781  uridine kinase  25.86 
 
 
209 aa  42.4  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0453  uridine kinase  30.15 
 
 
201 aa  41.6  0.008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00211906  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0031  phosphoribulokinase/uridine kinase  26.61 
 
 
555 aa  41.6  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12970  uridine kinase  28 
 
 
204 aa  41.6  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000147377  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5271  hypothetical protein  21.93 
 
 
185 aa  41.2  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5360  hypothetical protein  21.93 
 
 
185 aa  41.2  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>