More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1174 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1174  proteasome-activating nucleotidase  100 
 
 		 422 aa  855    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.592005 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1461  proteasome-activating nucleotidase  60 
 
 		 436 aa  455  1e-127  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1305  proteasome-activating nucleotidase  59.36 
 
 		 412 aa  451  1e-125  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0937  proteasome-activating nucleotidase  57.03 
 
 		 412 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.274692  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1038  proteasome-activating nucleotidase  56.77 
 
 		 412 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.372597  normal  0.687098 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1384  26S proteasome subunit P45 family  57.07 
 
 		 394 aa  406  1.0000000000000001e-112  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0469863  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0920  proteasome-activating nucleotidase  53.06 
 
 		 407 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1024  proteasome-activating nucleotidase  53.06 
 
 		 407 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123618  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0458  proteasome-activating nucleotidase  56.25 
 
 		 404 aa  398  9.999999999999999e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1761  proteasome-activating nucleotidase  53.06 
 
 		 407 aa  398  1e-109  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0620  proteasome-activating nucleotidase  50.39 
 
 		 431 aa  392  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0952  proteasome-activating nucleotidase  53.66 
 
 		 407 aa  390  1e-107  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1033  proteasome-activating nucleotidase  52.76 
 
 		 408 aa  386  1e-106  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2113  proteasome-activating nucleotidase  50.41 
 
 		 426 aa  380  1e-104  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.685736  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  49.32 
 
 		 393 aa  360  2e-98  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2275  proteasome-activating nucleotidase  50.27 
 
 		 379 aa  356  3.9999999999999996e-97  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.575549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0368  proteasome-activating nucleotidase  47.97 
 
 		 403 aa  355  6.999999999999999e-97  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.103097  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1266  proteasome-activating nucleotidase  50.53 
 
 		 404 aa  347  2e-94  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3362  26S proteasome subunit P45 family  45.34 
 
 		 410 aa  347  3e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0185  proteasome-activating nucleotidase  47.57 
 
 		 405 aa  346  4e-94  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1492  26S proteasome subunit P45 family  48 
 
 		 405 aa  345  8.999999999999999e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1458  proteasome-activating nucleotidase  50 
 
 		 389 aa  345  1e-93  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.264354 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2440  26S proteasome subunit P45 family  48.11 
 
 		 405 aa  338  9e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.683405  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2902  proteasome-activating nucleotidase  45.92 
 
 		 404 aa  338  9.999999999999999e-92  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.857488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1307  proteasome-activating nucleotidase  46.19 
 
 		 406 aa  337  1.9999999999999998e-91  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.732234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0507  proteasome-activating nucleotidase  47.98 
 
 		 386 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.56018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1160  proteasome-activating nucleotidase  47.42 
 
 		 407 aa  336  3.9999999999999995e-91  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2011  proteasome-activating nucleotidase  45.04 
 
 		 407 aa  332  8e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.705003  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03020  endopeptidase, putative  46.96 
 
 		 438 aa  330  4e-89  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0528314  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1308  proteasome-activating nucleotidase  51.38 
 
 		 390 aa  329  4e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.114545  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71824  protease regulatory subunit 8 homolog (SUG1 protein) (CIM3 protein) (TAT-binding protein TBY1)  45.86 
 
 		 402 aa  330  4e-89  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30617  predicted protein  45.95 
 
 		 443 aa  329  5.0000000000000004e-89  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.580577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1040  proteasome-activating nucleotidase  46.3 
 
 		 387 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.681271 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02213  proteasome regulatory particle subunit Rpt2, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07050)  44.06 
 
 		 460 aa  326  5e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0288941 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01000  endopeptidase, putative  46.2 
 
 		 407 aa  324  2e-87  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.174287  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54032  26S protease regulatory subunit 4 homolog (TAT-binding homolog 5)  45.51 
 
 		 434 aa  321  9.999999999999999e-87  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0833723 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33894  predicted protein  44.27 
 
 		 398 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00183921  normal  0.0445175 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75017  protease subunit component  48.62 
 
 		 446 aa  321  1.9999999999999998e-86  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0564069 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0400  proteasome-activating nucleotidase  47.97 
 
 		 413 aa  320  3e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.583588 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06988  hypothetical protein similar to proteasome p45/SUG (Broad)  48.97 
 
 		 389 aa  319  5e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.407923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28219  predicted protein  49.53 
 
 		 447 aa  319  6e-86  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.473905  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03930  endopeptidase, putative  45.83 
 
