More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1305 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1305  proteasome-activating nucleotidase  100 
 
 		 412 aa  838    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1038  proteasome-activating nucleotidase  71.84 
 
 		 412 aa  625  1e-178  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.372597  normal  0.687098 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0937  proteasome-activating nucleotidase  71.84 
 
 		 412 aa  616  1e-175  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.274692  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1461  proteasome-activating nucleotidase  73.87 
 
 		 436 aa  617  1e-175  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2113  proteasome-activating nucleotidase  58.63 
 
 		 426 aa  490  1e-137  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.685736  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0458  proteasome-activating nucleotidase  63.5 
 
 		 404 aa  491  1e-137  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0620  proteasome-activating nucleotidase  56.52 
 
 		 431 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1384  26S proteasome subunit P45 family  61.58 
 
 		 394 aa  469  1.0000000000000001e-131  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0469863  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0920  proteasome-activating nucleotidase  57.37 
 
 		 407 aa  450  1e-125  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1174  proteasome-activating nucleotidase  59.36 
 
 		 422 aa  451  1e-125  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.592005 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1761  proteasome-activating nucleotidase  57.11 
 
 		 407 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1024  proteasome-activating nucleotidase  57.11 
 
 		 407 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123618  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0952  proteasome-activating nucleotidase  56.32 
 
 		 407 aa  436  1e-121  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1033  proteasome-activating nucleotidase  57.62 
 
 		 408 aa  431  1e-119  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  56.65 
 
 		 393 aa  404  1e-111  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1492  26S proteasome subunit P45 family  50.26 
 
 		 405 aa  395  1e-109  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2275  proteasome-activating nucleotidase  54.44 
 
 		 379 aa  394  1e-108  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.575549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1040  proteasome-activating nucleotidase  55.62 
 
 		 387 aa  390  1e-107  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.681271 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1458  proteasome-activating nucleotidase  53.15 
 
 		 389 aa  384  1e-105  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.264354 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2440  26S proteasome subunit P45 family  47.75 
 
 		 405 aa  383  1e-105  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.683405  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1308  proteasome-activating nucleotidase  56.8 
 
 		 390 aa  377  1e-103  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.114545  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1266  proteasome-activating nucleotidase  51.42 
 
 		 404 aa  376  1e-103  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2902  proteasome-activating nucleotidase  49.47 
 
 		 404 aa  376  1e-103  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.857488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0368  proteasome-activating nucleotidase  47.69 
 
 		 403 aa  374  1e-102  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.103097  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03290  ATPase, putative  54.65 
 
 		 405 aa  369  1e-101  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0185  proteasome-activating nucleotidase  48.28 
 
 		 405 aa  369  1e-101  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3362  26S proteasome subunit P45 family  48.95 
 
 		 410 aa  370  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03020  endopeptidase, putative  51.96 
 
 		 438 aa  365  1e-100  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0528314  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0507  proteasome-activating nucleotidase  51.05 
 
 		 386 aa  367  1e-100  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.56018  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2011  proteasome-activating nucleotidase  51.5 
 
 		 407 aa  366  1e-100  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.705003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54032  26S protease regulatory subunit 4 homolog (TAT-binding homolog 5)  48.53 
 
 		 434 aa  360  3e-98  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0833723 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30617  predicted protein  50 
 
 		 443 aa  359  5e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.580577  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02213  proteasome regulatory particle subunit Rpt2, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07050)  50.45 
 
 		 460 aa  356  3.9999999999999996e-97  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0288941 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1362  26S proteasome subunit P45 family  49.48 
 
 		 410 aa  355  5.999999999999999e-97  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45122  predicted protein  50.27 
 
 		 421 aa  351  1e-95  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05747  hypothetical protein similar to PSMC6 subunit (Broad)  49.86 
 
 		 393 aa  351  2e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222803  normal  0.0253751 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1307  proteasome-activating nucleotidase  48.53 
 
 		 406 aa  348  1e-94  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.732234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34331  predicted protein  48.46 
 
 		 400 aa  347  2e-94  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.926825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1160  proteasome-activating nucleotidase  52.16 
 
 		 407 aa  345  6e-94  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71824  protease regulatory subunit 8 homolog (SUG1 protein) (CIM3 protein) (TAT-binding protein TBY1)  46.78 
 
 		 402 aa  345  8.999999999999999e-94  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0400  proteasome-activating nucleotidase  47.27 
 
 		 413 aa  345  1e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.583588 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2301  proteasome-activating nucleotidase  49.27 
 
