More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_66830 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001306  ANIA_02904  proteasome regulatory particle subunit Rpt3, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11390)  86.79 
 
 		 422 aa  691    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.211289 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66830  26S proteasome regulatory subunit  100 
 
 		 410 aa  825    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.0000427133  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03930  endopeptidase, putative  76.9 
 
 		 414 aa  590  1e-167  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0534334  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35070  predicted protein  73.63 
 
 		 417 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0746786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11735  predicted protein  69.66 
 
 		 389 aa  551  1e-156  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30617  predicted protein  50 
 
 		 443 aa  375  1e-103  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.580577  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03020  endopeptidase, putative  50.69 
 
 		 438 aa  374  1e-102  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0528314  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54032  26S protease regulatory subunit 4 homolog (TAT-binding homolog 5)  49.61 
 
 		 434 aa  371  1e-101  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0833723 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02213  proteasome regulatory particle subunit Rpt2, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07050)  47.45 
 
 		 460 aa  362  9e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0288941 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0458  proteasome-activating nucleotidase  46.48 
 
 		 404 aa  327  3e-88  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0920  proteasome-activating nucleotidase  44.25 
 
 		 407 aa  318  7.999999999999999e-86  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1024  proteasome-activating nucleotidase  44.25 
 
 		 407 aa  317  2e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123618  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0620  proteasome-activating nucleotidase  43.48 
 
 		 431 aa  316  6e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2113  proteasome-activating nucleotidase  45.53 
 
 		 426 aa  315  9e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.685736  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1761  proteasome-activating nucleotidase  45.09 
 
 		 407 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1384  26S proteasome subunit P45 family  47.08 
 
 		 394 aa  313  2.9999999999999996e-84  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0469863  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0952  proteasome-activating nucleotidase  44.72 
 
 		 407 aa  311  1e-83  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0368  proteasome-activating nucleotidase  45.14 
 
 		 403 aa  310  4e-83  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.103097  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1305  proteasome-activating nucleotidase  45.43 
 
 		 412 aa  309  5e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0185  proteasome-activating nucleotidase  44.3 
 
 		 405 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  45.1 
 
 		 393 aa  306  3e-82  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1174  proteasome-activating nucleotidase  43.75 
 
 		 422 aa  306  3e-82  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.592005 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_41778  predicted protein  55.26 
 
 		 284 aa  306  4.0000000000000004e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0751976  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1033  proteasome-activating nucleotidase  42.17 
 
 		 408 aa  302  6.000000000000001e-81  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0937  proteasome-activating nucleotidase  45.35 
 
 		 412 aa  301  1e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.274692  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2902  proteasome-activating nucleotidase  43.41 
 
 		 404 aa  299  6e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.857488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1038  proteasome-activating nucleotidase  44.94 
 
 		 412 aa  298  1e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.372597  normal  0.687098 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1492  26S proteasome subunit P45 family  43.12 
 
 		 405 aa  296  4e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05747  hypothetical protein similar to PSMC6 subunit (Broad)  42.01 
 
 		 393 aa  296  5e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222803  normal  0.0253751 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32343  predicted protein  40.3 
 
 		 425 aa  296  5e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0415891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2440  26S proteasome subunit P45 family  42.59 
 
 		 405 aa  295  9e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.683405  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1461  proteasome-activating nucleotidase  45.16 
 
 		 436 aa  295  1e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45122  predicted protein  41.16 
 
 		 421 aa  295  1e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2275  proteasome-activating nucleotidase  45.59 
 
 		 379 aa  294  2e-78  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.575549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71824  protease regulatory subunit 8 homolog (SUG1 protein) (CIM3 protein) (TAT-binding protein TBY1)  43.56 
 
 		 402 aa  292  9e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85761  26S protease subunit RPT4 (26S protease subunit SUG2) (Proteasomal cap subunit)  43.82 
 
 		 416 aa  291  1e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.341718  normal  0.159026 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03290  ATPase, putative  43.2 
 
 		 405 aa  290  3e-77  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1307  proteasome-activating nucleotidase  44.63 
 
 		 406 aa  286  4e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.732234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3362  26S proteasome subunit P45 family  46.36 
 
 		 410 aa  284  2.0000000000000002e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04236  hypothetical protein similar to TAT-binding protein 1 (Broad)  38.16 
 
 		 465 aa  281  2e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.110869 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1040  proteasome-activating nucleotidase  41.93 
 
