More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1248 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  100 
 
 		 393 aa  781    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2275  proteasome-activating nucleotidase  68.63 
 
 		 379 aa  548  1e-155  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.575549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1384  26S proteasome subunit P45 family  58.03 
 
 		 394 aa  431  1e-119  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0469863  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1305  proteasome-activating nucleotidase  56.65 
 
 		 412 aa  404  1e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0937  proteasome-activating nucleotidase  53.22 
 
 		 412 aa  395  1e-109  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.274692  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1038  proteasome-activating nucleotidase  52.49 
 
 		 412 aa  396  1e-109  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.372597  normal  0.687098 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1461  proteasome-activating nucleotidase  55.75 
 
 		 436 aa  398  1e-109  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0952  proteasome-activating nucleotidase  54.02 
 
 		 407 aa  388  1e-107  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0920  proteasome-activating nucleotidase  54.17 
 
 		 407 aa  390  1e-107  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0458  proteasome-activating nucleotidase  56.38 
 
 		 404 aa  389  1e-107  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0620  proteasome-activating nucleotidase  50.27 
 
 		 431 aa  388  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1024  proteasome-activating nucleotidase  53.61 
 
 		 407 aa  387  1e-106  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123618  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1761  proteasome-activating nucleotidase  53.33 
 
 		 407 aa  385  1e-106  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2113  proteasome-activating nucleotidase  49.33 
 
 		 426 aa  383  1e-105  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.685736  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1033  proteasome-activating nucleotidase  51.98 
 
 		 408 aa  377  1e-103  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1174  proteasome-activating nucleotidase  49.32 
 
 		 422 aa  360  2e-98  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.592005 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0185  proteasome-activating nucleotidase  47.19 
 
 		 405 aa  353  2e-96  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1458  proteasome-activating nucleotidase  49.15 
 
 		 389 aa  352  8e-96  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.264354 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3362  26S proteasome subunit P45 family  49.86 
 
 		 410 aa  350  2e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03290  ATPase, putative  46.63 
 
 		 405 aa  347  2e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0507  proteasome-activating nucleotidase  48.6 
 
 		 386 aa  345  6e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.56018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1040  proteasome-activating nucleotidase  48.53 
 
 		 387 aa  345  7e-94  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.681271 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05747  hypothetical protein similar to PSMC6 subunit (Broad)  48.03 
 
 		 393 aa  343  2e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222803  normal  0.0253751 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0368  proteasome-activating nucleotidase  45.67 
 
 		 403 aa  342  9e-93  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.103097  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85761  26S protease subunit RPT4 (26S protease subunit SUG2) (Proteasomal cap subunit)  47.61 
 
 		 416 aa  340  2.9999999999999998e-92  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.341718  normal  0.159026 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2902  proteasome-activating nucleotidase  44.74 
 
 		 404 aa  340  4e-92  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.857488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34331  predicted protein  47.37 
 
 		 400 aa  338  7e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.926825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1492  26S proteasome subunit P45 family  43.69 
 
 		 405 aa  338  7e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1266  proteasome-activating nucleotidase  49.05 
 
 		 404 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0400  proteasome-activating nucleotidase  47.27 
 
 		 413 aa  335  5.999999999999999e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.583588 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1308  proteasome-activating nucleotidase  52.02 
 
 		 390 aa  334  1e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.114545  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2011  proteasome-activating nucleotidase  47.46 
 
 		 407 aa  334  2e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.705003  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03020  endopeptidase, putative  47.43 
 
 		 438 aa  333  4e-90  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0528314  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30617  predicted protein  46.59 
 
 		 443 aa  333  4e-90  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.580577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35070  predicted protein  46.43 
 
 		 417 aa  332  6e-90  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0746786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2440  26S proteasome subunit P45 family  42.89 
 
 		 405 aa  332  9e-90  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.683405  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1307  proteasome-activating nucleotidase  47.59 
 
 		 406 aa  331  2e-89  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.732234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45122  predicted protein  46.58 
 
 		 421 aa  327  3e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02213  proteasome regulatory particle subunit Rpt2, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07050)  45.92 
 
 		 460 aa  325  7e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0288941 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11735  predicted protein  44.54 
 
 		 389 aa  325  7e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03930  endopeptidase, putative  46.01 
 
 		 414 aa  323  3e-87  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0534334  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1160  proteasome-activating nucleotidase  45.61 
 
 		 407 aa  320  3e-86  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54032  26S protease regulatory subunit 4 homolog (TAT-binding homolog 5)  43.37 
 
