More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0997 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03043  protease, ATP-dependent zinc-metallo  56.84 
 
 		 644 aa  714    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000537455  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0529  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.54 
 
 		 647 aa  716    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000027152  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3246  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.53 
 
 		 657 aa  721    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000231825  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1787  ATP-dependent metalloprotease FtsH  64.71 
 
 		 656 aa  802    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.124146 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  65.69 
 
 		 614 aa  830    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4718  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.13 
 
 		 637 aa  720    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.518421  normal  0.0121069 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0150  cell division protein FtsH, putative  52.64 
 
 		 700 aa  636    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  60.46 
 
 		 638 aa  756    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2834  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.35 
 
 		 655 aa  717    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000517945  normal  0.0155634 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1526  ATP-dependent zinc metallopeptidase  57.69 
 
 		 628 aa  684    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155575  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0063  cell division protein FtsH  54.6 
 
 		 633 aa  670    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3452  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.18 
 
 		 660 aa  709    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.380893  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1691  cell division protein FtsH  61.33 
 
 		 644 aa  726    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1197  cell division protein FtsH  59.87 
 
 		 649 aa  724    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4497  cell division protein FtsH  59.73 
 
 		 634 aa  711    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.554573  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0064  cell division protein FtsH  54.77 
 
 		 633 aa  672    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.651636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0060  cell division protein  54.77 
 
 		 633 aa  672    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0060  cell division protein  54.77 
 
 		 633 aa  672    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.527958  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0777  cell division protein FtsH  56.35 
 
 		 628 aa  674    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2842  cell division protease ftsH  59.2 
 
 		 639 aa  731    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2711  cell division protease ftsH  59.2 
 
 		 639 aa  731    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4187  peptidase M41, FtsH  59.9 
 
 		 634 aa  713    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000128423  normal  0.66671 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1288  cell division protein FtsH  56.35 
 
 		 628 aa  674    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.725972  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0944  FtsH peptidase  61.24 
 
 		 626 aa  766    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.129158  normal  0.715931 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0580  cell division protein FtsH  56.35 
 
 		 628 aa  674    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.51431  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2170  peptidase M41, FtsH  56.86 
 
 		 627 aa  680    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.415072  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0879  FtsH peptidase  53.61 
 
 		 611 aa  653    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1133  membrane protease FtsH catalytic subunit  61.05 
 
 		 630 aa  733    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0177636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2710  peptidase M41, FtsH  62.04 
 
 		 640 aa  719    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1512  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.35 
 
 		 628 aa  674    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0580139  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2611  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.47 
 
 		 642 aa  706    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1615  cell division protein FtsH  56.35 
 
 		 628 aa  674    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24975  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2569  peptidase M41, FtsH  61.63 
 
 		 641 aa  767    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000845189  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0772  membrane protease FtsH catalytic subunit  60.97 
 
 		 635 aa  719    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000087079  normal  0.0618887 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0665  membrane protease FtsH catalytic subunit  54.52 
 
 		 633 aa  643    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.735845  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  100 
 
 		 616 aa  1247    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2383  FtsH peptidase  57.83 
 
 		 639 aa  701    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4439  FtsH peptidase  56.67 
 
 		 632 aa  679    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1722  peptidase M41, FtsH  55.3 
 
 		 631 aa  658    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.139159 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0954  vesicle-fusing ATPase  58.03 
 
 		 650 aa  705    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000306538  normal  0.326508 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1013  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.09 
 
 		 621 aa  681    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3355  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.54 
 
 		 647 aa  719    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0224278  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  66.89 
 
 		 608 aa  834    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0811  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.02 
 
 		 663 aa  671    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.569146  hitchhiker  0.0043584 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  66.5 
 
 		 665 aa  815    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000097295  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0812  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.59 
 
 		 651 aa  686    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0310743  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0064  cell division protein FtsH  54.77 
 
 		 633 aa  672    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550597  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0571  cell division protein FtsH  56.35 
 
