More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_54032 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001307  ANIA_02213  proteasome regulatory particle subunit Rpt2, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07050)  75.35 
 
 		 460 aa  666    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0288941 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03020  endopeptidase, putative  77.31 
 
 		 438 aa  680    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0528314  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54032  26S protease regulatory subunit 4 homolog (TAT-binding homolog 5)  100 
 
 		 434 aa  879    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0833723 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30617  predicted protein  70.28 
 
 		 443 aa  608  1e-173  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.580577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_41778  predicted protein  76.41 
 
 		 284 aa  446  1.0000000000000001e-124  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0751976  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11735  predicted protein  49.86 
 
 		 389 aa  379  1e-104  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35070  predicted protein  47.79 
 
 		 417 aa  365  1e-100  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0746786  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03930  endopeptidase, putative  47.97 
 
 		 414 aa  362  1e-98  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0534334  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1305  proteasome-activating nucleotidase  48.53 
 
 		 412 aa  360  3e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66830  26S proteasome regulatory subunit  48.91 
 
 		 410 aa  358  9.999999999999999e-98  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.0000427133  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02904  proteasome regulatory particle subunit Rpt3, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11390)  47.79 
 
 		 422 aa  354  1e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.211289 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0458  proteasome-activating nucleotidase  48.91 
 
 		 404 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0920  proteasome-activating nucleotidase  49.24 
 
 		 407 aa  347  4e-94  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1024  proteasome-activating nucleotidase  48.96 
 
 		 407 aa  345  1e-93  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123618  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1761  proteasome-activating nucleotidase  48.66 
 
 		 407 aa  344  2e-93  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1033  proteasome-activating nucleotidase  48.82 
 
 		 408 aa  343  4e-93  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0952  proteasome-activating nucleotidase  48.41 
 
 		 407 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1384  26S proteasome subunit P45 family  45.6 
 
 		 394 aa  338  9e-92  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0469863  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1038  proteasome-activating nucleotidase  50.15 
 
 		 412 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.372597  normal  0.687098 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0620  proteasome-activating nucleotidase  45.17 
 
 		 431 aa  335  1e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1461  proteasome-activating nucleotidase  48.62 
 
 		 436 aa  333  5e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71824  protease regulatory subunit 8 homolog (SUG1 protein) (CIM3 protein) (TAT-binding protein TBY1)  48.96 
 
 		 402 aa  332  7.000000000000001e-90  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0185  proteasome-activating nucleotidase  47.56 
 
 		 405 aa  332  1e-89  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0937  proteasome-activating nucleotidase  46.34 
 
 		 412 aa  329  6e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.274692  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2902  proteasome-activating nucleotidase  47.08 
 
 		 404 aa  327  4.0000000000000003e-88  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.857488  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06988  hypothetical protein similar to proteasome p45/SUG (Broad)  49.53 
 
 		 389 aa  323  4e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.407923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0368  proteasome-activating nucleotidase  45.85 
 
 		 403 aa  322  9.999999999999999e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.103097  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2113  proteasome-activating nucleotidase  44.74 
 
 		 426 aa  321  9.999999999999999e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.685736  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1174  proteasome-activating nucleotidase  45.51 
 
 		 422 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.592005 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1492  26S proteasome subunit P45 family  46.15 
 
 		 405 aa  321  1.9999999999999998e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01000  endopeptidase, putative  47.21 
 
 		 407 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.174287  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  43.37 
 
 		 393 aa  318  1e-85  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2275  proteasome-activating nucleotidase  44.29 
 
 		 379 aa  318  1e-85  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.575549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2440  26S proteasome subunit P45 family  46.15 
 
 		 405 aa  317  2e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.683405  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33894  predicted protein  50.49 
 
 		 398 aa  316  6e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00183921  normal  0.0445175 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1040  proteasome-activating nucleotidase  44.79 
 
 		 387 aa  311  1e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.681271 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45122  predicted protein  41.64 
 
 		 421 aa  311  2e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1266  proteasome-activating nucleotidase  43.01 
 
 		 404 aa  310  5e-83  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04236  hypothetical protein similar to TAT-binding protein 1 (Broad)  40.69 
 
 		 465 aa  309  6.999999999999999e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.110869 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32343  predicted protein  47.65 
 
 		 425 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0415891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1307  proteasome-activating nucleotidase  42.71 
 
