More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0150 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.73 
 
 		 611 aa  660    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0150  cell division protein FtsH, putative  100 
 
 		 700 aa  1429    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.07 
 
 		 639 aa  665    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0063  cell division protein FtsH  67.56 
 
 		 633 aa  831    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0016  cell division protein FtsH  53.09 
 
 		 658 aa  645    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5244  cell division protein FtsH  67.62 
 
 		 633 aa  828    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.293032 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0064  cell division protein FtsH  67.72 
 
 		 633 aa  833    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.651636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0060  cell division protein  67.72 
 
 		 633 aa  833    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0060  cell division protein  67.72 
 
 		 633 aa  833    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.527958  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0145  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.39 
 
 		 657 aa  638    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000285756  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.21 
 
 		 615 aa  690    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0533  ATP-dependent metalloprotease FtsH  88.14 
 
 		 697 aa  1226    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.37995  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.91 
 
 		 602 aa  736    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  52.64 
 
 		 616 aa  641    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0064  cell division protein FtsH  67.72 
 
 		 633 aa  833    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550597  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0105  FtsH-2 peptidase  53.37 
 
 		 645 aa  635    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0152057  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0064  ATP-dependent metalloprotease FtsH  69.49 
 
 		 635 aa  837    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0081  FtsH-2 peptidase. Metallo peptidase. MEROPS family M41, membrane protease FtsH catalytic subunit  52.83 
 
 		 693 aa  665    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00746794  normal  0.780653 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0546  ATP-dependent metalloprotease FtsH  88.14 
 
 		 697 aa  1226    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0073  cell division protein FtsH  67.72 
 
 		 633 aa  833    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.755624 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  67.35 
 
 		 633 aa  830    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  67.9 
 
 		 639 aa  843    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.73 
 
 		 620 aa  645    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0076  cell division protein FtsH  67.72 
 
 		 633 aa  833    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0454651  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2786  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.45 
 
 		 601 aa  652    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2472  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.37 
 
 		 601 aa  654    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0072  cell division protein FtsH  67.62 
 
 		 633 aa  828    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.12055  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  69.06 
 
 		 632 aa  833    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0095  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.11 
 
 		 599 aa  649    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0229  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.14 
 
 		 608 aa  648    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.74 
 
 		 630 aa  635  1e-180  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2185  FtsH-2 peptidase  53.92 
 
 		 627 aa  629  1e-179  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0018  FtsH-2 peptidase  54.05 
 
 		 695 aa  629  1e-179  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  52.72 
 
 		 614 aa  627  1e-178  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.4 
 
 		 676 aa  625  1e-178  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0014  cell division protein  51.87 
 
 		 655 aa  625  1e-178  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  50.89 
 
 		 638 aa  624  1e-177  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0981  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.25 
 
 		 637 aa  623  1e-177  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38316  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.72 
 
 		 630 aa  622  1e-177  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.810549  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0276  ATP-dependent Zn protease  50 
 
 		 708 aa  622  1e-177  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00629107  normal  0.162688 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2372  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.27 
 
 		 635 aa  619  1e-176  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  51.16 
 
 		 608 aa  620  1e-176  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1495  FtsH peptidase  52.27 
 
 		 635 aa  619  1e-176  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.629279  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.33 
 
 		 643 aa  620  1e-176  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2617  FtsH peptidase  50.17 
 
 		 641 aa  617  1e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.258853  normal  0.61812 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0268  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.53 
 
 		 702 aa  617  1e-175  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0072472  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.76 
 
 		 634 aa  616  1e-175  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2460  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.11 
 
 		 635 aa  617  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.5 
 
 		 610 aa  618  1e-175  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.23 
 
 		 612 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.23 
 
 		 612 aa  614  9.999999999999999e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1475  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.17 
 
 		 639 aa  613  9.999999999999999e-175  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.16 
 
 		 610 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4925  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50 
 
