More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_30067 on replicon NC_011688
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011688  PHATRDRAFT_30067  predicted protein  100 
 
 		 403 aa  832    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.657092  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01000  endopeptidase, putative  71.94 
 
 		 407 aa  587  1e-167  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.174287  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71824  protease regulatory subunit 8 homolog (SUG1 protein) (CIM3 protein) (TAT-binding protein TBY1)  72.66 
 
 		 402 aa  580  1e-164  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33894  predicted protein  75.26 
 
 		 398 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00183921  normal  0.0445175 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06988  hypothetical protein similar to proteasome p45/SUG (Broad)  70.57 
 
 		 389 aa  541  1e-153  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.407923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0458  proteasome-activating nucleotidase  51.18 
 
 		 404 aa  349  5e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1033  proteasome-activating nucleotidase  48.22 
 
 		 408 aa  348  8e-95  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1038  proteasome-activating nucleotidase  47.53 
 
 		 412 aa  347  2e-94  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.372597  normal  0.687098 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1384  26S proteasome subunit P45 family  48.15 
 
 		 394 aa  343  2.9999999999999997e-93  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0469863  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0937  proteasome-activating nucleotidase  45.6 
 
 		 412 aa  341  2e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.274692  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03550  endopeptidase, putative  54.95 
 
 		 450 aa  338  9e-92  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.502719  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1461  proteasome-activating nucleotidase  45.48 
 
 		 436 aa  334  2e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28219  predicted protein  53.7 
 
 		 447 aa  333  2e-90  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.473905  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1305  proteasome-activating nucleotidase  43.48 
 
 		 412 aa  333  3e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0920  proteasome-activating nucleotidase  43.78 
 
 		 407 aa  333  4e-90  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29121  predicted protein  54.85 
 
 		 429 aa  332  7.000000000000001e-90  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.429141  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1024  proteasome-activating nucleotidase  43.78 
 
 		 407 aa  330  3e-89  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123618  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75017  protease subunit component  52.9 
 
 		 446 aa  330  4e-89  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0564069 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03290  ATPase, putative  46.19 
 
 		 405 aa  329  6e-89  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1761  proteasome-activating nucleotidase  43.78 
 
 		 407 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1174  proteasome-activating nucleotidase  44.19 
 
 		 422 aa  327  3e-88  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.592005 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30617  predicted protein  53.11 
 
 		 443 aa  326  6e-88  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.580577  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03020  endopeptidase, putative  51.78 
 
 		 438 aa  325  1e-87  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0528314  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0368  proteasome-activating nucleotidase  50.85 
 
 		 403 aa  323  3e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.103097  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1266  proteasome-activating nucleotidase  52.16 
 
 		 404 aa  322  5e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0952  proteasome-activating nucleotidase  46.15 
 
 		 407 aa  322  7e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0185  proteasome-activating nucleotidase  45.45 
 
 		 405 aa  322  8e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02917  hypothetical protein similar to 26S proteasome regulatory subunit (Broad)  52.23 
 
 		 443 aa  321  9.999999999999999e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.137848 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54032  26S protease regulatory subunit 4 homolog (TAT-binding homolog 5)  50.65 
 
 		 434 aa  321  9.999999999999999e-87  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0833723 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02213  proteasome regulatory particle subunit Rpt2, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07050)  50.17 
 
 		 460 aa  320  3e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0288941 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_41778  predicted protein  58.65 
 
 		 284 aa  318  7e-86  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0751976  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45122  predicted protein  44.99 
 
 		 421 aa  316  5e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3362  26S proteasome subunit P45 family  45.2 
 
 		 410 aa  315  7e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0620  proteasome-activating nucleotidase  43.84 
 
 		 431 aa  312  4.999999999999999e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05747  hypothetical protein similar to PSMC6 subunit (Broad)  43.98 
 
 		 393 aa  311  1e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222803  normal  0.0253751 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2902  proteasome-activating nucleotidase  50.17 
 
 		 404 aa  310  2.9999999999999997e-83  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.857488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1492  26S proteasome subunit P45 family  49.32 
 
 		 405 aa  309  5e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34331  predicted protein  45.45 
 
 		 400 aa  309  5.9999999999999995e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.926825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2440  26S proteasome subunit P45 family  43.63 
 
 		 405 aa  308  1.0000000000000001e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.683405  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1160  proteasome-activating nucleotidase  47.22 
 
 		 407 aa  306  4.0000000000000004e-82  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2011  proteasome-activating nucleotidase  41.46 
 
