More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1384 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_1384  26S proteasome subunit P45 family  100 
 
 
394 aa  785    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0469863  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1038  proteasome-activating nucleotidase  61.44 
 
 
412 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.372597  normal  0.687098 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1305  proteasome-activating nucleotidase  61.58 
 
 
412 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0937  proteasome-activating nucleotidase  60.78 
 
 
412 aa  468  9.999999999999999e-131  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.274692  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1461  proteasome-activating nucleotidase  59.84 
 
 
436 aa  464  1e-129  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0620  proteasome-activating nucleotidase  57.49 
 
 
431 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0920  proteasome-activating nucleotidase  56.05 
 
 
407 aa  432  1e-120  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1033  proteasome-activating nucleotidase  56.53 
 
 
408 aa  433  1e-120  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  58.03 
 
 
393 aa  431  1e-119  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1024  proteasome-activating nucleotidase  56.05 
 
 
407 aa  429  1e-119  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123618  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1761  proteasome-activating nucleotidase  55.53 
 
 
407 aa  426  1e-118  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2113  proteasome-activating nucleotidase  56.83 
 
 
426 aa  422  1e-117  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.685736  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0458  proteasome-activating nucleotidase  59.27 
 
 
404 aa  424  1e-117  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0952  proteasome-activating nucleotidase  54.88 
 
 
407 aa  420  1e-116  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2275  proteasome-activating nucleotidase  54.1 
 
 
379 aa  411  1e-113  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.575549  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1174  proteasome-activating nucleotidase  57.07 
 
 
422 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.592005 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1458  proteasome-activating nucleotidase  51.6 
 
 
389 aa  379  1e-104  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.264354 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1040  proteasome-activating nucleotidase  53.44 
 
 
387 aa  370  1e-101  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.681271 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1266  proteasome-activating nucleotidase  56.68 
 
 
404 aa  369  1e-101  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3362  26S proteasome subunit P45 family  52.62 
 
 
410 aa  367  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1307  proteasome-activating nucleotidase  51.66 
 
 
406 aa  365  1e-100  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.732234  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2440  26S proteasome subunit P45 family  48.61 
 
 
405 aa  363  3e-99  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.683405  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1492  26S proteasome subunit P45 family  48.39 
 
 
405 aa  363  3e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03290  ATPase, putative  48.09 
 
 
405 aa  362  5.0000000000000005e-99  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0507  proteasome-activating nucleotidase  49.21 
 
 
386 aa  361  1e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.56018  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2011  proteasome-activating nucleotidase  49.45 
 
 
407 aa  360  3e-98  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.705003  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1308  proteasome-activating nucleotidase  56.36 
 
 
390 aa  359  4e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.114545  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2902  proteasome-activating nucleotidase  47.41 
 
 
404 aa  359  5e-98  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.857488  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1160  proteasome-activating nucleotidase  53.18 
 
 
407 aa  357  2.9999999999999997e-97  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0368  proteasome-activating nucleotidase  49.45 
 
 
403 aa  355  5e-97  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.103097  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71824  protease regulatory subunit 8 homolog (SUG1 protein) (CIM3 protein) (TAT-binding protein TBY1)  48.73 
 
 
402 aa  355  1e-96  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45122  predicted protein  46.09 
 
 
421 aa  353  2e-96  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30617  predicted protein  48.31 
 
 
443 aa  353  4e-96  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.580577  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06988  hypothetical protein similar to proteasome p45/SUG (Broad)  51.92 
 
 
389 aa  352  7e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.407923  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1362  26S proteasome subunit P45 family  51.17 
 
 
410 aa  351  1e-95  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03020  endopeptidase, putative  50.89 
 
 
438 aa  350  3e-95  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0528314  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0185  proteasome-activating nucleotidase  47.45 
 
 
405 aa  350  3e-95  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01000  endopeptidase, putative  49.16 
 
 
407 aa  346  5e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.174287  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05747  hypothetical protein similar to PSMC6 subunit (Broad)  47.37 
 
 
393 aa  345  7e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222803  normal  0.0253751 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33894  predicted protein  47.58 
 
 
398 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00183921  normal  0.0445175 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34331  predicted protein  45.48 
 
 
400 aa  342  5e-93  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.926825  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0867  proteasome-activating nucleotidase  46.93 
 
 
429 aa  342  9e-93  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.199281  normal  0.0151046 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85761  26S protease subunit RPT4 (26S protease subunit SUG2) (Proteasomal cap subunit)  46.96 
 