 		 414 aa  318  7.999999999999999e-86  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0534334  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35070  predicted protein  45.01 
 
 		 417 aa  318  7.999999999999999e-86  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0746786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1362  26S proteasome subunit P45 family  44.64 
 
 		 410 aa  317  2e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03550  endopeptidase, putative  49.84 
 
 		 450 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.502719  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29121  predicted protein  49.2 
 
 		 429 aa  311  1e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.429141  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0867  proteasome-activating nucleotidase  42.56 
 
 		 429 aa  311  2e-83  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.199281  normal  0.0151046 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30067  predicted protein  45.31 
 
 		 403 aa  310  2.9999999999999997e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.657092  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02904  proteasome regulatory particle subunit Rpt3, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11390)  43.52 
 
 		 422 aa  310  4e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.211289 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32343  predicted protein  49.67 
 
 		 425 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0415891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11735  predicted protein  43.82 
 
 		 389 aa  308  1.0000000000000001e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03290  ATPase, putative  43.56 
 
 		 405 aa  305  9.000000000000001e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66830  26S proteasome regulatory subunit  44.97 
 
 		 410 aa  304  2.0000000000000002e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.0000427133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34331  predicted protein  42.78 
 
 		 400 aa  303  5.000000000000001e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.926825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_41778  predicted protein  52.43 
 
 		 284 aa  301  1e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0751976  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02917  hypothetical protein similar to 26S proteasome regulatory subunit (Broad)  45.97 
 
 		 443 aa  300  3e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.137848 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2301  proteasome-activating nucleotidase  41 
 
 		 415 aa  300  3e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04236  hypothetical protein similar to TAT-binding protein 1 (Broad)  46.89 
 
 		 465 aa  297  2e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.110869 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01550  endopeptidase, putative  48.38 
 
 		 464 aa  295  1e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.865518  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52887  26S proteasome regulatory subunit  44 
 
 		 427 aa  293  4e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45122  predicted protein  41.8 
 
 		 421 aa  293  4e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05747  hypothetical protein similar to PSMC6 subunit (Broad)  45.31 
 
 		 393 aa  291  1e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222803  normal  0.0253751 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9090  predicted protein  46.15 
 
 		 431 aa  283  4.0000000000000003e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85761  26S protease subunit RPT4 (26S protease subunit SUG2) (Proteasomal cap subunit)  41.05 
 
 		 416 aa  277  2e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.341718  normal  0.159026 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  54.55 
 
 		 719 aa  239  8e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  45.79 
 
 		 769 aa  237  3e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.83 
 
 		 723 aa  236  4e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.24 
 
 		 735 aa  235  1.0000000000000001e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  51.74 
 
 		 781 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  53.25 
 
 		 718 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  50.21 
 
 		 740 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  53.04 
 
 		 732 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.31 
 
 		 768 aa  234  3e-60  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1984  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.83 
 
 		 659 aa  231  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.614445 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  51.78 
 
 		 731 aa  231  2e-59  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  44.48 
 
 		 754 aa  231  2e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0232  hypothetical protein  47.13 
 
 		 691 aa  231  2e-59  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  50.21 
 
 		 740 aa  231  3e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  44.44 
 
 		 742 aa  230  3e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  52.52 
 
 		 754 aa  230  4e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.81 
 
 		 731 aa  229  5e-59  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5040  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.98 
 
 		 685 aa  229  5e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  44.11 
 
 		 743 aa  229  6e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0101  AAA family ATPase  43.35 
 
 		 722 aa  229  7e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  50.87 
 
 		 727 aa  229  7e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50.61 
 
 		 731 aa  229  7e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50.57 
 
 		 731 aa  229  8e-59  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3484  FtsH-2 peptidase  40.88 
 
 		 621 aa  228  1e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2069  AAA ATPase central domain protein  48.64 
 
 		 776 aa  228  1e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.963415  normal  0.166628 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.57 
 
 		 784 aa  228  2e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  47.58 
 
 		 738 aa  227  2e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.66 
 
 		 662 aa  228  2e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02481  cell division protein FtsH2  46.36 
 
 		 617 aa  227  3e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0228  cell division protein FtsH2  46.36 
 
 		 617 aa  227  3e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.288231  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0836  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.01 
 
 		 697 aa  227  3e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473024  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02471  cell division protein FtsH2  46.36 
 
 		 617 aa  227  3e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  44.67 
 
 		 742 aa  227  3e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  49.17 
 
 		 759 aa  227  4e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.13 
 
 		 781 aa  226  4e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50 
 
 		 800 aa  227  4e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>