More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_71824 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009044  PICST_71824  protease regulatory subunit 8 homolog (SUG1 protein) (CIM3 protein) (TAT-binding protein TBY1)  100 
 
 		 402 aa  816    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01000  endopeptidase, putative  76.35 
 
 		 407 aa  621  1e-177  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.174287  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06988  hypothetical protein similar to proteasome p45/SUG (Broad)  78.12 
 
 		 389 aa  611  9.999999999999999e-175  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.407923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33894  predicted protein  74.36 
 
 		 398 aa  581  1e-164  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00183921  normal  0.0445175 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30067  predicted protein  71.61 
 
 		 403 aa  555  1e-157  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.657092  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1033  proteasome-activating nucleotidase  51.35 
 
 		 408 aa  383  1e-105  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0458  proteasome-activating nucleotidase  50.84 
 
 		 404 aa  363  4e-99  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0937  proteasome-activating nucleotidase  47.11 
 
 		 412 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.274692  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1384  26S proteasome subunit P45 family  48.73 
 
 		 394 aa  355  1e-96  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0469863  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1024  proteasome-activating nucleotidase  45.5 
 
 		 407 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123618  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1038  proteasome-activating nucleotidase  47.54 
 
 		 412 aa  352  8e-96  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.372597  normal  0.687098 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1761  proteasome-activating nucleotidase  45.5 
 
 		 407 aa  350  2e-95  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30617  predicted protein  55.02 
 
 		 443 aa  348  7e-95  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.580577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0920  proteasome-activating nucleotidase  44.97 
 
 		 407 aa  348  9e-95  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1461  proteasome-activating nucleotidase  48.18 
 
 		 436 aa  348  1e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03290  ATPase, putative  45.6 
 
 		 405 aa  347  2e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1305  proteasome-activating nucleotidase  46.78 
 
 		 412 aa  345  8.999999999999999e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0620  proteasome-activating nucleotidase  47.18 
 
 		 431 aa  344  2e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0952  proteasome-activating nucleotidase  45.5 
 
 		 407 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03020  endopeptidase, putative  50 
 
 		 438 aa  339  4e-92  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0528314  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05747  hypothetical protein similar to PSMC6 subunit (Broad)  45.06 
 
 		 393 aa  335  5.999999999999999e-91  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222803  normal  0.0253751 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_41778  predicted protein  58.58 
 
 		 284 aa  332  5e-90  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0751976  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54032  26S protease regulatory subunit 4 homolog (TAT-binding homolog 5)  48.96 
 
 		 434 aa  332  6e-90  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0833723 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29121  predicted protein  51.62 
 
 		 429 aa  331  1e-89  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.429141  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02213  proteasome regulatory particle subunit Rpt2, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07050)  43.52 
 
 		 460 aa  330  2e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0288941 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1174  proteasome-activating nucleotidase  45.86 
 
 		 422 aa  330  4e-89  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.592005 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45122  predicted protein  44 
 
 		 421 aa  329  6e-89  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1492  26S proteasome subunit P45 family  44.1 
 
 		 405 aa  328  7e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0368  proteasome-activating nucleotidase  42.06 
 
 		 403 aa  328  8e-89  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.103097  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03550  endopeptidase, putative  53.55 
 
 		 450 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.502719  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1266  proteasome-activating nucleotidase  47.01 
 
 		 404 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0185  proteasome-activating nucleotidase  44.03 
 
 		 405 aa  326  6e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34331  predicted protein  46.22 
 
 		 400 aa  325  9e-88  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.926825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3362  26S proteasome subunit P45 family  42.16 
 
 		 410 aa  325  9e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75017  protease subunit component  50.48 
 
 		 446 aa  324  1e-87  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0564069 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02917  hypothetical protein similar to 26S proteasome regulatory subunit (Broad)  51.43 
 
 		 443 aa  324  2e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.137848 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2113  proteasome-activating nucleotidase  45.51 
 
 		 426 aa  324  2e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.685736  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28219  predicted protein  45.57 
 
 		 447 aa  323  4e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.473905  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2440  26S proteasome subunit P45 family  43.7 
 
 		 405 aa  322  5e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.683405  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2011  proteasome-activating nucleotidase  43.15 
 
 		 407 aa  318  1e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.705003  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  43.82 
 
 		 393 aa  315  8e-85  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85761  26S protease subunit RPT4 (26S protease subunit SUG2) (Proteasomal cap subunit)  43.54 
 
