More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1033 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_1033  proteasome-activating nucleotidase  100 
 
 
408 aa  811    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1024  proteasome-activating nucleotidase  70.66 
 
 
407 aa  584  1e-166  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123618  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1761  proteasome-activating nucleotidase  70.9 
 
 
407 aa  585  1e-166  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0920  proteasome-activating nucleotidase  70.66 
 
 
407 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0952  proteasome-activating nucleotidase  69.68 
 
 
407 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1384  26S proteasome subunit P45 family  56.53 
 
 
394 aa  433  1e-120  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0469863  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1305  proteasome-activating nucleotidase  57.62 
 
 
412 aa  431  1e-119  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0937  proteasome-activating nucleotidase  55.98 
 
 
412 aa  425  1e-118  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.274692  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1461  proteasome-activating nucleotidase  59 
 
 
436 aa  426  1e-118  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1038  proteasome-activating nucleotidase  56.37 
 
 
412 aa  424  1e-117  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.372597  normal  0.687098 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0458  proteasome-activating nucleotidase  59.04 
 
 
404 aa  415  9.999999999999999e-116  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0620  proteasome-activating nucleotidase  52.91 
 
 
431 aa  412  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2113  proteasome-activating nucleotidase  52.99 
 
 
426 aa  403  1e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.685736  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1174  proteasome-activating nucleotidase  52.76 
 
 
422 aa  386  1e-106  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.592005 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1492  26S proteasome subunit P45 family  51.27 
 
 
405 aa  385  1e-106  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0185  proteasome-activating nucleotidase  52.79 
 
 
405 aa  386  1e-106  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71824  protease regulatory subunit 8 homolog (SUG1 protein) (CIM3 protein) (TAT-binding protein TBY1)  51.35 
 
 
402 aa  383  1e-105  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2440  26S proteasome subunit P45 family  52.03 
 
 
405 aa  383  1e-105  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.683405  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  51.98 
 
 
393 aa  377  1e-103  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0368  proteasome-activating nucleotidase  52.78 
 
 
403 aa  378  1e-103  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.103097  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2275  proteasome-activating nucleotidase  52.47 
 
 
379 aa  375  1e-103  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.575549  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3362  26S proteasome subunit P45 family  53.33 
 
 
410 aa  377  1e-103  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2011  proteasome-activating nucleotidase  55.17 
 
 
407 aa  375  1e-103  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.705003  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2902  proteasome-activating nucleotidase  48.72 
 
 
404 aa  369  1e-101  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.857488  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1266  proteasome-activating nucleotidase  51.59 
 
 
404 aa  365  1e-99  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1362  26S proteasome subunit P45 family  54.68 
 
 
410 aa  359  4e-98  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1307  proteasome-activating nucleotidase  54.87 
 
 
406 aa  357  1.9999999999999998e-97  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.732234  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1458  proteasome-activating nucleotidase  49.06 
 
 
389 aa  356  5e-97  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.264354 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1040  proteasome-activating nucleotidase  48.83 
 
 
387 aa  355  7.999999999999999e-97  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.681271 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0507  proteasome-activating nucleotidase  48.79 
 
 
386 aa  354  1e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.56018  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1160  proteasome-activating nucleotidase  49.74 
 
 
407 aa  353  2e-96  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01000  endopeptidase, putative  48.11 
 
 
407 aa  350  2e-95  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.174287  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03290  ATPase, putative  52.15 
 
 
405 aa  350  2e-95  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1308  proteasome-activating nucleotidase  52.54 
 
 
390 aa  348  1e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.114545  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33894  predicted protein  50.4 
 
 
398 aa  347  2e-94  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00183921  normal  0.0445175 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54032  26S protease regulatory subunit 4 homolog (TAT-binding homolog 5)  48.82 
 
 
434 aa  343  2e-93  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0833723 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06988  hypothetical protein similar to proteasome p45/SUG (Broad)  47.99 
 
 
389 aa  343  4e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.407923  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0867  proteasome-activating nucleotidase  47.73 
 
 
429 aa  343  4e-93  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.199281  normal  0.0151046 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03020  endopeptidase, putative  48.14 
 
 
438 aa  342  5.999999999999999e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0528314  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02213  proteasome regulatory particle subunit Rpt2, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07050)  47.48 
 
 
460 aa  342  7e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0288941 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45122  predicted protein  48.96 
 