 		 628 aa  674    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0297  FtsH peptidase  53.88 
 
 		 613 aa  636    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0483  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.59 
 
 		 631 aa  751    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000161272  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1098  membrane protease FtsH catalytic subunit  62.65 
 
 		 640 aa  739    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.13074  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0105  FtsH-2 peptidase  56 
 
 		 645 aa  651    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0152057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2776  cell division protein FtsH  56.19 
 
 		 628 aa  675    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182791  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1495  FtsH peptidase  61.91 
 
 		 635 aa  749    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.629279  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0690  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.35 
 
 		 631 aa  641    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.827702  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1818  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.39 
 
 		 638 aa  726    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192895  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0076  membrane protease FtsH catalytic subunit  57.38 
 
 		 644 aa  658    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.597348  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0423  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.38 
 
 		 636 aa  685    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1098  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.03 
 
 		 610 aa  647    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0627303  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1770  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.69 
 
 		 651 aa  720    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.292571  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2011  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.35 
 
 		 639 aa  701    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0211  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.12 
 
 		 655 aa  693    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4743  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.39 
 
 		 638 aa  726    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0783  membrane protease FtsH catalytic subunit  56.57 
 
 		 631 aa  717    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000394436  unclonable  0.000000272669 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2852  membrane protease FtsH catalytic subunit  58.47 
 
 		 640 aa  711    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1262  FtsH peptidase  55.92 
 
 		 629 aa  685    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1000  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57 
 
 		 656 aa  711    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000544697  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4141  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.74 
 
 		 638 aa  726    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3081  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.88 
 
 		 655 aa  703    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.312439  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3506  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.39 
 
 		 638 aa  722    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0168  ATP-dependent metallopeptidase HflB  57.86 
 
 		 764 aa  736    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000170494  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2188  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.78 
 
 		 649 aa  677    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350229  normal  0.438236 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.95 
 
 		 627 aa  699    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0064  FtsH peptidase  60.06 
 
 		 637 aa  748    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.34 
 
 		 615 aa  685    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1599  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.83 
 
 		 647 aa  693    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.238697 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0816  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.53 
 
 		 627 aa  678    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2318  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.52 
 
 		 633 aa  643    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0771513  normal  0.541776 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2185  FtsH-2 peptidase  54.88 
 
 		 627 aa  657    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1571  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.89 
 
 		 656 aa  693    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000144806  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  61.73 
 
 		 645 aa  756    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2786  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.1 
 
 		 601 aa  640    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2472  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.32 
 
 		 601 aa  641    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0725  FtsH peptidase  58.76 
 
 		 612 aa  717    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1268  membrane protease FtsH catalytic subunit  58.4 
 
 		 640 aa  717    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399956  normal  0.37717 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0426  FtsH peptidase  60.47 
 
 		 652 aa  648    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.405966  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1019  membrane protease FtsH catalytic subunit  57.62 
 
 		 657 aa  721    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000780208  hitchhiker  0.000608132 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1084  membrane protease FtsH catalytic subunit  57.62 
 
 		 657 aa  721    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000445375  normal  0.0888545 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1975  FtsH peptidase  59.8 
 
 		 639 aa  729    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.182239  hitchhiker  0.00765382 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0983  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.25 
 
 		 657 aa  721    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000296667  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0095  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.95 
 
 		 599 aa  665    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1174  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.67 
 
 		 631 aa  679    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.378107  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62860  cell division protein FtsH  61.31 
 
 		 639 aa  716    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  63.75 
 
 		 621 aa  809    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1297  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.51 
 
 		 631 aa  680    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.17526  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  66 
 
 		 652 aa  806    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2617  FtsH peptidase  58.4 
 
 		 641 aa  708    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.258853  normal  0.61812 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  62.2 
 
 		 673 aa  781    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1023  membrane protease FtsH catalytic subunit  57.61 
 
 		 657 aa  719    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000161981  hitchhiker  0.0000832625 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1482  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.35 
 
 		 628 aa  674    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427373  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>