 		 416 aa  315  9.999999999999999e-85  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.341718  normal  0.159026 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2902  proteasome-activating nucleotidase  42.94 
 
 		 404 aa  314  1.9999999999999998e-84  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.857488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1362  26S proteasome subunit P45 family  41.89 
 
 		 410 aa  311  1e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1040  proteasome-activating nucleotidase  44.1 
 
 		 387 aa  311  2e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.681271 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1307  proteasome-activating nucleotidase  41.3 
 
 		 406 aa  310  4e-83  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.732234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0400  proteasome-activating nucleotidase  42.19 
 
 		 413 aa  309  6.999999999999999e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.583588 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1160  proteasome-activating nucleotidase  42.05 
 
 		 407 aa  308  8e-83  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32343  predicted protein  42.39 
 
 		 425 aa  308  9e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0415891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0507  proteasome-activating nucleotidase  42.5 
 
 		 386 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.56018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11735  predicted protein  41.02 
 
 		 389 aa  306  3e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35070  predicted protein  42.01 
 
 		 417 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0746786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2301  proteasome-activating nucleotidase  44.8 
 
 		 415 aa  305  7e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04236  hypothetical protein similar to TAT-binding protein 1 (Broad)  41.82 
 
 		 465 aa  305  1.0000000000000001e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.110869 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1308  proteasome-activating nucleotidase  45.14 
 
 		 390 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.114545  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03930  endopeptidase, putative  42.01 
 
 		 414 aa  302  5.000000000000001e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0534334  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2275  proteasome-activating nucleotidase  42.66 
 
 		 379 aa  303  5.000000000000001e-81  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.575549  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02904  proteasome regulatory particle subunit Rpt3, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11390)  42.02 
 
 		 422 aa  301  2e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.211289 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01550  endopeptidase, putative  49.83 
 
 		 464 aa  298  9e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.865518  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52887  26S proteasome regulatory subunit  48.63 
 
 		 427 aa  296  4e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1458  proteasome-activating nucleotidase  41.96 
 
 		 389 aa  295  1e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.264354 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66830  26S proteasome regulatory subunit  44.67 
 
 		 410 aa  288  1e-76  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.0000427133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9090  predicted protein  47.47 
 
 		 431 aa  281  1e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0867  proteasome-activating nucleotidase  40.27 
 
 		 429 aa  271  2e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.199281  normal  0.0151046 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.61 
 
 		 723 aa  241  1e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.83 
 
 		 800 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  43.7 
 
 		 757 aa  240  4e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50.65 
 
 		 732 aa  240  4e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.08 
 
 		 784 aa  239  5e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.08 
 
 		 781 aa  239  5e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.94 
 
 		 781 aa  238  1e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  47.2 
 
 		 754 aa  237  2e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  48.56 
 
 		 754 aa  236  6e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  41.33 
 
 		 754 aa  234  2.0000000000000002e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  52.56 
 
 		 719 aa  234  3e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  41.33 
 
 		 754 aa  233  4.0000000000000004e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1115  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.28 
 
 		 638 aa  232  8.000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.48117  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0101  AAA family ATPase  50.87 
 
 		 722 aa  232  1e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.06 
 
 		 737 aa  231  1e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.75 
 
 		 610 aa  231  2e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  47.46 
 
 		 727 aa  231  2e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  46.04 
 
 		 713 aa  230  3e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0665  membrane protease FtsH catalytic subunit  44.88 
 
 		 633 aa  230  4e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.735845  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2318  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.88 
 
 		 633 aa  230  4e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0771513  normal  0.541776 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0566  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.88 
 
 		 633 aa  229  5e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.75 
 
 		 610 aa  229  5e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.34 
 
 		 639 aa  229  6e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.06 
 
 		 738 aa  229  6e-59  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.033227 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0001  Vesicle-fusing ATPase  47.77 
 
 		 699 aa  229  6e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.42 
 
 		 718 aa  229  8e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  45.45 
 
 		 754 aa  228  1e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2361  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.88 
 
 		 637 aa  228  1e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.698046  normal  0.908613 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.64 
 
 		 721 aa  228  1e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.62 
 
 		 768 aa  228  1e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.84 
 
 		 731 aa  227  2e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.67 
 
 		 634 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0690  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.28 
 
 		 631 aa  228  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.827702  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0518  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.03 
 
 		 636 aa  228  2e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000475149  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.84 
 
 		 731 aa  227  2e-58  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  47.92 
 
 		 742 aa  227  3e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>