 
421 aa  340  2.9999999999999998e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30617  predicted protein  47.86 
 
 
443 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.580577  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34331  predicted protein  45.91 
 
 
400 aa  336  2.9999999999999997e-91  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.926825  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11735  predicted protein  44.86 
 
 
389 aa  335  9e-91  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30067  predicted protein  47.67 
 
 
403 aa  334  1e-90  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.657092  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05747  hypothetical protein similar to PSMC6 subunit (Broad)  46.84 
 
 
393 aa  333  3e-90  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222803  normal  0.0253751 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2301  proteasome-activating nucleotidase  50.98 
 
 
415 aa  333  3e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03930  endopeptidase, putative  44.44 
 
 
414 aa  331  1e-89  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0534334  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0400  proteasome-activating nucleotidase  49.71 
 
 
413 aa  331  2e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.583588 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35070  predicted protein  44.35 
 
 
417 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0746786  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85761  26S protease subunit RPT4 (26S protease subunit SUG2) (Proteasomal cap subunit)  46.4 
 
 
416 aa  316  4e-85  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.341718  normal  0.159026 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01550  endopeptidase, putative  48.25 
 
 
464 aa  315  7e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.865518  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32343  predicted protein  44.05 
 
 
425 aa  315  9.999999999999999e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0415891  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02904  proteasome regulatory particle subunit Rpt3, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11390)  41.52 
 
 
422 aa  313  2.9999999999999996e-84  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.211289 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_41778  predicted protein  56.88 
 
 
284 aa  309  6.999999999999999e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0751976  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75017  protease subunit component  44.86 
 
 
446 aa  306  6e-82  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0564069 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04236  hypothetical protein similar to TAT-binding protein 1 (Broad)  47.48 
 
 
465 aa  305  1.0000000000000001e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.110869 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03550  endopeptidase, putative  48.99 
 
 
450 aa  303  5.000000000000001e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.502719  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66830  26S proteasome regulatory subunit  43.06 
 
 
410 aa  301  1e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.0000427133  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52887  26S proteasome regulatory subunit  46.69 
 
 
427 aa  299  6e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9090  predicted protein  46.84 
 
 
431 aa  298  9e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29121  predicted protein  47.64 
 
 
429 aa  297  2e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.429141  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28219  predicted protein  48.15 
 
 
447 aa  296  5e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.473905  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02917  hypothetical protein similar to 26S proteasome regulatory subunit (Broad)  44.41 
 
 
443 aa  291  2e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.137848 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  52.3 
 
 
732 aa  270  5e-71  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  58.59 
 
 
727 aa  261  2e-68  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.83 
 
 
719 aa  258  1e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0101  AAA family ATPase  55.65 
 
 
722 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  44.14 
 
 
769 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  41.51 
 
 
754 aa  254  3e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.86 
 
 
768 aa  254  3e-66  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.55 
 
 
739 aa  253  3e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  43.37 
 
 
754 aa  253  4.0000000000000004e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.21 
 
 
723 aa  251  1e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  44.34 
 
 
754 aa  251  2e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.23 
 
 
701 aa  250  3e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  43.32 
 
 
757 aa  248  9e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  53.28 
 
 
713 aa  248  2e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  48.12 
 
 
754 aa  248  2e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0518  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51 
 
 
636 aa  247  3e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000475149  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.45 
 
 
781 aa  246  4e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1810  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  46.98 
 
 
715 aa  246  6e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.55 
 
 
756 aa  246  6e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  55.65 
 
 
718 aa  246  8e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  47.35 
 
 
740 aa  244  9.999999999999999e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7058  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  45.92 
 
 
704 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.02 
 
 
784 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  48.24 
 
 
775 aa  244  3e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.91 
 
 
800 aa  243  3e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  52.34 
 
 
754 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  54.78 
 
 
731 aa  243  5e-63  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  51.29 
 
 
781 aa  243  6e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.44 
 
 
731 aa  243  6e-63  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  54.39 
 
 
742 aa  242  7.999999999999999e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.84 
 
 
731 aa  242  9e-63  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3020  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  44.29 
 
 
709 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  54.78 
 
 
731 aa  241  1e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1223  AAA family ATPase  49.79 
 
 
721 aa  242  1e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  51.54 
 
 
721 aa  241  1e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.94 
 
 
735 aa  241  1e-62  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>