More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0313 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_35650  membrane protease FtsH catalytic subunit  71.17 
 
 		 798 aa  1082    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.399414  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.25 
 
 		 684 aa  723    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.447508 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0616  ATP-dependent metalloprotease FtsH  67.24 
 
 		 662 aa  826    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0835  ATP-dependent metalloprotease FtsH  64.38 
 
 		 671 aa  817    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0343776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24780  membrane protease FtsH catalytic subunit  55.1 
 
 		 698 aa  680    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4970  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.96 
 
 		 685 aa  754    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.259213 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0298  ATP-dependent metalloprotease FtsH  64.47 
 
 		 753 aa  758    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4505  ATP-dependent metalloprotease FtsH  63.24 
 
 		 672 aa  767    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2895  Mername-AA223 peptidase  64.22 
 
 		 682 aa  801    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01240  membrane protease FtsH catalytic subunit  56.67 
 
 		 696 aa  695    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0538  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.28 
 
 		 659 aa  749    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0673684  normal  0.0150565 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  69.85 
 
 		 760 aa  980    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13642  cell division protein ftsH (membrane-bound protease)  68.19 
 
 		 760 aa  924    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052338 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9175  Microtubule-severing ATPase  61.46 
 
 		 656 aa  783    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5156  Mername-AA223 peptidase  67.32 
 
 		 784 aa  900    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1673  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.97 
 
 		 653 aa  642    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.720537  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0627  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.96 
 
 		 682 aa  720    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0250398  normal  0.798069 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0559  ATP-dependent metalloprotease FtsH  69.25 
 
 		 801 aa  868    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8426  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.76 
 
 		 672 aa  771    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4314  Mername-AA223 peptidase  66.28 
 
 		 753 aa  759    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2104  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.94 
 
 		 677 aa  689    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  64.01 
 
 		 793 aa  895    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  65.99 
 
 		 671 aa  831    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.066161 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32090  membrane protease FtsH catalytic subunit  58.98 
 
 		 684 aa  726    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2987  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.91 
 
 		 669 aa  723    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.832035  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.75 
 
 		 643 aa  645    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4770  Mername-AA223 peptidase  66.9 
 
 		 783 aa  895    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2185  FtsH-2 peptidase  55.61 
 
 		 627 aa  655    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4744  ATP-dependent metalloprotease FtsH  63.81 
 
 		 669 aa  842    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000616135 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.82 
 
 		 615 aa  644    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0313  ATP-dependent metalloprotease FtsH  100 
 
 		 743 aa  1512    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1416  ATP-dependent metalloprotease FtsH  67.13 
 
 		 794 aa  906    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0495193  normal  0.256654 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0151  Mername-AA223 peptidase  58.35 
 
 		 689 aa  713    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.09 
 
 		 687 aa  706    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0204  Mername-AA223 peptidase  63.01 
 
 		 654 aa  797    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.176031  normal  0.159439 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12800  membrane protease FtsH catalytic subunit  53.9 
 
 		 704 aa  657    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.113847  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0444  Mername-AA223 peptidase  55.89 
 
 		 681 aa  721    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4856  Mername-AA223 peptidase  66.9 
 
 		 783 aa  895    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5372  ATP-dependent metalloprotease FtsH  67.71 
 
 		 781 aa  922    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00418248 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3447  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.27 
 
 		 679 aa  777    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.311187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.01 
 
 		 639 aa  634  1e-180  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1806  ATP-dependent metalloprotease FtsH  65.58 
 
 		 651 aa  630  1e-179  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266956  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.78 
 
 		 602 aa  627  1e-178  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02180  membrane protease FtsH catalytic subunit  58.84 
 
 		 759 aa  615  9.999999999999999e-175  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.203861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.24 
 
 		 620 aa  613  9.999999999999999e-175  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.73 
 
 		 611 aa  611  1e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.17 
 
 		 608 aa  607  9.999999999999999e-173  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0145  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60 
 
 		 657 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000285756  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.66 
 
 		 632 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1848  ATP-dependent Zn protease  52.76 
 