 		 640 aa  613  9.999999999999999e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147921  normal  0.185615 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1806  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.67 
 
 		 651 aa  612  9.999999999999999e-175  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266956  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.52 
 
 		 652 aa  614  9.999999999999999e-175  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2383  FtsH peptidase  50.17 
 
 		 639 aa  613  9.999999999999999e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8426  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.52 
 
 		 672 aa  610  1e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2624  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50 
 
 		 638 aa  610  1e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642505  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1673  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.32 
 
 		 653 aa  611  1e-173  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.720537  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2011  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.57 
 
 		 639 aa  608  1e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1975  FtsH peptidase  50.75 
 
 		 639 aa  610  1e-173  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.182239  hitchhiker  0.00765382 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0642  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.5 
 
 		 616 aa  609  1e-173  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2852  membrane protease FtsH catalytic subunit  49.34 
 
 		 640 aa  608  9.999999999999999e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2817  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.42 
 
 		 634 aa  607  9.999999999999999e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1268  membrane protease FtsH catalytic subunit  49.01 
 
 		 640 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399956  normal  0.37717 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.41 
 
 		 614 aa  606  9.999999999999999e-173  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0204  Mername-AA223 peptidase  52.36 
 
 		 654 aa  608  9.999999999999999e-173  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.176031  normal  0.159439 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1727  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.24 
 
 		 636 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0229617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9175  Microtubule-severing ATPase  51.06 
 
 		 656 aa  602  1.0000000000000001e-171  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2611  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.01 
 
 		 642 aa  603  1.0000000000000001e-171  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  51.07 
 
 		 665 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000097295  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0055  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.25 
 
 		 671 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1571  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.69 
 
 		 656 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000144806  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.25 
 
 		 637 aa  601  1e-170  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0503698  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0085  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.36 
 
 		 619 aa  598  1e-170  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0128077  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2895  Mername-AA223 peptidase  61.08 
 
 		 682 aa  602  1e-170  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0168  ATP-dependent metallopeptidase HflB  49.26 
 
 		 764 aa  598  1e-170  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000170494  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1736  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.76 
 
 		 630 aa  598  1e-170  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.195499  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  50.08 
 
 		 673 aa  600  1e-170  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3447  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.47 
 
 		 679 aa  595  1e-169  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.311187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0206  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.45 
 
 		 617 aa  596  1e-169  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3736  ATP-dependent metalloprotease  49.29 
 
 		 647 aa  596  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000470783  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2734  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.38 
 
 		 617 aa  597  1e-169  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000099937  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3602  ATP-dependent metalloprotease  49.52 
 
 		 644 aa  596  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000683259  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0211  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.17 
 
 		 655 aa  597  1e-169  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.59 
 
 		 621 aa  596  1e-169  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3615  membrane protease FtsH catalytic subunit  50.57 
 
 		 640 aa  598  1e-169  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0280177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3355  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.32 
 
 		 647 aa  596  1e-169  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0224278  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1787  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.41 
 
 		 656 aa  595  1e-169  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.124146 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3452  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.84 
 
 		 660 aa  594  1e-168  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.380893  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0166  cell division protein FtsH  49.59 
 
 		 651 aa  592  1e-168  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000721667  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0772  membrane protease FtsH catalytic subunit  51.23 
 
 		 635 aa  592  1e-168  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000087079  normal  0.0618887 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3627  metalloprotease  49.43 
 
 		 681 aa  594  1e-168  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.840583  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0370  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.34 
 
 		 604 aa  593  1e-168  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000686263  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0873  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.09 
 
 		 645 aa  593  1e-168  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0168176  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4505  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.4 
 
 		 672 aa  594  1e-168  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1506  ATP-dependent metallopeptidase HflB  50.9 
 
 		 647 aa  594  1e-168  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3985  ATP-dependent metalloprotease  49.13 
 
 		 647 aa  593  1e-168  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000069949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1440  cell division protein  50.74 
 
 		 650 aa  592  1e-167  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>