 
416 aa  340  2e-92  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.341718  normal  0.159026 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54032  26S protease regulatory subunit 4 homolog (TAT-binding homolog 5)  45.6 
 
 
434 aa  339  4e-92  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0833723 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11735  predicted protein  45.65 
 
 
389 aa  339  5.9999999999999996e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02213  proteasome regulatory particle subunit Rpt2, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07050)  48.49 
 
 
460 aa  338  7e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0288941 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32343  predicted protein  45.99 
 
 
425 aa  338  9.999999999999999e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0415891  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35070  predicted protein  46.37 
 
 
417 aa  336  5e-91  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0746786  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0400  proteasome-activating nucleotidase  46.15 
 
 
413 aa  335  7.999999999999999e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.583588 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2301  proteasome-activating nucleotidase  49.86 
 
 
415 aa  335  9e-91  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03930  endopeptidase, putative  46.22 
 
 
414 aa  330  3e-89  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0534334  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30067  predicted protein  47.58 
 
 
403 aa  329  5.0000000000000004e-89  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.657092  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04236  hypothetical protein similar to TAT-binding protein 1 (Broad)  44.62 
 
 
465 aa  325  9e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.110869 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75017  protease subunit component  45.53 
 
 
446 aa  323  3e-87  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0564069 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02904  proteasome regulatory particle subunit Rpt3, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11390)  46.93 
 
 
422 aa  322  8e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.211289 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03550  endopeptidase, putative  49.36 
 
 
450 aa  318  7.999999999999999e-86  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.502719  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01550  endopeptidase, putative  42.34 
 
 
464 aa  318  1e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.865518  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29121  predicted protein  48.17 
 
 
429 aa  316  4e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.429141  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66830  26S proteasome regulatory subunit  47.09 
 
 
410 aa  311  1e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.0000427133  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52887  26S proteasome regulatory subunit  41.29 
 
 
427 aa  310  2e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28219  predicted protein  49.33 
 
 
447 aa  302  6.000000000000001e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.473905  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9090  predicted protein  41.73 
 
 
431 aa  302  6.000000000000001e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02917  hypothetical protein similar to 26S proteasome regulatory subunit (Broad)  45.07 
 
 
443 aa  301  1e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.137848 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_41778  predicted protein  54.41 
 
 
284 aa  299  5e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0751976  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  54.98 
 
 
732 aa  267  2e-70  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  55.56 
 
 
731 aa  266  4e-70  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  55.56 
 
 
731 aa  265  8.999999999999999e-70  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  54.76 
 
 
731 aa  264  2e-69  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  53.97 
 
 
731 aa  261  2e-68  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  58.3 
 
 
718 aa  255  9e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  55.36 
 
 
768 aa  253  4.0000000000000004e-66  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  54.51 
 
 
760 aa  253  4.0000000000000004e-66  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.82 
 
 
737 aa  252  7e-66  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.51 
 
 
784 aa  252  7e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50.18 
 
 
738 aa  252  7e-66  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.033227 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.74 
 
 
781 aa  250  4e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  52.26 
 
 
719 aa  249  4e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50.82 
 
 
781 aa  249  5e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.46 
 
 
737 aa  249  5e-65  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  50.39 
 
 
738 aa  249  6e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  53.85 
 
 
759 aa  249  8e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  46.67 
 
 
769 aa  249  9e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.1 
 
 
736 aa  248  1e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  52.57 
 
 
735 aa  248  1e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.13 
 
 
800 aa  248  1e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  52.28 
 
 
727 aa  248  2e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1594  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  54.82 
 
 
730 aa  246  4.9999999999999997e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0267229  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.98 
 
 
739 aa  246  6.999999999999999e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  53.81 
 
 
754 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.33 
 
 
723 aa  244  3e-63  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  44.23 
 
 
713 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2078  cell division cycle protein  49.6 
 
 
763 aa  241  2e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0596077  normal  0.822776 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2884  cell division cycle protein  50.2 
 
 
764 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884103  normal  0.239009 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  53.02 
 
 
701 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  43.25 
 
 
775 aa  238  1e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.08 
 
 
610 aa  238  1e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0518  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.85 
 
 
636 aa  238  1e-61  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000475149  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.71 
 
 
610 aa  237  2e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1990  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.6 
 
 
659 aa  238  2e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.144891  normal  0.186322 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1034  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.54 
 
 
510 aa  237  3e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>