 		 697 aa  608  9.999999999999999e-173  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.702512  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0095  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.53 
 
 		 599 aa  606  9.999999999999999e-173  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.38 
 
 		 638 aa  602  1.0000000000000001e-171  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  51.9 
 
 		 608 aa  600  1e-170  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0064  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.66 
 
 		 635 aa  599  1e-170  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  51.66 
 
 		 614 aa  597  1e-169  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4361  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.92 
 
 		 640 aa  598  1e-169  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_333  ATP-dependent metalloprotease, cell division protein  59.47 
 
 		 499 aa  596  1e-169  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000228185  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0370  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51 
 
 		 604 aa  596  1e-169  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000686263  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1132  ATP-dependent metallopeptidase HflB  51.46 
 
 		 769 aa  594  1e-168  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0229  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.66 
 
 		 608 aa  594  1e-168  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0081  FtsH-2 peptidase. Metallo peptidase. MEROPS family M41, membrane protease FtsH catalytic subunit  51.66 
 
 		 693 aa  594  1e-168  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00746794  normal  0.780653 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.25 
 
 		 639 aa  593  1e-168  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3355  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.96 
 
 		 647 aa  593  1e-168  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0224278  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  50.57 
 
 		 638 aa  591  1e-167  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.33 
 
 		 610 aa  590  1e-167  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2896  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.54 
 
 		 750 aa  591  1e-167  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.33 
 
 		 610 aa  590  1e-167  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.92 
 
 		 612 aa  591  1e-167  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.75 
 
 		 621 aa  588  1e-167  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02030  membrane protease FtsH catalytic subunit  56.14 
 
 		 783 aa  588  1e-166  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000829689  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.92 
 
 		 612 aa  585  1e-166  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.67 
 
 		 652 aa  588  1e-166  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2664  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.53 
 
 		 656 aa  582  1.0000000000000001e-165  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646659 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0206  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.25 
 
 		 617 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0105  FtsH-2 peptidase  51.97 
 
 		 645 aa  585  1.0000000000000001e-165  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0152057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.92 
 
 		 633 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0150  cell division protein FtsH, putative  49.18 
 
 		 700 aa  580  1e-164  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0063  cell division protein FtsH  49.83 
 
 		 633 aa  580  1e-164  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0064  cell division protein FtsH  50 
 
 		 633 aa  582  1e-164  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.651636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0060  cell division protein  50 
 
 		 633 aa  582  1e-164  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0060  cell division protein  50 
 
 		 633 aa  582  1e-164  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.527958  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3029  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.21 
 
 		 651 aa  582  1e-164  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0253083  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0981  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.1 
 
 		 637 aa  581  1e-164  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38316  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.14 
 
 		 630 aa  581  1e-164  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.810549  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0072  cell division protein FtsH  49.83 
 
 		 633 aa  580  1e-164  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.12055  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0073  cell division protein FtsH  50 
 
 		 633 aa  582  1e-164  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.755624 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0064  cell division protein FtsH  50 
 
 		 633 aa  582  1e-164  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550597  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0076  cell division protein FtsH  50 
 
 		 633 aa  582  1e-164  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0454651  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0533  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.78 
 
 		 697 aa  581  1e-164  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.37995  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0064  FtsH peptidase  53.43 
 
 		 637 aa  579  1e-164  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5244  cell division protein FtsH  49.92 
 
 		 633 aa  582  1e-164  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.293032 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1852  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.63 
 
 		 612 aa  580  1e-164  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.02 
 
 		 630 aa  580  1e-164  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0546  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.78 
 
 		 697 aa  581  1e-164  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2522  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.37 
 
 		 635 aa  578  1.0000000000000001e-163  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000162887  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02481  cell division protein FtsH2  49.67 
 
 		 617 aa  578  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3627  metalloprotease  50.25 
 
 		 681 aa  578  1.0000000000000001e-163  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.840583  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  49.92 
 
 		 645 aa  578  1.0000000000000001e-163  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3575  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.13 
 
 		 616 aa  578  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.873251 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0575  FtsH peptidase  60.21 
 
 		 613 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0102882  normal  0.203435 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>