More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1806 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.6 
 
 
607 aa  636    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2895  Mername-AA223 peptidase  67.68 
 
 
682 aa  675    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.73 
 
 
602 aa  651    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0064  ATP-dependent metalloprotease FtsH  67.46 
 
 
635 aa  655    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0616  ATP-dependent metalloprotease FtsH  67.16 
 
 
662 aa  652    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  63.75 
 
 
639 aa  657    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  67.46 
 
 
632 aa  657    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3447  ATP-dependent metalloprotease FtsH  66.39 
 
 
679 aa  661    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.311187  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.74 
 
 
611 aa  647    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0297  FtsH peptidase  57.32 
 
 
613 aa  643    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0229  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.69 
 
 
608 aa  645    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.7 
 
 
639 aa  637    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.92 
 
 
630 aa  639    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.810549  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4314  Mername-AA223 peptidase  64.83 
 
 
753 aa  642    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.51 
 
 
684 aa  637    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.447508 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0081  FtsH-2 peptidase. Metallo peptidase. MEROPS family M41, membrane protease FtsH catalytic subunit  64.52 
 
 
693 aa  641    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00746794  normal  0.780653 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9175  Microtubule-severing ATPase  63.31 
 
 
656 aa  653    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8426  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.87 
 
 
672 aa  658    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1806  ATP-dependent metalloprotease FtsH  100 
 
 
651 aa  1310    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266956  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2185  FtsH-2 peptidase  84.23 
 
 
627 aa  1021    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.67 
 
 
616 aa  642    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0627  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.23 
 
 
682 aa  637    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0250398  normal  0.798069 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4970  ATP-dependent metalloprotease FtsH  66.39 
 
 
685 aa  645    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.259213 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.89 
 
 
615 aa  661    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0298  ATP-dependent metalloprotease FtsH  67.44 
 
 
753 aa  651    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.43 
 
 
630 aa  641    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0204  Mername-AA223 peptidase  67.47 
 
 
654 aa  683    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.176031  normal  0.159439 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4505  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.63 
 
 
672 aa  656    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0444  Mername-AA223 peptidase  64.45 
 
 
681 aa  635    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0145  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.65 
 
 
657 aa  642    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000285756  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1673  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.52 
 
 
653 aa  667    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.720537  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.67 
 
 
616 aa  642    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3029  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.65 
 
 
651 aa  634  1e-180  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0253083  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0063  cell division protein FtsH  63.92 
 
 
633 aa  633  1e-180  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32090  membrane protease FtsH catalytic subunit  59.55 
 
 
684 aa  634  1e-180  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02180  membrane protease FtsH catalytic subunit  59.76 
 
 
759 aa  633  1e-180  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.203861  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4361  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.11 
 
 
640 aa  632  1e-180  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  58.94 
 
 
616 aa  632  1e-180  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0105  FtsH-2 peptidase  59.08 
 
 
645 aa  634  1e-180  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0152057  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3575  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.8 
 
 
616 aa  634  1e-180  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.873251 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3755  FtsH peptidase  60.04 
 
 
613 aa  634  1e-180  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.916692 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.17 
 
 
687 aa  632  1e-180  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.45 
 
 
643 aa  634  1e-180  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0073  cell division protein FtsH  63.71 
 
 
633 aa  631  1e-179  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.755624 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0064  cell division protein FtsH  63.71 
 
 
633 aa  631  1e-179  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.651636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0060  cell division protein  63.71 
 
 
633 aa  631  1e-179  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0060  cell division protein  63.71 
 
 
633 aa  631  1e-179  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.527958  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0076  cell division protein FtsH  63.71 
 
 
633 aa  631  1e-179  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0454651  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0533  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.88 
 
 
697 aa  630  1e-179  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.37995  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0206  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.76 
 
 
617 aa  629  1e-179  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0064  cell division protein FtsH  63.71 
 
