More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1826 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_1826  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 
307 aa  621  1e-177  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2342  AAA ATPase, central region  69.39 
 
 
304 aa  426  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434105  unclonable  0.000000175529 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1267  ATPase central domain-containing protein  69.39 
 
 
304 aa  426  1e-118  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5158  AAA ATPase, central region  68.55 
 
 
311 aa  392  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0242102  normal  0.260377 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6929  AAA ATPase central domain protein  48.07 
 
 
304 aa  256  4e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00438766  hitchhiker  0.00101304 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00690  regulation of meiosis-related protein, putative  36.92 
 
 
578 aa  125  9e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_3211  predicted protein  36.26 
 
 
304 aa  122  8e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.713787  normal  0.107515 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13779  predicted protein  34.43 
 
 
304 aa  120  3.9999999999999996e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.760626  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1958  AAA ATPase central domain protein  31.67 
 
 
468 aa  89.4  7e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.268075 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_30898  vacuolar protein  31.55 
 
 
422 aa  88.2  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  35.03 
 
 
754 aa  87  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0470  vesicle-fusing ATPase  30.29 
 
 
703 aa  86.7  4e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0648  AAA ATPase central domain protein  31.06 
 
 
585 aa  86.7  4e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00460  ATPase, putative  29.13 
 
 
439 aa  85.1  0.000000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0735  AAA ATPase central domain protein  31.67 
 
 
459 aa  84  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03061  vacuolar sorting ATPase Vps4, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09360)  33.12 
 
 
434 aa  83.6  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.548011  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.76 
 
 
754 aa  83.6  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26031  predicted protein  33.12 
 
 
442 aa  83.2  0.000000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.392811  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.16 
 
 
754 aa  82.4  0.000000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1429  ATPase central domain-containing protein  30.34 
 
 
464 aa  82  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  26.72 
 
 
754 aa  82  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0529  cell division cycle protein 48-like protein  34.36 
 
 
426 aa  81.3  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  29.58 
 
 
425 aa  81.3  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  30.09 
 
 
757 aa  81.6  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60303  predicted protein  31.14 
 
 
433 aa  80.9  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2215  AAA ATPase central domain protein  31.02 
 
 
451 aa  80.9  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0998186  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2326  ATPase central domain-containing protein  31.73 
 
 
419 aa  80.5  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  28.9 
 
 
727 aa  80.1  0.00000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2344  Vesicle-fusing ATPase  32.18 
 
 
703 aa  79  0.00000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.935246  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0620  proteasome-activating nucleotidase  29.21 
 
 
431 aa  79  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07254  Cell division control protein 48 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AWS6]  29.44 
 
 
814 aa  78.6  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385633  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.48 
 
 
763 aa  79  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0001  Vesicle-fusing ATPase  32.29 
 
 
699 aa  78.6  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3546  ATPase central domain-containing protein  32.92 
 
 
443 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0973  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.93 
 
 
852 aa  77  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0684344  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1955  AAA ATPase  27.88 
 
 
430 aa  76.3  0.0000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0432  Microtubule-severing ATPase  38.51 
 
 
734 aa  76.3  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0369558  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1174  proteasome-activating nucleotidase  27.23 
 
 
422 aa  76.3  0.0000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.592005 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0573  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.54 
 
 
772 aa  75.9  0.0000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1592  AAA ATPase central domain protein  27.2 
 
 
459 aa  75.5  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0254  microtubule-severing ATPase  37.04 
 
 
750 aa  75.5  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.053891 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34520  AAA+ family ATPase  37.35 
 
 
747 aa  75.1  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0185945  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0486  ATPase central domain-containing protein  28.77 
 
 
424 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2089  ATPase central domain-containing protein  28.96 
 
 
428 aa  75.1  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.43 
 
 
808 aa  75.1  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5123  Adenosinetriphosphatase  35.03 
 
 
739 aa  75.1  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3431  AAA ATPase central domain protein  29.55 
 
