More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_32090 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.81 
 
 
793 aa  679    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2104  ATP-dependent metalloprotease FtsH  77.97 
 
 
677 aa  963    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5156  Mername-AA223 peptidase  56.22 
 
 
784 aa  659    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01240  membrane protease FtsH catalytic subunit  65.37 
 
 
696 aa  833    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4744  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.83 
 
 
669 aa  772    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000616135 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0616  ATP-dependent metalloprotease FtsH  65.35 
 
 
662 aa  766    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2895  Mername-AA223 peptidase  64.38 
 
 
682 aa  796    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1416  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.8 
 
 
794 aa  668    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0495193  normal  0.256654 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.72 
 
 
615 aa  636    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32090  membrane protease FtsH catalytic subunit  100 
 
 
684 aa  1368    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.82 
 
 
760 aa  712    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0313  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.98 
 
 
743 aa  714    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0835  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.23 
 
 
671 aa  764    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0343776  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9175  Microtubule-severing ATPase  64.55 
 
 
656 aa  818    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1132  ATP-dependent metallopeptidase HflB  57.91 
 
 
769 aa  709    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0627  ATP-dependent metalloprotease FtsH  75.11 
 
 
682 aa  977    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0250398  normal  0.798069 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4505  ATP-dependent metalloprotease FtsH  65.29 
 
 
672 aa  777    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35650  membrane protease FtsH catalytic subunit  56.93 
 
 
798 aa  740    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.399414  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4314  Mername-AA223 peptidase  68.45 
 
 
753 aa  744    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1848  ATP-dependent Zn protease  60.22 
 
 
697 aa  729    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.702512  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24780  membrane protease FtsH catalytic subunit  68.24 
 
 
698 aa  854    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3447  ATP-dependent metalloprotease FtsH  65.5 
 
 
679 aa  804    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.311187  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4770  Mername-AA223 peptidase  56.06 
 
 
783 aa  657    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2185  FtsH-2 peptidase  59.39 
 
 
627 aa  640    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8426  ATP-dependent metalloprotease FtsH  72.81 
 
 
672 aa  852    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2987  ATP-dependent metalloprotease FtsH  77.41 
 
 
669 aa  1020    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.832035  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  75.57 
 
 
684 aa  993    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.447508 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0538  ATP-dependent metalloprotease FtsH  73.05 
 
 
659 aa  889    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0673684  normal  0.0150565 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13642  cell division protein ftsH (membrane-bound protease)  57.59 
 
 
760 aa  667    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0052338 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  72.25 
 
 
687 aa  930    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0151  Mername-AA223 peptidase  72.13 
 
 
689 aa  927    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  63.06 
 
 
671 aa  776    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.066161 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1673  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.22 
 
 
653 aa  649    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.720537  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0298  ATP-dependent metalloprotease FtsH  73.11 
 
 
753 aa  746    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0204  Mername-AA223 peptidase  66.34 
 
 
654 aa  783    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.176031  normal  0.159439 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0444  Mername-AA223 peptidase  64.41 
 
 
681 aa  776    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4856  Mername-AA223 peptidase  56.06 
 
 
783 aa  657    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5372  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.58 
 
 
781 aa  671    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00418248 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12800  membrane protease FtsH catalytic subunit  66.18 
 
 
704 aa  789    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.113847  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0559  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.49 
 
 
801 aa  660    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4970  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.85 
 
 
685 aa  774    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.259213 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.24 
 
 
639 aa  622  1e-177  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1806  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.47 
 
 
651 aa  619  1e-176  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266956  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.78 
 
 
611 aa  617  1e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0145  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.04 
 
 
657 aa  618  1e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000285756  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.84 
 
 
602 aa  616  1e-175  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02180  membrane protease FtsH catalytic subunit  58.67 
 
 
759 aa  612  9.999999999999999e-175  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.203861  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.15 
 