 
633 aa  631  1e-179  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550597  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2987  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.77 
 
 
669 aa  628  1e-179  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.832035  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0313  ATP-dependent metalloprotease FtsH  65.58 
 
 
743 aa  629  1e-179  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0064  FtsH peptidase  59.39 
 
 
637 aa  630  1e-179  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0835  ATP-dependent metalloprotease FtsH  66.02 
 
 
671 aa  631  1e-179  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0343776  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0546  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.88 
 
 
697 aa  630  1e-179  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0072  cell division protein FtsH  63.71 
 
 
633 aa  630  1e-179  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.12055  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0151  Mername-AA223 peptidase  54.88 
 
 
689 aa  631  1e-179  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0150  cell division protein FtsH, putative  56.67 
 
 
700 aa  626  1e-178  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0575  FtsH peptidase  58.7 
 
 
613 aa  625  1e-178  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0102882  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.91 
 
 
638 aa  628  1e-178  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1852  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.74 
 
 
612 aa  627  1e-178  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3612  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4744  ATP-dependent metalloprotease FtsH  64.45 
 
 
669 aa  626  1e-178  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000616135 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35650  membrane protease FtsH catalytic subunit  60.12 
 
 
798 aa  628  1e-178  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.399414  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0357  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.3 
 
 
613 aa  627  1e-178  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0125367  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  56.35 
 
 
614 aa  622  1e-177  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5244  cell division protein FtsH  63.29 
 
 
633 aa  624  1e-177  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.293032 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.09 
 
 
676 aa  622  1e-177  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02471  cell division protein FtsH2  58.3 
 
 
617 aa  624  1e-177  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  64.45 
 
 
671 aa  625  1e-177  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.066161 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  63.29 
 
 
633 aa  624  1e-177  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.04 
 
 
610 aa  622  1e-177  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2664  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.4 
 
 
656 aa  624  1e-177  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00646659 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02481  cell division protein FtsH2  58.11 
 
 
617 aa  623  1e-177  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3615  membrane protease FtsH catalytic subunit  61.2 
 
 
640 aa  622  1e-177  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0280177  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0538  ATP-dependent metalloprotease FtsH  64.81 
 
 
659 aa  624  1e-177  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0673684  normal  0.0150565 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.7 
 
 
620 aa  622  1e-177  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.24 
 
 
610 aa  622  1e-177  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58 
 
 
637 aa  623  1e-177  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0503698  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.82 
 
 
793 aa  621  1e-176  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0228  cell division protein FtsH2  57.92 
 
 
617 aa  620  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.288231  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  56.86 
 
 
645 aa  619  1e-176  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02030  membrane protease FtsH catalytic subunit  61.79 
 
 
783 aa  621  1e-176  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000829689  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.44 
 
 
652 aa  620  1e-176  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.16 
 
 
614 aa  621  1e-176  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0714  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.67 
 
 
634 aa  617  1e-175  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.87442  normal  0.0617842 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4719  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.6 
 
 
634 aa  616  1e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  57.82 
 
 
665 aa  617  1e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000097295  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5471  cell division protein FtsH  59.81 
 
 
642 aa  617  1e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62860  cell division protein FtsH  59.81 
 
 
639 aa  617  1e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42890  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61 
 
 
637 aa  616  1e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.84 
 
 
608 aa  613  9.999999999999999e-175  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  56.57 
 
 
638 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.2 
 
 
612 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0981  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.54 
 
 
637 aa  613  9.999999999999999e-175  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38316  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  63.27 
 
 
634 aa  612  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  56.44 
 
 
608 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01240  membrane protease FtsH catalytic subunit  56.33 
 
 
696 aa  613  9.999999999999999e-175  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0426  FtsH peptidase  57.93 
 
 
652 aa  613  9.999999999999999e-175  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.405966  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2896  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.77 
 
 
750 aa  613  9.999999999999999e-175  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>