More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0062 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A0072  cell division protein FtsH  80.41 
 
 
633 aa  1000    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.12055  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  54.46 
 
 
614 aa  672    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0076  cell division protein FtsH  80.41 
 
 
633 aa  1006    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0454651  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0150  cell division protein FtsH, putative  69.06 
 
 
700 aa  849    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  52.97 
 
 
638 aa  644    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0063  cell division protein FtsH  80.09 
 
 
633 aa  1002    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0642  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.89 
 
 
616 aa  665    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0016  cell division protein FtsH  55.66 
 
 
658 aa  672    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.33 
 
 
676 aa  636    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0064  cell division protein FtsH  80.41 
 
 
633 aa  1006    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.651636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0060  cell division protein  80.41 
 
 
633 aa  1006    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0060  cell division protein  80.41 
 
 
633 aa  1006    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.527958  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2460  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.48 
 
 
635 aa  640    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0064  ATP-dependent metalloprotease FtsH  93.7 
 
 
635 aa  1167    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.63 
 
 
637 aa  640    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0503698  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3447  ATP-dependent metalloprotease FtsH  64.62 
 
 
679 aa  639    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.311187  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2895  Mername-AA223 peptidase  55.1 
 
 
682 aa  654    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2372  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.65 
 
 
635 aa  641    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0206  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.27 
 
 
617 aa  655    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1727  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.55 
 
 
636 aa  636    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0229617  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0533  ATP-dependent metalloprotease FtsH  69.33 
 
 
697 aa  851    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.37995  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0081  FtsH-2 peptidase. Metallo peptidase. MEROPS family M41, membrane protease FtsH catalytic subunit  60.69 
 
 
693 aa  729    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00746794  normal  0.780653 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2569  peptidase M41, FtsH  52.4 
 
 
641 aa  635    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000845189  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.13 
 
 
630 aa  691    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  55.94 
 
 
616 aa  682    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.98 
 
 
630 aa  676    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.810549  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  80.57 
 
 
639 aa  1027    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0085  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.84 
 
 
619 aa  642    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0128077  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  53.02 
 
 
608 aa  664    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  52.66 
 
 
665 aa  640    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000097295  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.28 
 
 
615 aa  759    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0064  cell division protein FtsH  80.41 
 
 
633 aa  1006    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550597  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  64.57 
 
 
602 aa  799    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8426  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.54 
 
 
672 aa  652    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0105  FtsH-2 peptidase  61.13 
 
 
645 aa  734    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0152057  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  100 
 
 
632 aa  1284    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1495  FtsH peptidase  53.65 
 
 
635 aa  641    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.629279  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5244  cell division protein FtsH  80.57 
 
 
633 aa  1001    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.293032 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0073  cell division protein FtsH  80.41 
 
 
633 aa  1006    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.755624 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.9 
 
 
611 aa  736    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0145  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.47 
 
 
657 aa  710    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000285756  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1673  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.3 
 
 
653 aa  667    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.720537  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.05 
 
 
639 aa  739    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0546  ATP-dependent metalloprotease FtsH  69.33 
 
 
697 aa  851    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.8 
 
 
610 aa  658    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2734  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.67 
 
 
617 aa  652    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000099937  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.1 
 
 
643 aa  689    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1806  ATP-dependent metalloprotease FtsH  67.46 
 
 
651 aa  657    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266956  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2185  FtsH-2 peptidase  55.54 
 
 
627 aa  692    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2786  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.29 
 
 
601 aa  668    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2472  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.29 
 
 
601 aa  668    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9175  Microtubule-severing ATPase  59.02 
 
 
656 aa  649    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4505  ATP-dependent metalloprotease FtsH  64.39 
 
 
672 aa  636    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.9 
 
 
612 aa  666    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0095  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.63 
 
 
599 aa  709    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.9 
 
 
612 aa  664    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0018  FtsH-2 peptidase  53.39 
 
 
695 aa  649    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0276  ATP-dependent Zn protease  54.73 
 
 
708 aa  660    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00629107  normal  0.162688 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0014  cell division protein  56.3 
 
 
655 aa  666    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.99 
 
 
652 aa  649    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0268  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.09 
 
 
702 aa  641    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0072472  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.56 
 
 
614 aa  648    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0204  Mername-AA223 peptidase  64.71 
 
 
654 aa  649    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.176031  normal  0.159439 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.56 
 
 
621 aa  644    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  80.41 
 
 
633 aa  1006    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0229  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.63 
 
 
608 aa  721    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1787  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.85 
 
 
656 aa  638    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.124146 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0055  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.62 
 
 
671 aa  642    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.3 
 
 
610 aa  652    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.5 
 
 
620 aa  721    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.33 
 
 
607 aa  633  1e-180  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.85 
 
 
608 aa  634  1e-180  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.19 
 
 
638 aa  633  1e-180  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.53 
 
 
634 aa  634  1e-180  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1506  ATP-dependent metallopeptidase HflB  51.4 
 
 
647 aa  632  1e-180  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0151  Mername-AA223 peptidase  59.58 
 
 
689 aa  633  1e-180  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1440  cell division protein  51.4 
 
 
650 aa  633  1e-180  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0575  FtsH peptidase  53.61 
 
 
613 aa  628  1e-179  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0102882  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4361  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.7 
 
 
640 aa  631  1e-179  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0370  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.73 
 
 
604 aa  630  1e-179  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000686263  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2664  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53 
 
 
656 aa  629  1e-179  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00646659 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1852  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.69 
 
 
612 aa  630  1e-179  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3612  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0627  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.95 
 
 
682 aa  629  1e-179  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0250398  normal  0.798069 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0981  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.47 
 
 
637 aa  630  1e-179  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38316  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.07 
 
 
599 aa  628  1e-179  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000844037  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0297  FtsH peptidase  51.39 
 
 
613 aa  625  1e-178  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0483  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.64 
 
 
631 aa  626  1e-178  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000161272  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0064  FtsH peptidase  51.44 
 
 
637 aa  625  1e-178  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  51.57 
 
 
645 aa  626  1e-178  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0357  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.28 
 
 
613 aa  625  1e-178  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0125367  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  51.82 
 
 
673 aa  627  1e-178  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3355  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.24 
 
 
647 aa  626  1e-178  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0224278  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0298  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.63 
 
 
753 aa  622  1e-177  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.67 
 
 
687 aa  624  1e-177  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3627  metalloprotease  49.84 
 
 
681 aa  623  1e-177  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.840583  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3575  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.79 
 
 
616 aa  624  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.873251 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2987  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.11 
 
 
669 aa  621  1e-177  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.832035  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3755  FtsH peptidase  52.55 
 
 
613 aa  624  1e-177  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.916692 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2636  cell division protein FtsH  51.32 
 
 
641 aa  620  1e-176  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.235612  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4314  Mername-AA223 peptidase  62.03 
 
 
753 aa  621  1e-176  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.492417 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>