More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3447 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0559  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.15 
 
 
801 aa  720    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.04 
 
 
637 aa  642    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0503698  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  54.2 
 
 
614 aa  649    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0229  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.66 
 
 
608 aa  654    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.92 
 
 
615 aa  676    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.11 
 
 
639 aa  640    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9175  Microtubule-severing ATPase  84.58 
 
 
656 aa  1106    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0206  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.15 
 
 
617 aa  636    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32090  membrane protease FtsH catalytic subunit  65.01 
 
 
684 aa  841    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.74 
 
 
687 aa  786    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24780  membrane protease FtsH catalytic subunit  61.62 
 
 
698 aa  765    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3447  ATP-dependent metalloprotease FtsH  100 
 
 
679 aa  1371    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.311187  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2895  Mername-AA223 peptidase  77.98 
 
 
682 aa  991    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  66.37 
 
 
671 aa  872    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.066161 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.55 
 
 
612 aa  653    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35650  membrane protease FtsH catalytic subunit  62.27 
 
 
798 aa  827    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.399414  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.41 
 
 
620 aa  673    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2987  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.12 
 
 
669 aa  796    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.832035  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12800  membrane protease FtsH catalytic subunit  55.41 
 
 
704 aa  657    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.113847  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2734  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.82 
 
 
617 aa  642    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000099937  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  53.53 
 
 
608 aa  643    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1132  ATP-dependent metallopeptidase HflB  52.72 
 
 
769 aa  645    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0627  ATP-dependent metalloprotease FtsH  64.17 
 
 
682 aa  819    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0250398  normal  0.798069 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2104  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.16 
 
 
677 aa  750    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.09 
 
 
611 aa  667    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0105  FtsH-2 peptidase  56.44 
 
 
645 aa  637    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0152057  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0616  ATP-dependent metalloprotease FtsH  69.23 
 
 
662 aa  857    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4314  Mername-AA223 peptidase  71.32 
 
 
753 aa  875    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.34 
 
 
632 aa  648    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5156  Mername-AA223 peptidase  58.71 
 
 
784 aa  716    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1673  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.33 
 
 
653 aa  717    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.720537  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.45 
 
 
793 aa  747    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0538  ATP-dependent metalloprotease FtsH  65.6 
 
 
659 aa  850    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0673684  normal  0.0150565 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0298  ATP-dependent metalloprotease FtsH  71.63 
 
 
753 aa  877    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1416  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.94 
 
 
794 aa  721    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0495193  normal  0.256654 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.13 
 
 
760 aa  802    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.82 
 
 
684 aa  811    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.447508 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4505  ATP-dependent metalloprotease FtsH  79.76 
 
 
672 aa  1012    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4744  ATP-dependent metalloprotease FtsH  68.85 
 
 
669 aa  885    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000616135 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4770  Mername-AA223 peptidase  59.17 
 
 
783 aa  719    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1806  ATP-dependent metalloprotease FtsH  66.39 
 
 
651 aa  662    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266956  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2185  FtsH-2 peptidase  59.27 
 
 
627 aa  691    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02180  membrane protease FtsH catalytic subunit  61.85 
 
 
759 aa  674    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.203861  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.04 
 
 
612 aa  659    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4970  ATP-dependent metalloprotease FtsH  72.21 
 
 
685 aa  948    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.259213 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0145  ATP-dependent metalloprotease FtsH  64.62 
 
 
657 aa  649    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000285756  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1848  ATP-dependent Zn protease  55.16 
 
 
697 aa  664    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.702512  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.01 
 
 
676 aa  636    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  63.21 
 
 
630 aa  644    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.810549  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0064  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.53 
 
 
635 aa  649    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0095  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.38 
 
 
599 aa  645    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.1 
 
 
610 aa  642    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0313  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.27 
 
 
743 aa  803    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0151  Mername-AA223 peptidase  61.35 
 
 
689 aa  782    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01240  membrane protease FtsH catalytic subunit  58.54 
 
 
696 aa  746    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.43 
 
 
610 aa  644    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2896  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.04 
 
 
750 aa  652    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0204  Mername-AA223 peptidase  75.38 
 
 
654 aa  969    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.176031  normal  0.159439 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.76 
 
 
621 aa  641    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.79 
 
 
643 aa  660    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0444  Mername-AA223 peptidase  66.36 
 
 
681 aa  818    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0835  ATP-dependent metalloprotease FtsH  66.2 
 
 
671 aa  839    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0343776  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4856  Mername-AA223 peptidase  59.17 
 
 
783 aa  719    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5372  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.86 
 
 
781 aa  738    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00418248 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  63.93 
 
 
602 aa  670    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.14 
 
 
639 aa  688    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13642  cell division protein ftsH (membrane-bound protease)  59.78 
 
 
760 aa  738    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0052338 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8426  ATP-dependent metalloprotease FtsH  67.28 
 
 
672 aa  893    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.37 
 
 
652 aa  633  1e-180  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  53.45 
 
 
616 aa  628  1e-179  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.82 
 
 
633 aa  630  1e-179  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.49 
 
 
608 aa  625  1e-178  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02030  membrane protease FtsH catalytic subunit  59.96 
 
 
783 aa  628  1e-178  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000829689  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.18 
 
 
607 aa  625  1e-178  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1098  membrane protease FtsH catalytic subunit  50.67 
 
 
640 aa  626  1e-178  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.13074  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.73 
 
 
640 aa  625  1e-178  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60 
 
 
614 aa  627  1e-178  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0063  cell division protein FtsH  53.68 
 
 
633 aa  624  1e-177  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0064  cell division protein FtsH  53.52 
 
 
633 aa  624  1e-177  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.651636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0060  cell division protein  53.52 
 
 
633 aa  624  1e-177  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0060  cell division protein  53.52 
 
 
633 aa  624  1e-177  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.527958  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0076  cell division protein FtsH  53.52 
 
 
633 aa  624  1e-177  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0454651  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0064  cell division protein FtsH  53.52 
 
 
633 aa  624  1e-177  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550597  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0780  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.54 
 
 
643 aa  622  1e-177  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0715854 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0073  cell division protein FtsH  53.52 
 
 
633 aa  624  1e-177  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.755624 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0370  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.89 
 
 
604 aa  622  1e-177  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000686263  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5244  cell division protein FtsH  53.92 
 
 
633 aa  622  1e-177  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.293032 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1787  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.12 
 
 
656 aa  622  1e-177  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.124146 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0055  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.78 
 
 
671 aa  619  1e-176  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0391  peptidase M41, FtsH  53.81 
 
 
662 aa  620  1e-176  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0150338  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3083  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.66 
 
 
640 aa  620  1e-176  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0072  cell division protein FtsH  54.01 
 
 
633 aa  621  1e-176  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.12055  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.22 
 
 
630 aa  620  1e-176  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  51.24 
 
 
645 aa  619  1e-176  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4335  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.56 
 
 
640 aa  619  1e-176  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0962233 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0150  cell division protein FtsH, putative  52.81 
 
 
700 aa  618  1e-175  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2710  peptidase M41, FtsH  52.46 
 
 
640 aa  616  1e-175  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2522  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.48 
 
 
635 aa  616  1e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000162887  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1495  FtsH peptidase  51.29 
 
 
635 aa  616  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.629279  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0064  FtsH peptidase  61.28 
 
 
637 aa  617  1e-175  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>