 
620 aa  608  1e-173  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2896  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.9 
 
 
750 aa  607  9.999999999999999e-173  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0064  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.9 
 
 
635 aa  599  1e-170  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.4 
 
 
630 aa  598  1e-169  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.810549  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.37 
 
 
643 aa  596  1e-169  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.9 
 
 
632 aa  596  1e-169  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.82 
 
 
612 aa  593  1e-168  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  51.74 
 
 
616 aa  592  1e-168  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.76 
 
 
639 aa  593  1e-168  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0081  FtsH-2 peptidase. Metallo peptidase. MEROPS family M41, membrane protease FtsH catalytic subunit  56.93 
 
 
693 aa  592  1e-168  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00746794  normal  0.780653 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  55.6 
 
 
614 aa  591  1e-167  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.66 
 
 
612 aa  592  1e-167  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  51.83 
 
 
608 aa  591  1e-167  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0095  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.53 
 
 
599 aa  589  1e-167  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0229  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.66 
 
 
608 aa  591  1e-167  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02030  membrane protease FtsH catalytic subunit  55.98 
 
 
783 aa  589  1e-167  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000829689  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.69 
 
 
608 aa  588  1e-166  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0533  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.92 
 
 
697 aa  585  1e-166  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.37995  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0105  FtsH-2 peptidase  60.21 
 
 
645 aa  587  1e-166  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0152057  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0426  FtsH peptidase  51.25 
 
 
652 aa  585  1e-166  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.405966  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0546  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.92 
 
 
697 aa  585  1e-166  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.71 
 
 
676 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.17 
 
 
633 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0358  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.57 
 
 
652 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5244  cell division protein FtsH  60.17 
 
 
633 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.293032 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.88 
 
 
610 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.04 
 
 
610 aa  585  1.0000000000000001e-165  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0206  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.42 
 
 
617 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0063  cell division protein FtsH  60.81 
 
 
633 aa  582  1e-164  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0064  cell division protein FtsH  60.6 
 
 
633 aa  580  1e-164  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.651636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0060  cell division protein  60.6 
 
 
633 aa  580  1e-164  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0060  cell division protein  60.6 
 
 
633 aa  580  1e-164  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.527958  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0391  peptidase M41, FtsH  55.91 
 
 
662 aa  578  1e-164  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0150338  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0076  cell division protein FtsH  60.6 
 
 
633 aa  580  1e-164  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0454651  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0064  cell division protein FtsH  60.6 
 
 
633 aa  580  1e-164  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550597  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0297  FtsH peptidase  56.13 
 
 
613 aa  581  1e-164  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0073  cell division protein FtsH  60.6 
 
 
633 aa  580  1e-164  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.755624 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0072  cell division protein FtsH  60.6 
 
 
633 aa  581  1e-164  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.12055  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0370  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.77 
 
 
604 aa  579  1e-164  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000686263  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_333  ATP-dependent metalloprotease, cell division protein  56.65 
 
 
499 aa  580  1e-164  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000228185  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.86 
 
 
614 aa  578  1e-164  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2734  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.74 
 
 
617 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000099937  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0150  cell division protein FtsH, putative  54.1 
 
 
700 aa  577  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0463  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.22 
 
 
662 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1722  peptidase M41, FtsH  53.19 
 
 
631 aa  575  1.0000000000000001e-163  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.139159 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1784  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.16 
 
 
660 aa  577  1.0000000000000001e-163  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0518301 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.13 
 
 
637 aa  578  1.0000000000000001e-163  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0503698  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2522  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.94 
 
 
635 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000162887  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1990  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.34 
 
 
659 aa  576  1.0000000000000001e-163  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.144891  normal  0.186322 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.54 
 
 
621 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.96 
 
 
630 aa  572  1.0000000000000001e-162  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0064  FtsH peptidase  56.21 
 
 
637 aa  573  1.0000000000000001e-162  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.79 
 
 
607 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>