More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3362 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3362  26S proteasome subunit P45 family  100 
 
 
410 aa  815    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1362  26S proteasome subunit P45 family  86.34 
 
 
410 aa  696    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1307  proteasome-activating nucleotidase  71.32 
 
 
406 aa  574  1.0000000000000001e-162  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.732234  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1160  proteasome-activating nucleotidase  69.61 
 
 
407 aa  569  1e-161  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2011  proteasome-activating nucleotidase  68.86 
 
 
407 aa  557  1e-157  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.705003  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2902  proteasome-activating nucleotidase  64.29 
 
 
404 aa  508  9.999999999999999e-143  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.857488  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1492  26S proteasome subunit P45 family  64.95 
 
 
405 aa  505  9.999999999999999e-143  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0368  proteasome-activating nucleotidase  64.3 
 
 
403 aa  502  1e-141  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.103097  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2440  26S proteasome subunit P45 family  64.3 
 
 
405 aa  501  1e-140  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.683405  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0185  proteasome-activating nucleotidase  62.07 
 
 
405 aa  481  1e-134  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1040  proteasome-activating nucleotidase  53.24 
 
 
387 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.681271 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1266  proteasome-activating nucleotidase  56.01 
 
 
404 aa  401  9.999999999999999e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1458  proteasome-activating nucleotidase  52.03 
 
 
389 aa  396  1e-109  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.264354 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0400  proteasome-activating nucleotidase  53.24 
 
 
413 aa  394  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.583588 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0507  proteasome-activating nucleotidase  51.8 
 
 
386 aa  387  1e-106  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.56018  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1308  proteasome-activating nucleotidase  55.22 
 
 
390 aa  386  1e-106  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.114545  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1461  proteasome-activating nucleotidase  48.18 
 
 
436 aa  380  1e-104  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1033  proteasome-activating nucleotidase  53.33 
 
 
408 aa  377  1e-103  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0458  proteasome-activating nucleotidase  51.41 
 
 
404 aa  375  1e-102  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0937  proteasome-activating nucleotidase  49.36 
 
 
412 aa  370  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.274692  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2301  proteasome-activating nucleotidase  51.1 
 
 
415 aa  369  1e-101  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1305  proteasome-activating nucleotidase  48.95 
 
 
412 aa  370  1e-101  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0867  proteasome-activating nucleotidase  46.49 
 
 
429 aa  371  1e-101  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.199281  normal  0.0151046 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1384  26S proteasome subunit P45 family  52.62 
 
 
394 aa  367  1e-100  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0469863  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0920  proteasome-activating nucleotidase  52.25 
 
 
407 aa  364  2e-99  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0952  proteasome-activating nucleotidase  52.66 
 
 
407 aa  363  4e-99  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0620  proteasome-activating nucleotidase  50.66 
 
 
431 aa  363  4e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1038  proteasome-activating nucleotidase  47.45 
 
 
412 aa  362  8e-99  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.372597  normal  0.687098 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1024  proteasome-activating nucleotidase  52.25 
 
 
407 aa  361  1e-98  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123618  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1761  proteasome-activating nucleotidase  51.97 
 
 
407 aa  358  9e-98  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  49.86 
 
 
393 aa  350  2e-95  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2275  proteasome-activating nucleotidase  49.46 
 
 
379 aa  348  1e-94  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.575549  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1174  proteasome-activating nucleotidase  45.34 
 
 
422 aa  347  3e-94  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.592005 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2113  proteasome-activating nucleotidase  45.61 
 
 
426 aa  345  1e-93  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.685736  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01000  endopeptidase, putative  42.36 
 
 
407 aa  327  3e-88  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.174287  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32343  predicted protein  50.83 
 
 
425 aa  325  9e-88  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0415891  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03290  ATPase, putative  44.65 
 
 
405 aa  325  1e-87  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71824  protease regulatory subunit 8 homolog (SUG1 protein) (CIM3 protein) (TAT-binding protein TBY1)  42.16 
 
 
402 aa  325  1e-87  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06988  hypothetical protein similar to proteasome p45/SUG (Broad)  47.73 
 
 
389 aa  318  1e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.407923  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33894  predicted protein  45.53 
 
 
398 aa  315  8e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00183921  normal  0.0445175 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04236  hypothetical protein similar to TAT-binding protein 1 (Broad)  49.65 
 
 
465 aa  315  9e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.110869 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03020  endopeptidase, putative  43.28 
 
