More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0937 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0937  proteasome-activating nucleotidase  100 
 
 		 412 aa  835    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.274692  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1305  proteasome-activating nucleotidase  71.84 
 
 		 412 aa  616  1e-175  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1038  proteasome-activating nucleotidase  68.45 
 
 		 412 aa  598  1e-170  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.372597  normal  0.687098 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1461  proteasome-activating nucleotidase  71.61 
 
 		 436 aa  593  1e-168  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0458  proteasome-activating nucleotidase  59.64 
 
 		 404 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1384  26S proteasome subunit P45 family  60.78 
 
 		 394 aa  468  9.999999999999999e-131  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0469863  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2113  proteasome-activating nucleotidase  57.37 
 
 		 426 aa  465  9.999999999999999e-131  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.685736  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0620  proteasome-activating nucleotidase  54.27 
 
 		 431 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1174  proteasome-activating nucleotidase  57.03 
 
 		 422 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.592005 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0920  proteasome-activating nucleotidase  56.49 
 
 		 407 aa  430  1e-119  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1024  proteasome-activating nucleotidase  56.49 
 
 		 407 aa  429  1e-119  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123618  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1033  proteasome-activating nucleotidase  55.98 
 
 		 408 aa  425  1e-118  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1761  proteasome-activating nucleotidase  56.22 
 
 		 407 aa  427  1e-118  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0952  proteasome-activating nucleotidase  56.52 
 
 		 407 aa  421  1e-116  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2275  proteasome-activating nucleotidase  52.81 
 
 		 379 aa  399  9.999999999999999e-111  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.575549  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  53.22 
 
 		 393 aa  395  1e-108  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2902  proteasome-activating nucleotidase  47.38 
 
 		 404 aa  379  1e-104  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.857488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1492  26S proteasome subunit P45 family  47.26 
 
 		 405 aa  379  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0368  proteasome-activating nucleotidase  47.93 
 
 		 403 aa  373  1e-102  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.103097  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2440  26S proteasome subunit P45 family  47.99 
 
 		 405 aa  374  1e-102  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.683405  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3362  26S proteasome subunit P45 family  49.36 
 
 		 410 aa  370  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1266  proteasome-activating nucleotidase  48.6 
 
 		 404 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1458  proteasome-activating nucleotidase  49.21 
 
 		 389 aa  362  6e-99  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.264354 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1307  proteasome-activating nucleotidase  51.34 
 
 		 406 aa  361  1e-98  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.732234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1040  proteasome-activating nucleotidase  50.81 
 
 		 387 aa  361  2e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.681271 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2011  proteasome-activating nucleotidase  48.02 
 
 		 407 aa  360  3e-98  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.705003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71824  protease regulatory subunit 8 homolog (SUG1 protein) (CIM3 protein) (TAT-binding protein TBY1)  47.11 
 
 		 402 aa  357  1.9999999999999998e-97  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1308  proteasome-activating nucleotidase  53.37 
 
 		 390 aa  355  7.999999999999999e-97  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.114545  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0507  proteasome-activating nucleotidase  49.87 
 
 		 386 aa  355  1e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.56018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1362  26S proteasome subunit P45 family  49.01 
 
 		 410 aa  354  2e-96  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0185  proteasome-activating nucleotidase  46.97 
 
 		 405 aa  353  2e-96  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1160  proteasome-activating nucleotidase  50.67 
 
 		 407 aa  352  8.999999999999999e-96  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03290  ATPase, putative  47.8 
 
 		 405 aa  346  5e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30617  predicted protein  48.48 
 
 		 443 aa  339  5.9999999999999996e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.580577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45122  predicted protein  45.6 
 
 		 421 aa  338  9e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01000  endopeptidase, putative  45.08 
 
 		 407 aa  338  9.999999999999999e-92  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.174287  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35070  predicted protein  45.36 
 
 		 417 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0746786  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03020  endopeptidase, putative  48.01 
 
 		 438 aa  335  9e-91  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0528314  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06988  hypothetical protein similar to proteasome p45/SUG (Broad)  46.69 
 
 		 389 aa  332  7.000000000000001e-90  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.407923  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05747  hypothetical protein similar to PSMC6 subunit (Broad)  46.38 
 
 		 393 aa  332  1e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222803  normal  0.0253751 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2301  proteasome-activating nucleotidase  47.55 
 
 		 415 aa  330  2e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02213  proteasome regulatory particle subunit Rpt2, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07050)  46.22 
 
 		 460 aa  330  3e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0288941 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54032  26S protease regulatory subunit 4 homolog (TAT-binding homolog 5)  46.34 
 
