More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0627 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.65 
 
 
793 aa  665    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12800  membrane protease FtsH catalytic subunit  64.06 
 
 
704 aa  778    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.113847  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0538  ATP-dependent metalloprotease FtsH  70.27 
 
 
659 aa  880    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0673684  normal  0.0150565 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.28 
 
 
602 aa  638    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.54 
 
 
639 aa  637    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0559  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.64 
 
 
801 aa  649    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2895  Mername-AA223 peptidase  63.02 
 
 
682 aa  793    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1416  ATP-dependent metalloprotease FtsH  65.42 
 
 
794 aa  657    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0495193  normal  0.256654 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3447  ATP-dependent metalloprotease FtsH  64.17 
 
 
679 aa  792    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.311187  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0313  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.33 
 
 
743 aa  721    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.87 
 
 
671 aa  767    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.066161 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0835  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.5 
 
 
671 aa  763    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0343776  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13642  cell division protein ftsH (membrane-bound protease)  57.06 
 
 
760 aa  660    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0052338 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2104  ATP-dependent metalloprotease FtsH  72.02 
 
 
677 aa  893    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.85 
 
 
615 aa  657    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24780  membrane protease FtsH catalytic subunit  67.81 
 
 
698 aa  817    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4314  Mername-AA223 peptidase  74.51 
 
 
753 aa  757    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  73.55 
 
 
684 aa  970    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.447508 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1673  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.18 
 
 
653 aa  665    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.720537  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5156  Mername-AA223 peptidase  55.76 
 
 
784 aa  645    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1848  ATP-dependent Zn protease  60.34 
 
 
697 aa  729    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.702512  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0616  ATP-dependent metalloprotease FtsH  65.46 
 
 
662 aa  783    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.27 
 
 
760 aa  713    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4770  Mername-AA223 peptidase  55.61 
 
 
783 aa  643    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2185  FtsH-2 peptidase  61.01 
 
 
627 aa  650    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35650  membrane protease FtsH catalytic subunit  55.6 
 
 
798 aa  720    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.399414  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  67.25 
 
 
687 aa  896    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0298  ATP-dependent metalloprotease FtsH  74.16 
 
 
753 aa  748    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4505  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.54 
 
 
672 aa  776    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01240  membrane protease FtsH catalytic subunit  66.26 
 
 
696 aa  844    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4744  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.94 
 
 
669 aa  773    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000616135 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9175  Microtubule-severing ATPase  62.37 
 
 
656 aa  806    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0151  Mername-AA223 peptidase  69.86 
 
 
689 aa  895    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32090  membrane protease FtsH catalytic subunit  75.11 
 
 
684 aa  987    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0204  Mername-AA223 peptidase  61.53 
 
 
654 aa  781    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.176031  normal  0.159439 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0444  Mername-AA223 peptidase  62.37 
 
 
681 aa  785    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0627  ATP-dependent metalloprotease FtsH  100 
 
 
682 aa  1374    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0250398  normal  0.798069 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4856  Mername-AA223 peptidase  55.61 
 
 
783 aa  643    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5372  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.9 
 
 
781 aa  659    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00418248 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4970  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.36 
 
 
685 aa  757    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.259213 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2987  ATP-dependent metalloprotease FtsH  74.33 
 
 
669 aa  981    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.832035  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.22 
 
 
611 aa  640    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1132  ATP-dependent metallopeptidase HflB  58.03 
 
 
769 aa  712    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8426  ATP-dependent metalloprotease FtsH  67.84 
 
 
672 aa  853    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0145  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.68 
 
 
657 aa  635  1e-180  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000285756  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.55 
 
 
643 aa  627  1e-178  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2896  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.99 
 
 
750 aa  621  1e-176  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02180  membrane protease FtsH catalytic subunit  60.9 
 
 
759 aa  619  1e-176  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.203861  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1806  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.23 
 
 
651 aa  621  1e-176  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266956  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.43 
 
 
630 aa  618  1e-175  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.810549  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0229  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.15 
 
 
608 aa  615  1e-175  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0081  FtsH-2 peptidase. Metallo peptidase. MEROPS family M41, membrane protease FtsH catalytic subunit  53.32 
 
 
693 aa  616  1e-175  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00746794  normal  0.780653 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  60.04 
 
 
614 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.16 
 
 
637 aa  614  9.999999999999999e-175  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0503698  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  59.8 
 
 
608 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.88 
 
 
612 aa  610  1e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0095  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.33 
 
 
599 aa  610  1e-173  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.67 
 
 
612 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0206  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.28 
 
 
617 aa  606  9.999999999999999e-173  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.98 
 
 
620 aa  607  9.999999999999999e-173  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  51.55 
 
 
645 aa  606  9.999999999999999e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.47 
 
 
614 aa  603  1.0000000000000001e-171  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  52.07 
 
 
616 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0780  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.42 
 
 
643 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0715854 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.76 
 
 
676 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0358  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.2 
 
 
652 aa  602  1.0000000000000001e-171  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.48 
 
 
630 aa  603  1.0000000000000001e-171  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0463  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.87 
 
 
662 aa  598  1e-170  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.94 
 
 
608 aa  599  1e-170  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1727  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.99 
 
 
636 aa  599  1e-170  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0229617  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1784  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.46 
 
 
660 aa  598  1e-170  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0518301 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1722  peptidase M41, FtsH  58.82 
 
 
631 aa  601  1e-170  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.139159 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  49.33 
 
 
665 aa  600  1e-170  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000097295  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0064  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.24 
 
 
635 aa  600  1e-170  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.21 
 
 
640 aa  599  1e-170  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.22 
 
 
652 aa  598  1e-170  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0426  FtsH peptidase  58.38 
 
 
652 aa  601  1e-170  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.405966  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.95 
 
 
632 aa  601  1e-170  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0370  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.54 
 
 
604 aa  596  1e-169  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000686263  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2734  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.49 
 
 
617 aa  597  1e-169  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000099937  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02030  membrane protease FtsH catalytic subunit  59.52 
 
 
783 aa  597  1e-169  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000829689  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0105  FtsH-2 peptidase  59.68 
 
 
645 aa  595  1e-169  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0152057  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3627  metalloprotease  50.84 
 
 
681 aa  598  1e-169  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.840583  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0064  FtsH peptidase  57.74 
 
 
637 aa  595  1e-169  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4361  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.39 
 
 
640 aa  595  1e-169  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.36 
 
 
639 aa  597  1e-169  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2522  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.34 
 
 
635 aa  598  1e-169  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000162887  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.6 
 
 
638 aa  595  1e-169  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3196  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.85 
 
 
643 aa  594  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.766379  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.19 
 
 
610 aa  594  1e-168  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0283  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.86 
 
 
640 aa  592  1e-168  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4335  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.13 
 
 
640 aa  592  1e-168  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0962233 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.84 
 
 
648 aa  595  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202032  normal  0.0464003 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1098  membrane protease FtsH catalytic subunit  51.63 
 
 
640 aa  592  1e-168  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.13074  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.19 
 
 
610 aa  595  1e-168  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3506  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.45 
 
 
638 aa  592  1e-168  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.48 
 
 
640 aa  592  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.610912  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55 
 
 
607 aa  591  1e-167  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0055  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.1 
 
 
671 aa  589  1e-167  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3083  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.98 
 
 
640 aa  591  1e-167  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.477403 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>