More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_2059 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03043  protease, ATP-dependent zinc-metallo  53.07 
 
 		 644 aa  641    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000537455  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0529  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.8 
 
 		 647 aa  642    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000027152  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.83 
 
 		 608 aa  677    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  57.84 
 
 		 614 aa  704    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4718  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.16 
 
 		 637 aa  649    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.518421  normal  0.0121069 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0150  cell division protein FtsH, putative  54.38 
 
 		 700 aa  662    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  54.25 
 
 		 638 aa  655    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3288  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.49 
 
 		 657 aa  655    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000787677  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0533  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.58 
 
 		 697 aa  664    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.37995  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0063  cell division protein FtsH  56.87 
 
 		 633 aa  723    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3452  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.16 
 
 		 660 aa  637    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.380893  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.43 
 
 		 614 aa  679    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1197  cell division protein FtsH  51.35 
 
 		 649 aa  654    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4497  cell division protein FtsH  54.37 
 
 		 634 aa  652    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.554573  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0064  cell division protein FtsH  56.71 
 
 		 633 aa  722    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.651636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0060  cell division protein  56.71 
 
 		 633 aa  722    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0060  cell division protein  56.71 
 
 		 633 aa  722    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.527958  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2834  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.05 
 
 		 655 aa  666    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000517945  normal  0.0155634 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2842  cell division protease ftsH  53.7 
 
 		 639 aa  643    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2711  cell division protease ftsH  53.7 
 
 		 639 aa  643    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4187  peptidase M41, FtsH  54.7 
 
 		 634 aa  655    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000128423  normal  0.66671 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02471  cell division protein FtsH2  53.58 
 
 		 617 aa  637    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3370  ATP-dependent metalloprotease  52.8 
 
 		 647 aa  642    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.23805e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2895  Mername-AA223 peptidase  64.75 
 
 		 682 aa  667    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.44 
 
 		 639 aa  736    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0211  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.23 
 
 		 655 aa  639    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4509  membrane protease FtsH catalytic subunit  55.81 
 
 		 652 aa  656    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1133  membrane protease FtsH catalytic subunit  54.55 
 
 		 630 aa  640    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0177636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2710  peptidase M41, FtsH  52.5 
 
 		 640 aa  635    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0575  FtsH peptidase  55.59 
 
 		 613 aa  648    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0102882  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3615  membrane protease FtsH catalytic subunit  54.49 
 
 		 640 aa  655    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0280177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2569  peptidase M41, FtsH  53.26 
 
 		 641 aa  655    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000845189  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0772  membrane protease FtsH catalytic subunit  53.78 
 
 		 635 aa  641    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000087079  normal  0.0618887 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  57 
 
 		 616 aa  717    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1268  membrane protease FtsH catalytic subunit  52.23 
 
 		 640 aa  650    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399956  normal  0.37717 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5471  cell division protein FtsH  55.14 
 
 		 642 aa  645    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4361  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.91 
 
 		 640 aa  664    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0166  cell division protein FtsH  49.84 
 
 		 651 aa  640    Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000721667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0546  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.58 
 
 		 697 aa  664    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  57.36 
 
 		 608 aa  708    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  56.38 
 
 		 665 aa  710    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000097295  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3602  ATP-dependent metalloprotease  51.92 
 
 		 644 aa  651    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000683259  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0064  cell division protein FtsH  56.71 
 
 		 633 aa  722    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550597  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0228  cell division protein FtsH2  53.18 
 
 		 617 aa  635    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.288231  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0297  FtsH peptidase  55.65 
 
 		 613 aa  658    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0483  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.37 
 
 		 631 aa  649    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000161272  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.5 
 
 		 638 aa  665    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0105  FtsH-2 peptidase  70.54 
 
 		 645 aa  842    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0152057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6874  cell division protein FtsH  52.79 
 
 		 638 aa  637    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0972491 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1495  FtsH peptidase  56.32 
 
 		 635 aa  669    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.629279  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0357  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.76 
 
 		 613 aa  644    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0125367  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1818  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.29 
 
 		 638 aa  642    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192895  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3612  ATP-dependent metalloprotease  53.07 
 
 		 644 aa  640    Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000242003  normal  0.275176 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0366  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.6 
 
 		 641 aa  639    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.444728  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4584  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.44 
 
 		 634 aa  649    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2011  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.74 
 
 		 639 aa  637    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4743  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.37 
 
 		 638 aa  637    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0783  membrane protease FtsH catalytic subunit  51.8 
 
 		 631 aa  643    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000394436  unclonable  0.000000272669 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2852  membrane protease FtsH catalytic subunit  51.18 
 
 		 640 aa  652    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2841  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.57 
 
 		 657 aa  655    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000356985  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1000  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.57 
 
 		 656 aa  652    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000544697  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4141  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.96 
 
 		 638 aa  636    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.07 
 
 		 634 aa  660    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3506  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.46 
 
 		 638 aa  638    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3246  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.49 
 
 		 657 aa  655    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000231825  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.86 
 
 		 610 aa  700    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3083  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.09 
 
 		 640 aa  635    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0064  FtsH peptidase  55.5 
 
 		 637 aa  679    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1599  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.36 
 
 		 647 aa  654    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.238697 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.53 
 
 		 599 aa  656    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000844037  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1806  ATP-dependent metalloprotease FtsH  63.75 
 
 		 651 aa  644    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266956  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2185  FtsH-2 peptidase  57.45 
 
 		 627 aa  683    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1571  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.04 
 
 		 656 aa  642    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000144806  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  51.29 
 
 		 645 aa  639    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2786  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.31 
 
 		 601 aa  671    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2472  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.38 
 
 		 601 aa  671    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0725  FtsH peptidase  54.21 
 
 		 612 aa  649    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0206  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.79 
 
 		 617 aa  672    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1019  membrane protease FtsH catalytic subunit  51.51 
 
 		 657 aa  657    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000780208  hitchhiker  0.000608132 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1084  membrane protease FtsH catalytic subunit  51.51 
 
 		 657 aa  658    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000445375  normal  0.0888545 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1975  FtsH peptidase  53.3 
 
 		 639 aa  639    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.182239  hitchhiker  0.00765382 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0983  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.79 
 
 		 657 aa  663    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000296667  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0095  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.63 
 
 		 599 aa  761    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02481  cell division protein FtsH2  53.91 
 
 		 617 aa  641    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62860  cell division protein FtsH  55.43 
 
 		 639 aa  645    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2734  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.04 
 
 		 617 aa  667    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000099937  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  70.71 
 
 		 615 aa  894    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.05 
 
 		 652 aa  691    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0370  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.62 
 
 		 604 aa  664    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000686263  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  53.75 
 
 		 673 aa  667    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1023  membrane protease FtsH catalytic subunit  51.35 
 
 		 657 aa  655    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000161981  hitchhiker  0.0000832625 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0204  Mername-AA223 peptidase  57.33 
 
 		 654 aa  671    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.176031  normal  0.159439 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.99 
 
 		 621 aa  693    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.72 
 
 		 645 aa  653    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03404  hypothetical protein  49.92 
 
 		 658 aa  645    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0954  vesicle-fusing ATPase  53.21 
 
 		 650 aa  654    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000306538  normal  0.326508 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2611  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.86 
 
 		 642 aa  649    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2383  FtsH peptidase  51.5 
 
 		 639 aa  652    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3355  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.53 
 
 		 647 aa  662    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0224278  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1787  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.36 
 
 		 656 aa  675    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.124146 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>