 		 407 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.705003  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04236  hypothetical protein similar to TAT-binding protein 1 (Broad)  49.83 
 
 		 465 aa  303  5.000000000000001e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.110869 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1040  proteasome-activating nucleotidase  43.01 
 
 		 387 aa  302  7.000000000000001e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.681271 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1362  26S proteasome subunit P45 family  49.49 
 
 		 410 aa  302  7.000000000000001e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  44.94 
 
 		 393 aa  301  1e-80  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0507  proteasome-activating nucleotidase  42.86 
 
 		 386 aa  301  1e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.56018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32343  predicted protein  50.86 
 
 		 425 aa  301  1e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0415891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1307  proteasome-activating nucleotidase  46.86 
 
 		 406 aa  300  4e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.732234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2113  proteasome-activating nucleotidase  40.85 
 
 		 426 aa  298  9e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.685736  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85761  26S protease subunit RPT4 (26S protease subunit SUG2) (Proteasomal cap subunit)  45.14 
 
 		 416 aa  296  4e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.341718  normal  0.159026 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11735  predicted protein  45.48 
 
 		 389 aa  295  8e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35070  predicted protein  44.09 
 
 		 417 aa  294  1e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0746786  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02904  proteasome regulatory particle subunit Rpt3, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11390)  42.64 
 
 		 422 aa  293  3e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.211289 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1308  proteasome-activating nucleotidase  47.93 
 
 		 390 aa  293  4e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.114545  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0400  proteasome-activating nucleotidase  42.94 
 
 		 413 aa  292  8e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.583588 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03930  endopeptidase, putative  41.76 
 
 		 414 aa  291  2e-77  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0534334  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2275  proteasome-activating nucleotidase  42.24 
 
 		 379 aa  287  2e-76  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.575549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52887  26S proteasome regulatory subunit  48.3 
 
 		 427 aa  287  2e-76  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1458  proteasome-activating nucleotidase  42.7 
 
 		 389 aa  286  4e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.264354 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66830  26S proteasome regulatory subunit  43.91 
 
 		 410 aa  285  9e-76  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.0000427133  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01550  endopeptidase, putative  50 
 
 		 464 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.865518  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2301  proteasome-activating nucleotidase  42.74 
 
 		 415 aa  283  5.000000000000001e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9090  predicted protein  47.14 
 
 		 431 aa  277  2e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0867  proteasome-activating nucleotidase  41.44 
 
 		 429 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.199281  normal  0.0151046 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  40.74 
 
 		 723 aa  238  2e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.15 
 
 		 719 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.03 
 
 		 732 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.79 
 
 		 781 aa  232  7.000000000000001e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.81 
 
 		 781 aa  232  1e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  45.97 
 
 		 757 aa  232  1e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.36 
 
 		 784 aa  231  2e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.92 
 
 		 800 aa  231  2e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  45.75 
 
 		 754 aa  230  3e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.42 
 
 		 735 aa  225  1e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2884  cell division cycle protein  45.28 
 
 		 764 aa  225  1e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884103  normal  0.239009 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  40.61 
 
 		 738 aa  225  1e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.15 
 
 		 731 aa  225  1e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.92 
 
 		 718 aa  224  2e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  48.47 
 
 		 727 aa  224  3e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.71 
 
 		 639 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1115  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.9 
 
 		 638 aa  222  8e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.48117  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.22 
 
 		 737 aa  222  9e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2078  cell division cycle protein  44.53 
 
 		 763 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0596077  normal  0.822776 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46 
 
 		 731 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.23 
 
 		 633 aa  222  9.999999999999999e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33311  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1180  cell division protein FtsH  44.49 
 
 		 617 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334987  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0665  membrane protease FtsH catalytic subunit  44.9 
 
 		 633 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.735845  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0566  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.9 
 
 		 633 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2318  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.9 
 
 		 633 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0771513  normal  0.541776 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.78 
 
 		 731 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0426  FtsH peptidase  44.72 
 
 		 652 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.405966  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.94 
 
 		 738 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.033227 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.02 
 
 		 731 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1606  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.76 
 
 		 660 aa  220  3e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  44.74 
 
 		 713 aa  220  3.9999999999999997e-56  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.83 
 
 		 756 aa  219  6e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0690  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.9 
 
 		 631 aa  219  6e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.827702  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0001  Vesicle-fusing ATPase  47.15 
 
 		 699 aa  219  8.999999999999998e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3083  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.67 
 
 		 640 aa  218  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2393  FtsH peptidase  43.27 
 
 		 619 aa  218  1e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00023499  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>