 		 387 aa  281  2e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.681271 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52887  26S proteasome regulatory subunit  38.82 
 
 		 427 aa  281  2e-74  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03550  endopeptidase, putative  50.54 
 
 		 450 aa  279  7e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.502719  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30067  predicted protein  43.48 
 
 		 403 aa  277  2e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.657092  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34331  predicted protein  42.02 
 
 		 400 aa  276  4e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.926825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1160  proteasome-activating nucleotidase  42.66 
 
 		 407 aa  276  5e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01000  endopeptidase, putative  41.06 
 
 		 407 aa  276  6e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.174287  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06988  hypothetical protein similar to proteasome p45/SUG (Broad)  44.68 
 
 		 389 aa  275  1.0000000000000001e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.407923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29121  predicted protein  50.19 
 
 		 429 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.429141  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01550  endopeptidase, putative  35.91 
 
 		 464 aa  274  3e-72  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.865518  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1266  proteasome-activating nucleotidase  43.55 
 
 		 404 aa  271  1e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75017  protease subunit component  41.93 
 
 		 446 aa  270  2.9999999999999997e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0564069 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33894  predicted protein  46.43 
 
 		 398 aa  270  4e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00183921  normal  0.0445175 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2011  proteasome-activating nucleotidase  42.86 
 
 		 407 aa  270  4e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.705003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1362  26S proteasome subunit P45 family  42.31 
 
 		 410 aa  268  1e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0507  proteasome-activating nucleotidase  41 
 
 		 386 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.56018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1458  proteasome-activating nucleotidase  41.85 
 
 		 389 aa  266  5.999999999999999e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.264354 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02917  hypothetical protein similar to 26S proteasome regulatory subunit (Broad)  47.14 
 
 		 443 aa  266  7e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.137848 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1308  proteasome-activating nucleotidase  45.28 
 
 		 390 aa  265  8.999999999999999e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.114545  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9090  predicted protein  43.43 
 
 		 431 aa  265  1e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0400  proteasome-activating nucleotidase  38.82 
 
 		 413 aa  258  2e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.583588 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28219  predicted protein  45.21 
 
 		 447 aa  255  1.0000000000000001e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.473905  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0867  proteasome-activating nucleotidase  38.08 
 
 		 429 aa  252  7e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.199281  normal  0.0151046 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2301  proteasome-activating nucleotidase  50.6 
 
 		 415 aa  248  2e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  41.56 
 
 		 757 aa  224  2e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.16 
 
 		 718 aa  223  7e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  51.08 
 
 		 732 aa  222  9e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  42.28 
 
 		 754 aa  219  7.999999999999999e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4836  Microtubule-severing ATPase  46.56 
 
 		 641 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0262  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  48.09 
 
 		 810 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2069  AAA ATPase central domain protein  46.06 
 
 		 776 aa  213  4.9999999999999996e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.963415  normal  0.166628 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.36 
 
 		 731 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.36 
 
 		 731 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  38.32 
 
 		 754 aa  213  7e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.61 
 
 		 736 aa  212  9e-54  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.39 
 
 		 731 aa  211  1e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2884  cell division cycle protein  45.91 
 
 		 764 aa  211  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884103  normal  0.239009 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  45.49 
 
 		 727 aa  211  3e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  47.21 
 
 		 740 aa  210  4e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  40.65 
 
 		 739 aa  210  4e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  46.38 
 
 		 763 aa  209  6e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  40.28 
 
 		 754 aa  209  7e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.28 
 
 		 731 aa  209  8e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.26 
 
 		 723 aa  209  9e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.58 
 
 		 719 aa  209  1e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.8 
 
 		 721 aa  208  1e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  42.75 
 
 		 754 aa  208  1e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.44 
 
 		 768 aa  207  3e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2451  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.58 
 
 		 804 aa  207  3e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.530015 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2344  Vesicle-fusing ATPase  45.49 
 
 		 703 aa  207  3e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.935246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.68 
 
 		 756 aa  207  3e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  46.78 
 
 		 743 aa  206  7e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  46.78 
 
 		 742 aa  206  7e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  44.62 
 
 		 769 aa  205  9e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.53 
 
 		 781 aa  205  1e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.97 
 
 		 800 aa  204  2e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  46.78 
 
 		 759 aa  204  3e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.1 
 
 		 784 aa  204  3e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.1 
 
 		 781 aa  204  3e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.92 
 
 		 735 aa  204  3e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>