 		 434 aa  329  4e-89  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0833723 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0400  proteasome-activating nucleotidase  48.08 
 
 		 413 aa  327  3e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.583588 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03930  endopeptidase, putative  45.33 
 
 		 414 aa  326  5e-88  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0534334  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0867  proteasome-activating nucleotidase  45.74 
 
 		 429 aa  325  6e-88  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.199281  normal  0.0151046 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30067  predicted protein  44.27 
 
 		 403 aa  325  1e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.657092  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34331  predicted protein  45.1 
 
 		 400 aa  324  2e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.926825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33894  predicted protein  43.47 
 
 		 398 aa  321  9.999999999999999e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00183921  normal  0.0445175 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32343  predicted protein  44.88 
 
 		 425 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0415891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85761  26S protease subunit RPT4 (26S protease subunit SUG2) (Proteasomal cap subunit)  44.1 
 
 		 416 aa  319  5e-86  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.341718  normal  0.159026 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11735  predicted protein  43.05 
 
 		 389 aa  319  6e-86  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04236  hypothetical protein similar to TAT-binding protein 1 (Broad)  41.8 
 
 		 465 aa  313  2.9999999999999996e-84  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.110869 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52887  26S proteasome regulatory subunit  42.7 
 
 		 427 aa  307  2.0000000000000002e-82  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75017  protease subunit component  45.94 
 
 		 446 aa  307  2.0000000000000002e-82  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0564069 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02904  proteasome regulatory particle subunit Rpt3, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11390)  44.13 
 
 		 422 aa  305  1.0000000000000001e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.211289 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03550  endopeptidase, putative  48.53 
 
 		 450 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.502719  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01550  endopeptidase, putative  41.78 
 
 		 464 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.865518  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66830  26S proteasome regulatory subunit  45.35 
 
 		 410 aa  301  1e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.0000427133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28219  predicted protein  48.69 
 
 		 447 aa  299  6e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.473905  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_41778  predicted protein  53.53 
 
 		 284 aa  298  9e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0751976  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29121  predicted protein  44.14 
 
 		 429 aa  295  1e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.429141  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02917  hypothetical protein similar to 26S proteasome regulatory subunit (Broad)  43.64 
 
 		 443 aa  293  6e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.137848 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9090  predicted protein  47.08 
 
 		 431 aa  291  2e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.85 
 
 		 731 aa  246  4e-64  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  45.34 
 
 		 713 aa  246  4e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.97 
 
 		 731 aa  246  6e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  45.05 
 
 		 754 aa  246  6.999999999999999e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.6 
 
 		 739 aa  246  6.999999999999999e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  45.39 
 
 		 757 aa  245  9e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.92 
 
 		 731 aa  245  9.999999999999999e-64  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  53.16 
 
 		 740 aa  244  3e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.85 
 
 		 723 aa  244  3e-63  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  47.31 
 
 		 738 aa  243  3.9999999999999997e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  42.58 
 
 		 769 aa  243  5e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.47 
 
 		 731 aa  243  6e-63  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  42.77 
 
 		 754 aa  242  7e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  54.67 
 
 		 742 aa  242  7e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2344  Vesicle-fusing ATPase  52.07 
 
 		 703 aa  242  7.999999999999999e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.935246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.87 
 
 		 781 aa  241  1e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  54.22 
 
 		 743 aa  241  1e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.09 
 
 		 768 aa  241  2e-62  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  53.78 
 
 		 740 aa  240  2.9999999999999997e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.07 
 
 		 721 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.61 
 
 		 732 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  48.89 
 
 		 754 aa  239  5e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0001  Vesicle-fusing ATPase  40.44 
 
 		 699 aa  239  5.999999999999999e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.79 
 
 		 701 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2078  cell division cycle protein  47.67 
 
 		 763 aa  237  2e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0596077  normal  0.822776 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1223  AAA family ATPase  52.44 
 
 		 721 aa  238  2e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1594  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  51.26 
 
 		 730 aa  238  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0267229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2884  cell division cycle protein  42.68 
 
 		 764 aa  237  3e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884103  normal  0.239009 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2157  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.45 
 
 		 805 aa  237  3e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1722  peptidase M41, FtsH  49.6 
 
 		 631 aa  237  3e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.139159 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.16 
 
 		 719 aa  237  3e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.2 
 
 		 735 aa  236  5.0000000000000005e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2451  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.72 
 
 		 804 aa  236  6e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.530015 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  53.33 
 
 		 742 aa  236  8e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1034  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.44 
 
 		 510 aa  235  9e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.51 
 
 		 781 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>