89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3554 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3554  putative fructose transport system kinase  100 
 
 		 205 aa  400  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38330  hypothetical protein  54.77 
 
 		 211 aa  205  4e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.741273  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2554  putative fructose transport system kinase  56.86 
 
 		 213 aa  201  5e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.225368  normal  0.62572 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29260  panthothenate kinase  57.75 
 
 		 221 aa  191  8e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6929  hypothetical protein  54.5 
 
 		 211 aa  187  7e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0716  putative fructose transport system kinase  53.81 
 
 		 213 aa  181  6e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2550  putative fructose transport system kinase  47.57 
 
 		 219 aa  177  7e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4807  putative fructose transport system kinase  49.75 
 
 		 217 aa  177  8e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.969066  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0988  phosphoribulokinase/uridine kinase  52.22 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0166528  normal  0.062689 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2086  putative fructose transport system kinase  50.24 
 
 		 216 aa  175  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4825  putative fructose transport system kinase  52.91 
 
 		 228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3493  phosphoribulokinase/uridine kinase  54.01 
 
 		 208 aa  173  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3755  hypothetical protein  55.05 
 
 		 210 aa  171  6.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05970  hypothetical protein  52.13 
 
 		 215 aa  171  6.999999999999999e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.413524  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4137  hypothetical protein  55.68 
 
 		 215 aa  169  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24358  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3270  putative fructose transport system kinase  44.95 
 
 		 212 aa  165  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587247  normal  0.995863 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2867  putative fructose transport system kinase  52.45 
 
 		 229 aa  162  2.0000000000000002e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0781  hypothetical protein  51.32 
 
 		 213 aa  162  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3768  phosphoribulokinase/uridine kinase  50 
 
 		 199 aa  160  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1238  putative fructose transport system kinase  48.91 
 
 		 210 aa  159  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.45072 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4273  putative fructose transport system kinase  48.04 
 
 		 224 aa  159  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3611  putative fructose transport system kinase  50.28 
 
 		 208 aa  159  4e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.66248 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3839  phosphoribulokinase/uridine kinase  50 
 
 		 193 aa  158  6e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2601  putative fructose transport system kinase  48.44 
 
 		 226 aa  148  6e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.208404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0072  putative fructose transport system kinase  42.33 
 
 		 213 aa  141  7e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1788  phosphoribulokinase/uridine kinase  45.55 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1741  phosphoribulokinase/uridine kinase  45.55 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0062  putative fructose transport system kinase  40.51 
 
 		 232 aa  137  8.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0061  putative fructose transport system kinase  40.51 
 
 		 232 aa  137  8.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.484173  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3564  hypothetical protein  43.88 
 
 		 217 aa  135  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1817  hypothetical protein  42.78 
 
 		 215 aa  132  3.9999999999999996e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2255  hypothetical protein  43.01 
 
 		 216 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal  0.941975 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0502  hypothetical protein  44.57 
 
 		 204 aa  124  9e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1720  phosphoribulokinase/uridine kinase  44.78 
 
 		 226 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0642  putative fructose transport system kinase  40.89 
 
 		 237 aa  123  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.426606  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0371  putative fructose transport system kinase  41.08 
 
 		 207 aa  117  7.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0105  putative fructose transport system kinase  41.14 
 
 		 206 aa  117  9e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0128  putative fructose transport system kinase  39.66 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496094  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0129  putative fructose transport system kinase  37.36 
 
 		 210 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5968  putative fructose transport system kinase  35.29 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.682486  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0237  putative fructose transport system kinase  44.38 
 
 		 198 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.719506 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1293  hypothetical protein  34.63 
 
 		 226 aa  108  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0986  putative fructose transport system kinase  44.44 
 
 		 198 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2647  putative fructose transport system kinase  43.83 
 
 		 198 aa  106  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0848  hypothetical protein  43.39 
 
 		 212 aa  103  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47307  pantothenate kinase-like protein  32.32 
 
 		 240 aa  100  1e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.169433 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04382  kinase-related protein (AFU_orthologue; AFUA_4G06710)  34.55 
 
 		 234 aa  98.2  6e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.608845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2803  phosphoribulokinase/uridine kinase family protein  31 
 
 		 212 aa  97.1  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.700623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39804  Predicted panthothenate kinase/uridine kinase-related protein  29.38 
 
 		 229 aa  93.2  2e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0416913 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3357  putative fructose transport system kinase  35.43 
 
 		 237 aa  82  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_88056  predicted protein  34.16 
 
 		 261 aa  82  0.000000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3086  putative fructose transport system kinase  33.69 
 
 		 237 aa  81.6  0.000000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.949121  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0782  putative fructose transport system kinase  33.69 
 
 		 237 aa  81.6  0.000000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.311661  normal  0.23532 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02759  hypothetical protein  33.69 
 
 		 237 aa  81.6  0.000000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.505091  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0765  putative fructose transport system kinase  33.69 
 
 		 237 aa  81.6  0.000000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.297171  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02722  hypothetical protein  33.69 
 
 		 237 aa  81.6  0.000000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.455616  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3262  putative fructose transport system kinase  34.86 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.658229  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3069  putative fructose transport system kinase  34.86 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0292125 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4229  putative fructose transport system kinase  33.71 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3249  putative fructose transport system kinase  37.75 
 
 		 238 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.545767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3316  putative fructose transport system kinase  37.75 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001416  uridine kinase  28.85 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.922177  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08109  conserved hypothetical protein  27.8 
 
 		 583 aa  72  0.000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.401765  normal  0.665757 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43766  predicted protein  34.39 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_15134  predicted protein  29.24 
 
 		 173 aa  68.9  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM02590  conserved hypothetical protein  28.43 
 
 		 230 aa  68.2  0.00000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.162258  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1603  pantothenate kinase  23.24 
 
 		 229 aa  49.7  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12970  uridine kinase  24.07 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000147377  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1820  uridine kinase  30.67 
 
 		 232 aa  48.5  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2364  uridine kinase  29.05 
 
 		 219 aa  48.1  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1819  uridine kinase  30.67 
 
 		 232 aa  48.1  0.00009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0039  pantothenate kinase  33.67 
 
 		 330 aa  46.6  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1263  pantothenate kinase  35.63 
 
 		 314 aa  47  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0622  pantothenate kinase  28.23 
 
 		 324 aa  46.6  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2007  pantothenate kinase  29.46 
 
 		 322 aa  45.1  0.0008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0772571  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2087  pantothenate kinase  29.46 
 
 		 322 aa  45.1  0.0008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.222061  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0832  pantothenate kinase  30.36 
 
 		 322 aa  44.7  0.0009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.254442  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1012  pantothenate kinase  29.73 
 
 		 329 aa  44.7  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.298454  normal  0.191008 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3973  pantothenate kinase  34.88 
 
 		 331 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2721  pantothenate kinase  31.9 
 
 		 320 aa  43.1  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0140  pantothenate kinase  30.89 
 
 		 318 aa  42.7  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40387  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16790  pantothenate kinase  26.42 
 
 		 336 aa  42.7  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4300  pantothenate kinase  34.88 
 
 		 331 aa  42  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2161  hypothetical protein  29.91 
 
 		 296 aa  41.6  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.82045  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3054  uridine kinase  26.67 
 
 		 201 aa  42  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.654412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2547  pantothenate kinase  28.36 
 
 		 358 aa  41.6  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1881  pantothenate kinase  24.77 
 
 		 229 aa  41.6  0.008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4658  pantothenate kinase  27.34 
 
 		 312 aa  41.6  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00324704  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1197  uridine kinase  27.18 
 
 		 213 aa  41.2  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>