More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNJ03290 on replicon NC_006679
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006679  CNJ03290  ATPase, putative  100 
 
 
405 aa  828    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85761  26S protease subunit RPT4 (26S protease subunit SUG2) (Proteasomal cap subunit)  74.87 
 
 
416 aa  598  1e-170  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.341718  normal  0.159026 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05747  hypothetical protein similar to PSMC6 subunit (Broad)  74.42 
 
 
393 aa  596  1e-169  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222803  normal  0.0253751 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34331  predicted protein  69.62 
 
 
400 aa  570  1e-161  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.926825  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45122  predicted protein  70.13 
 
 
421 aa  568  1e-161  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1305  proteasome-activating nucleotidase  54.65 
 
 
412 aa  369  1e-101  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0458  proteasome-activating nucleotidase  49.87 
 
 
404 aa  364  2e-99  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1384  26S proteasome subunit P45 family  48.09 
 
 
394 aa  362  5.0000000000000005e-99  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0469863  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1461  proteasome-activating nucleotidase  49.05 
 
 
436 aa  362  5.0000000000000005e-99  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1024  proteasome-activating nucleotidase  52.12 
 
 
407 aa  359  5e-98  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123618  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0920  proteasome-activating nucleotidase  52.12 
 
 
407 aa  358  7e-98  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1761  proteasome-activating nucleotidase  51.82 
 
 
407 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1033  proteasome-activating nucleotidase  52.15 
 
 
408 aa  350  2e-95  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0952  proteasome-activating nucleotidase  51.49 
 
 
407 aa  350  3e-95  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  46.63 
 
 
393 aa  347  2e-94  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71824  protease regulatory subunit 8 homolog (SUG1 protein) (CIM3 protein) (TAT-binding protein TBY1)  45.6 
 
 
402 aa  347  2e-94  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01000  endopeptidase, putative  46.17 
 
 
407 aa  347  3e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.174287  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0620  proteasome-activating nucleotidase  45.84 
 
 
431 aa  346  5e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0937  proteasome-activating nucleotidase  47.8 
 
 
412 aa  346  5e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.274692  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1038  proteasome-activating nucleotidase  47.8 
 
 
412 aa  345  8.999999999999999e-94  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.372597  normal  0.687098 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03550  endopeptidase, putative  50 
 
 
450 aa  331  1e-89  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.502719  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06988  hypothetical protein similar to proteasome p45/SUG (Broad)  46.88 
 
 
389 aa  328  9e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.407923  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2275  proteasome-activating nucleotidase  44.23 
 
 
379 aa  328  9e-89  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.575549  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3362  26S proteasome subunit P45 family  44.65 
 
 
410 aa  325  1e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33894  predicted protein  48.21 
 
 
398 aa  323  3e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00183921  normal  0.0445175 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02917  hypothetical protein similar to 26S proteasome regulatory subunit (Broad)  48.58 
 
 
443 aa  322  6e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.137848 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29121  predicted protein  47.06 
 
 
429 aa  321  9.999999999999999e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.429141  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75017  protease subunit component  46.88 
 
 
446 aa  318  9e-86  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0564069 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2113  proteasome-activating nucleotidase  43.8 
 
 
426 aa  318  1e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.685736  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30617  predicted protein  41.58 
 
 
443 aa  316  4e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.580577  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30067  predicted protein  45.41 
 
 
403 aa  316  5e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.657092  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2440  26S proteasome subunit P45 family  42.3 
 
 
405 aa  313  4.999999999999999e-84  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.683405  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11735  predicted protein  43.24 
 
 
389 aa  312  5.999999999999999e-84  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0185  proteasome-activating nucleotidase  50.17 
 
 
405 aa  310  2e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28219  predicted protein  47.35 
 
 
447 aa  310  2e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.473905  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02213  proteasome regulatory particle subunit Rpt2, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07050)  44.58 
 
 
460 aa  309  5.9999999999999995e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0288941 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03020  endopeptidase, putative  45.4 
 
 
438 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0528314  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03930  endopeptidase, putative  42.19 
 
 
414 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0534334  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1492  26S proteasome subunit P45 family  42.3 
 
 
405 aa  306  5.0000000000000004e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1174  proteasome-activating nucleotidase  43.56 
 
 
422 aa  305  9.000000000000001e-82  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.592005 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1308  proteasome-activating nucleotidase  47.4 
 