 		 415 aa  338  7e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01000  endopeptidase, putative  45.5 
 
 		 407 aa  338  8e-92  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.174287  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03930  endopeptidase, putative  47.04 
 
 		 414 aa  336  5e-91  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0534334  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11735  predicted protein  44.71 
 
 		 389 aa  335  1e-90  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85761  26S protease subunit RPT4 (26S protease subunit SUG2) (Proteasomal cap subunit)  45.99 
 
 		 416 aa  333  3e-90  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.341718  normal  0.159026 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75017  protease subunit component  45.61 
 
 		 446 aa  332  5e-90  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0564069 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0867  proteasome-activating nucleotidase  47.59 
 
 		 429 aa  332  5e-90  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.199281  normal  0.0151046 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06988  hypothetical protein similar to proteasome p45/SUG (Broad)  47.4 
 
 		 389 aa  331  2e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.407923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32343  predicted protein  52.48 
 
 		 425 aa  330  3e-89  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0415891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35070  predicted protein  46.05 
 
 		 417 aa  329  5.0000000000000004e-89  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0746786  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04236  hypothetical protein similar to TAT-binding protein 1 (Broad)  43.39 
 
 		 465 aa  328  1.0000000000000001e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.110869 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01550  endopeptidase, putative  41.87 
 
 		 464 aa  325  1e-87  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.865518  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52887  26S proteasome regulatory subunit  45.41 
 
 		 427 aa  321  9.999999999999999e-87  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30067  predicted protein  42.71 
 
 		 403 aa  318  1e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.657092  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03550  endopeptidase, putative  49.03 
 
 		 450 aa  317  2e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.502719  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33894  predicted protein  45.58 
 
 		 398 aa  316  5e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00183921  normal  0.0445175 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02904  proteasome regulatory particle subunit Rpt3, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11390)  43.23 
 
 		 422 aa  315  9.999999999999999e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.211289 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29121  predicted protein  46.29 
 
 		 429 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.429141  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_41778  predicted protein  55.76 
 
 		 284 aa  313  2.9999999999999996e-84  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0751976  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02917  hypothetical protein similar to 26S proteasome regulatory subunit (Broad)  45.92 
 
 		 443 aa  311  1e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.137848 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28219  predicted protein  46.06 
 
 		 447 aa  311  2e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.473905  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66830  26S proteasome regulatory subunit  45.43 
 
 		 410 aa  309  6.999999999999999e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.0000427133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9090  predicted protein  48.4 
 
 		 431 aa  306  6e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.48 
 
 		 719 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.44 
 
 		 732 aa  255  8e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  53.71 
 
 		 769 aa  253  3e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.15 
 
 		 768 aa  253  5.000000000000001e-66  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0101  AAA family ATPase  47.89 
 
 		 722 aa  250  4e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  45.39 
 
 		 713 aa  249  8e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.08 
 
 		 718 aa  249  8e-65  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  53.88 
 
 		 754 aa  247  2e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1594  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  53.98 
 
 		 730 aa  247  2e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0267229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.41 
 
 		 739 aa  245  9e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  53.54 
 
 		 740 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  53.54 
 
 		 742 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1810  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  51.24 
 
 		 715 aa  243  3e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.15 
 
 		 731 aa  244  3e-63  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.15 
 
 		 731 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  52.65 
 
 		 740 aa  243  5e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  51.72 
 
 		 759 aa  243  6e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3020  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  53.98 
 
 		 709 aa  243  6e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  50.58 
 
 		 727 aa  243  6e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  52.65 
 
 		 743 aa  243  6e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  43.03 
 
 		 738 aa  242  7e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.04 
 
 		 723 aa  242  7e-63  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50.58 
 
 		 701 aa  242  7e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.35 
 
 		 784 aa  241  1e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  49.79 
 
 		 754 aa  242  1e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  48.78 
 
 		 757 aa  242  1e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  48.29 
 
 		 742 aa  241  2e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2427  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  51.77 
 
 		 805 aa  241  2e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.04 
 
 		 760 aa  240  4e-62  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.82 
 
 		 610 aa  239  5e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.82 
 
 		 610 aa  239  5.999999999999999e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2451  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.79 
 
 		 804 aa  239  5.999999999999999e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.530015 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1034  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.95 
 
 		 510 aa  239  5.999999999999999e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.5 
 
 		 781 aa  239  5.999999999999999e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.78 
 
 		 756 aa  239  9e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2157  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.13 
 
 		 805 aa  238  1e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>