 		 434 aa  318  9e-86  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0833723 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75017  protease subunit component  50.68 
 
 		 446 aa  317  2e-85  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0564069 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2301  proteasome-activating nucleotidase  42.78 
 
 		 415 aa  317  3e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03550  endopeptidase, putative  48.75 
 
 		 450 aa  316  4e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.502719  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29121  predicted protein  48.43 
 
 		 429 aa  316  5e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.429141  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71824  protease regulatory subunit 8 homolog (SUG1 protein) (CIM3 protein) (TAT-binding protein TBY1)  43.82 
 
 		 402 aa  315  8e-85  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04236  hypothetical protein similar to TAT-binding protein 1 (Broad)  42.74 
 
 		 465 aa  315  9e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.110869 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06988  hypothetical protein similar to proteasome p45/SUG (Broad)  49.23 
 
 		 389 aa  313  3.9999999999999997e-84  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.407923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1362  26S proteasome subunit P45 family  47.04 
 
 		 410 aa  313  3.9999999999999997e-84  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02904  proteasome regulatory particle subunit Rpt3, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11390)  44.85 
 
 		 422 aa  310  2.9999999999999997e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.211289 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52887  26S proteasome regulatory subunit  41.03 
 
 		 427 aa  309  5e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32343  predicted protein  42.15 
 
 		 425 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0415891  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01000  endopeptidase, putative  43.94 
 
 		 407 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.174287  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_41778  predicted protein  53.36 
 
 		 284 aa  303  4.0000000000000003e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0751976  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66830  26S proteasome regulatory subunit  45.59 
 
 		 410 aa  303  4.0000000000000003e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.0000427133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0867  proteasome-activating nucleotidase  44.96 
 
 		 429 aa  302  7.000000000000001e-81  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.199281  normal  0.0151046 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02917  hypothetical protein similar to 26S proteasome regulatory subunit (Broad)  48.38 
 
 		 443 aa  301  1e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.137848 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28219  predicted protein  47.71 
 
 		 447 aa  296  3e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.473905  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01550  endopeptidase, putative  44.23 
 
 		 464 aa  293  3e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.865518  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30067  predicted protein  44.1 
 
 		 403 aa  288  2e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.657092  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9090  predicted protein  45.57 
 
 		 431 aa  287  2.9999999999999996e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33894  predicted protein  42.47 
 
 		 398 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00183921  normal  0.0445175 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  50 
 
 		 727 aa  261  1e-68  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  52.65 
 
 		 736 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.15 
 
 		 610 aa  258  9e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.15 
 
 		 610 aa  258  1e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.28 
 
 		 662 aa  258  2e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.82 
 
 		 737 aa  256  3e-67  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  52.17 
 
 		 731 aa  255  8e-67  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50 
 
 		 615 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.91 
 
 		 781 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.66 
 
 		 614 aa  254  2.0000000000000002e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  51.38 
 
 		 731 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  52.17 
 
 		 731 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0206  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.61 
 
 		 617 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.5 
 
 		 639 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  53.39 
 
 		 768 aa  253  5.000000000000001e-66  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.01 
 
 		 719 aa  252  8.000000000000001e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0518  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.33 
 
 		 636 aa  251  1e-65  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000475149  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  53.72 
 
 		 737 aa  251  2e-65  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50.99 
 
 		 731 aa  251  2e-65  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.62 
 
 		 630 aa  251  2e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0047  cell division protein FtsH, putative  51.52 
 
 		 673 aa  250  3e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.73 
 
 		 732 aa  250  4e-65  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  53.31 
 
 		 738 aa  249  6e-65  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.033227 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0566  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.87 
 
 		 633 aa  249  9e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0665  membrane protease FtsH catalytic subunit  48.87 
 
 		 633 aa  248  9e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.735845  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.18 
 
 		 723 aa  248  9e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2318  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.87 
 
 		 633 aa  248  9e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0771513  normal  0.541776 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50.39 
 
 		 756 aa  248  1e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0690  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50 
 
 		 631 aa  248  1e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.827702  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3570  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.11 
 
 		 673 aa  247  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  54.31 
 
 		 759 aa  247  2e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2543  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.11 
 
 		 673 aa  247  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.42 
 
 		 682 aa  248  2e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.919885  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0091  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.52 
 
 		 625 aa  248  2e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00172576  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  49.03 
 
 		 738 aa  247  3e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0095  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.47 
 
 		 599 aa  246  4e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>