 
438 aa  313  4.999999999999999e-84  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0528314  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03550  endopeptidase, putative  52.4 
 
 
450 aa  312  5.999999999999999e-84  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.502719  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29121  predicted protein  52.3 
 
 
429 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.429141  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52887  26S proteasome regulatory subunit  48.12 
 
 
427 aa  306  5.0000000000000004e-82  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54032  26S protease regulatory subunit 4 homolog (TAT-binding homolog 5)  42.25 
 
 
434 aa  306  6e-82  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0833723 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01550  endopeptidase, putative  50.54 
 
 
464 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.865518  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30067  predicted protein  44.35 
 
 
403 aa  303  4.0000000000000003e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.657092  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30617  predicted protein  43.19 
 
 
443 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.580577  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45122  predicted protein  43.13 
 
 
421 aa  301  1e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11735  predicted protein  43.32 
 
 
389 aa  300  4e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75017  protease subunit component  49.82 
 
 
446 aa  299  7e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0564069 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34331  predicted protein  41.64 
 
 
400 aa  299  7e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.926825  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02917  hypothetical protein similar to 26S proteasome regulatory subunit (Broad)  49.32 
 
 
443 aa  298  9e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.137848 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28219  predicted protein  51.76 
 
 
447 aa  298  1e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.473905  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9090  predicted protein  49.83 
 
 
431 aa  296  3e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02213  proteasome regulatory particle subunit Rpt2, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07050)  42.07 
 
 
460 aa  296  6e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0288941 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05747  hypothetical protein similar to PSMC6 subunit (Broad)  41.76 
 
 
393 aa  293  5e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222803  normal  0.0253751 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03930  endopeptidase, putative  43.99 
 
 
414 aa  287  2e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0534334  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_41778  predicted protein  49.07 
 
 
284 aa  286  2.9999999999999996e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0751976  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02904  proteasome regulatory particle subunit Rpt3, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11390)  45.91 
 
 
422 aa  286  4e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.211289 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85761  26S protease subunit RPT4 (26S protease subunit SUG2) (Proteasomal cap subunit)  43.47 
 
 
416 aa  284  2.0000000000000002e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.341718  normal  0.159026 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66830  26S proteasome regulatory subunit  46.36 
 
 
410 aa  283  3.0000000000000004e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.0000427133  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35070  predicted protein  43.58 
 
 
417 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0746786  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  56.39 
 
 
742 aa  264  2e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  50.55 
 
 
743 aa  264  2e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  47.59 
 
 
769 aa  263  3e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  50.55 
 
 
742 aa  261  2e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50.19 
 
 
732 aa  261  2e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.98 
 
 
768 aa  259  4e-68  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  49.08 
 
 
740 aa  258  1e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  53.09 
 
 
763 aa  258  1e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  44.9 
 
 
757 aa  258  1e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  50.57 
 
 
754 aa  258  2e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  46.1 
 
 
754 aa  257  3e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  55.07 
 
 
740 aa  256  7e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  46.1 
 
 
727 aa  254  2.0000000000000002e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  47.12 
 
 
754 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.88 
 
 
735 aa  253  3e-66  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  46.56 
 
 
754 aa  253  4.0000000000000004e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.81 
 
 
731 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.61 
 
 
723 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.95 
 
 
719 aa  252  7e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0101  AAA family ATPase  48.66 
 
 
722 aa  252  9.000000000000001e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50.19 
 
 
731 aa  252  1e-65  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  49.13 
 
 
754 aa  252  1e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5123  Adenosinetriphosphatase  50 
 
 
739 aa  251  2e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.07 
 
 
731 aa  249  6e-65  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.39 
 
 
718 aa  249  7e-65  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.45 
 
 
739 aa  248  1e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.07 
 
 
731 aa  248  1e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.74 
 
 
756 aa  248  2e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1594  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.55 
 
 
730 aa  247  3e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0267229  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2157  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.83 
 
 
805 aa  247  3e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  46.1 
 
 
775 aa  246  4e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48 
 
 
808 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  44.26 
 
 
713 aa  245  8e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0801  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  47.23 
 
 
806 aa  245  9e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.704818  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2069  AAA ATPase central domain protein  55.9 
 
 
776 aa  245  9.999999999999999e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.963415  normal  0.166628 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0697  AAA ATPase, CDC48  43.45 
 
 
718 aa  244  9.999999999999999e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>