 
390 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.114545  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35070  predicted protein  44.71 
 
 
417 aa  303  5.000000000000001e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0746786  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54032  26S protease regulatory subunit 4 homolog (TAT-binding homolog 5)  40.76 
 
 
434 aa  302  6.000000000000001e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0833723 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1266  proteasome-activating nucleotidase  46.44 
 
 
404 aa  301  9e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1458  proteasome-activating nucleotidase  50.34 
 
 
389 aa  301  1e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.264354 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0368  proteasome-activating nucleotidase  40.43 
 
 
403 aa  301  2e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.103097  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02904  proteasome regulatory particle subunit Rpt3, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11390)  43.5 
 
 
422 aa  300  3e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.211289 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2902  proteasome-activating nucleotidase  40.1 
 
 
404 aa  300  4e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.857488  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32343  predicted protein  49.31 
 
 
425 aa  299  5e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0415891  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2011  proteasome-activating nucleotidase  40.78 
 
 
407 aa  299  7e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.705003  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_41778  predicted protein  50.72 
 
 
284 aa  298  2e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0751976  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0867  proteasome-activating nucleotidase  43.68 
 
 
429 aa  295  1e-78  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.199281  normal  0.0151046 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52887  26S proteasome regulatory subunit  47.47 
 
 
427 aa  293  4e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1160  proteasome-activating nucleotidase  40.68 
 
 
407 aa  292  8e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1362  26S proteasome subunit P45 family  41.58 
 
 
410 aa  291  2e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66830  26S proteasome regulatory subunit  43.2 
 
 
410 aa  290  3e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.0000427133  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04236  hypothetical protein similar to TAT-binding protein 1 (Broad)  46.44 
 
 
465 aa  288  1e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.110869 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0507  proteasome-activating nucleotidase  48.41 
 
 
386 aa  288  1e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.56018  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01550  endopeptidase, putative  44.27 
 
 
464 aa  287  2e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.865518  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1307  proteasome-activating nucleotidase  40.68 
 
 
406 aa  286  4e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.732234  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9090  predicted protein  46.71 
 
 
431 aa  286  5e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1040  proteasome-activating nucleotidase  44.34 
 
 
387 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.681271 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0400  proteasome-activating nucleotidase  41.67 
 
 
413 aa  276  4e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.583588 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2301  proteasome-activating nucleotidase  51.38 
 
 
415 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  42.67 
 
 
738 aa  243  6e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.93 
 
 
739 aa  234  3e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0001  Vesicle-fusing ATPase  42.94 
 
 
699 aa  234  3e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1810  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  50.44 
 
 
715 aa  234  3e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.75 
 
 
719 aa  232  8.000000000000001e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.83 
 
 
768 aa  231  2e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.48 
 
 
732 aa  231  2e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.55 
 
 
662 aa  229  4e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  45.82 
 
 
769 aa  228  1e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  51.39 
 
 
718 aa  228  1e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.96 
 
 
800 aa  228  2e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  43.38 
 
 
727 aa  227  2e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.59 
 
 
781 aa  228  2e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.96 
 
 
781 aa  227  3e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2078  cell division cycle protein  42.65 
 
 
763 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0596077  normal  0.822776 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0101  AAA family ATPase  44.57 
 
 
722 aa  226  8e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0697  AAA ATPase, CDC48  41.67 
 
 
718 aa  225  1e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.56 
 
 
735 aa  224  2e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  48.23 
 
 
759 aa  224  3e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.46 
 
 
760 aa  224  3e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  42.91 
 
 
713 aa  224  3e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.24 
 
 
784 aa  223  4e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.9 
 
 
610 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.17 
 
 
723 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  44.58 
 
 
775 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.49 
 
 
610 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5123  Adenosinetriphosphatase  49.12 
 
 
739 aa  222  9.999999999999999e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2427  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.87 
 
 
805 aa  220  3e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.92 
 
 
721 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  45.56 
 
 
673 aa  220  3.9999999999999997e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  40.97 
 
 
731 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  46.29 
 
 
742 aa  219  6e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0944  FtsH peptidase  44.67 
 
 
626 aa  218  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.129158  normal  0.715931 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1975  FtsH peptidase  44 
 
 
639 aa  218  1e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.182239  hitchhiker  0.00765382 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1770  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.29 
 
 
651 aa  218  1e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.292571  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3506  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.48 
 
 
638 aa  218  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>