 		 406 aa  308  2.0000000000000002e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.732234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1308  proteasome-activating nucleotidase  44.71 
 
 		 390 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.114545  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3362  26S proteasome subunit P45 family  42.25 
 
 		 410 aa  306  6e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1458  proteasome-activating nucleotidase  42.6 
 
 		 389 aa  306  6e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.264354 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30067  predicted protein  49.35 
 
 		 403 aa  305  7e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.657092  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05747  hypothetical protein similar to PSMC6 subunit (Broad)  44.57 
 
 		 393 aa  305  9.000000000000001e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222803  normal  0.0253751 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03550  endopeptidase, putative  45.48 
 
 		 450 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.502719  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03290  ATPase, putative  40.76 
 
 		 405 aa  302  8.000000000000001e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1160  proteasome-activating nucleotidase  42.39 
 
 		 407 aa  301  1e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01550  endopeptidase, putative  46.5 
 
 		 464 aa  300  3e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.865518  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29121  predicted protein  44.04 
 
 		 429 aa  300  3e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.429141  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0507  proteasome-activating nucleotidase  39.61 
 
 		 386 aa  300  3e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.56018  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2011  proteasome-activating nucleotidase  43.08 
 
 		 407 aa  300  4e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.705003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0400  proteasome-activating nucleotidase  44.48 
 
 		 413 aa  298  2e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.583588 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52887  26S proteasome regulatory subunit  41.6 
 
 		 427 aa  296  5e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75017  protease subunit component  41.19 
 
 		 446 aa  293  4e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0564069 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9090  predicted protein  46.43 
 
 		 431 aa  291  2e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02917  hypothetical protein similar to 26S proteasome regulatory subunit (Broad)  47.99 
 
 		 443 aa  289  6e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.137848 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34331  predicted protein  43.79 
 
 		 400 aa  289  6e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.926825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1362  26S proteasome subunit P45 family  47 
 
 		 410 aa  288  1e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2301  proteasome-activating nucleotidase  42.73 
 
 		 415 aa  281  1e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85761  26S protease subunit RPT4 (26S protease subunit SUG2) (Proteasomal cap subunit)  40.98 
 
 		 416 aa  278  1e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.341718  normal  0.159026 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28219  predicted protein  44.19 
 
 		 447 aa  274  3e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.473905  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0867  proteasome-activating nucleotidase  40.8 
 
 		 429 aa  273  5.000000000000001e-72  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.199281  normal  0.0151046 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  47.41 
 
 		 740 aa  243  3.9999999999999997e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  46.67 
 
 		 740 aa  242  1e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  53.28 
 
 		 718 aa  241  1e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  46.67 
 
 		 742 aa  241  2e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  46.3 
 
 		 743 aa  238  1e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.89 
 
 		 739 aa  238  1e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.2 
 
 		 732 aa  236  7e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  45.56 
 
 		 742 aa  234  2.0000000000000002e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2451  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.73 
 
 		 804 aa  233  7.000000000000001e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.530015 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2157  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.33 
 
 		 805 aa  232  8.000000000000001e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7058  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  42.71 
 
 		 704 aa  231  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0262  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  43.28 
 
 		 810 aa  230  3e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.32 
 
 		 768 aa  231  3e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0101  AAA family ATPase  43.88 
 
 		 722 aa  229  6e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.63 
 
 		 781 aa  229  9e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.24 
 
 		 784 aa  228  1e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.63 
 
 		 800 aa  228  2e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  46.38 
 
 		 757 aa  227  3e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.28 
 
 		 738 aa  227  4e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.95 
 
 		 719 aa  227  4e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  40.6 
 
 		 769 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  44.23 
 
 		 754 aa  226  5.0000000000000005e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.07 
 
 		 721 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2427  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.83 
 
 		 805 aa  226  6e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50.65 
 
 		 731 aa  226  7e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  51.08 
 
 		 731 aa  225  1e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  50.88 
 
 		 727 aa  225  1e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50.65 
 
 		 731 aa  225  2e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  48.26 
 
 		 754 aa  224  3e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.12 
 
 		 756 aa  224  3e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  42.37 
 
 		 757 aa  224  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0445379  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  43.08 
 
 		 754 aa  223  4e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  42.91 
 
 		 754 aa  223  4.9999999999999996e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.2 
 
 		 781 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50.22 
 
 		 731 aa  223  6e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6826  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.03 
 
 		 757 aa  223  7e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>