 
477 aa  74.7  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.94 
 
 
740 aa  73.9  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  30.38 
 
 
769 aa  73.9  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1384  26S proteasome subunit P45 family  31.65 
 
 
394 aa  74.3  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0469863  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  32.14 
 
 
754 aa  73.9  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0801  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  31.68 
 
 
806 aa  73.9  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.704818  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1677  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.29 
 
 
736 aa  73.9  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.94 
 
 
737 aa  73.9  0.000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.94 
 
 
736 aa  73.9  0.000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_769  predicted protein  28 
 
 
550 aa  73.9  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.38 
 
 
732 aa  73.9  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.94 
 
 
737 aa  73.9  0.000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1461  proteasome-activating nucleotidase  28.12 
 
 
436 aa  73.6  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1301  AAA ATPase central domain protein  30.74 
 
 
493 aa  73.6  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.01 
 
 
739 aa  73.6  0.000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.3 
 
 
738 aa  73.6  0.000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.033227 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1810  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.59 
 
 
715 aa  73.6  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1606  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.3 
 
 
773 aa  73.2  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.168179  normal  0.400051 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.88 
 
 
800 aa  73.2  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0937  proteasome-activating nucleotidase  29.7 
 
 
412 aa  73.2  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.274692  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0697  AAA ATPase, CDC48  32.65 
 
 
718 aa  72.8  0.000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.88 
 
 
784 aa  72.8  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2069  AAA ATPase central domain protein  36.31 
 
 
776 aa  72.8  0.000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.963415  normal  0.166628 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.93 
 
 
723 aa  72.8  0.000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.95 
 
 
781 aa  72.4  0.000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.88 
 
 
781 aa  72.4  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.75 
 
 
735 aa  72.4  0.000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0293  microtubule-severing ATPase  39.16 
 
 
748 aa  72.4  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.48554 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0068  AAA ATPase, central region  35.57 
 
 
613 aa  71.6  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.263545  hitchhiker  0.00768241 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2427  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.1 
 
 
805 aa  72  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3106  Adenosinetriphosphatase  31.31 
 
 
493 aa  72  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000310536  normal  0.727853 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.43 
 
 
756 aa  72  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4641  ATPase central domain-containing protein  27.95 
 
 
446 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0097  ATPase central domain-containing protein  26.92 
 
 
338 aa  72.4  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622643  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2583  AAA ATPase central domain protein  28.99 
 
 
419 aa  72  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1795  ATP-dependent M41 family peptidase  29.8 
 
 
1301 aa  71.6  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1798  ATP-dependent M41 family peptidase  28.02 
 
 
1284 aa  71.6  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0342  AAA ATPase central domain protein  27 
 
 
781 aa  71.2  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2338  AAA ATPase, central region  27.66 
 
 
425 aa  71.2  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.65 
 
 
719 aa  71.2  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38163  predicted protein  32.98 
 
 
800 aa  71.2  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.158186  normal  0.217653 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.75 
 
 
768 aa  71.2  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67138  Cell division control protein 48  30.67 
 
 
829 aa  71.6  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0876334 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1305  proteasome-activating nucleotidase  31.01 
 
 
412 aa  71.6  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05747  hypothetical protein similar to PSMC6 subunit (Broad)  27.12 
 
 
393 aa  70.9  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222803  normal  0.0253751 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7058  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.12 
 
 
704 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2337  vesicle-fusing ATPase  34.81 
 
 
639 aa  70.9  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0101674 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.01 
 
 
718 aa  70.5  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1247  cell division protein CDC48  28.03 
 
 
732 aa  70.5  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292363  normal  0.0692611 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5489  AAA ATPase central domain protein  34.27 
 
 
336 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6826  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.85 
 
 
757 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1197  ATPase central domain-containing protein  24.62 
 
 
371 aa  70.1  0.00000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.862014  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0925  ATPase central domain-containing protein  26.67 
 
 
371 aa  69.7  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1038  proteasome-activating nucleotidase  31.01 
 
 
412 aa  69.7  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.372597  normal  0.687098 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>