More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2472 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0150  cell division protein FtsH, putative  55.37 
 
 		 700 aa  651    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0063  cell division protein FtsH  57.88 
 
 		 633 aa  662    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0072  cell division protein FtsH  57.88 
 
 		 633 aa  664    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.12055  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0064  cell division protein FtsH  57.71 
 
 		 633 aa  662    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.651636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0060  cell division protein  57.71 
 
 		 633 aa  662    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0060  cell division protein  57.71 
 
 		 633 aa  662    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.527958  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0076  cell division protein FtsH  57.71 
 
 		 633 aa  662    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0454651  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  56.32 
 
 		 616 aa  641    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.88 
 
 		 620 aa  655    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5244  cell division protein FtsH  57.78 
 
 		 633 aa  660    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.293032 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0085  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.55 
 
 		 619 aa  661    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0128077  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.12 
 
 		 615 aa  676    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0064  cell division protein FtsH  57.71 
 
 		 633 aa  662    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550597  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0073  cell division protein FtsH  57.71 
 
 		 633 aa  662    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.755624 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0145  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.89 
 
 		 657 aa  646    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000285756  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0105  FtsH-2 peptidase  56.78 
 
 		 645 aa  649    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0152057  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0064  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.29 
 
 		 635 aa  653    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0533  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.21 
 
 		 697 aa  639    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.37995  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.67 
 
 		 602 aa  677    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0229  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.52 
 
 		 608 aa  643    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2786  ATP-dependent metalloprotease FtsH  99.17 
 
 		 601 aa  1206    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2472  ATP-dependent metalloprotease FtsH  100 
 
 		 601 aa  1215    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.78 
 
 		 633 aa  660    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.6 
 
 		 639 aa  666    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.29 
 
 		 632 aa  654    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0546  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.21 
 
 		 697 aa  639    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.34 
 
 		 599 aa  639    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000844037  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.85 
 
 		 639 aa  674    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.36 
 
 		 611 aa  730    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0642  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.48 
 
 		 616 aa  660    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.59 
 
 		 676 aa  629  1e-179  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.93 
 
 		 630 aa  630  1e-179  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0095  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.08 
 
 		 599 aa  631  1e-179  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0081  FtsH-2 peptidase. Metallo peptidase. MEROPS family M41, membrane protease FtsH catalytic subunit  56.32 
 
 		 693 aa  629  1e-179  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00746794  normal  0.780653 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  52.84 
 
 		 614 aa  627  1e-178  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  52.68 
 
 		 608 aa  627  1e-178  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2185  FtsH-2 peptidase  54.85 
 
 		 627 aa  627  1e-178  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.81 
 
 		 630 aa  624  1e-177  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.810549  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.64 
 
 		 610 aa  622  1e-177  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  53.52 
 
 		 638 aa  621  1e-176  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.48 
 
 		 610 aa  620  1e-176  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  52.57 
 
 		 665 aa  619  1e-176  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000097295  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0981  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.39 
 
 		 637 aa  620  1e-176  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38316  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0055  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.01 
 
 		 671 aa  618  1e-176  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.26 
 
 		 637 aa  615  1e-175  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0503698  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2569  peptidase M41, FtsH  51.4 
 
 		 641 aa  615  1e-175  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000845189  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.82 
 
 		 643 aa  615  1e-175  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  52.36 
 
 		 673 aa  613  9.999999999999999e-175  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1727  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.1 
 
 		 636 aa  614  9.999999999999999e-175  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0229617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3485  ATP-dependent metalloprotease  52.32 
 
 		 647 aa  609  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000163816  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3612  ATP-dependent metalloprotease  52.48 
 
 		 644 aa  610  1e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000242003  normal  0.275176 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3555  ATP-dependent metalloprotease  52.32 
 
 		 647 aa  609  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00594001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3654  ATP-dependent metalloprotease  52.48 
 
 		 647 aa  610  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000517371  normal  0.935097 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3592  ATP-dependent metalloprotease  52.32 
 
 		 647 aa  609  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00319823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3486  ATP-dependent metalloprotease  52.48 
 
 		 647 aa  611  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000528036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.8 
 
 		 652 aa  609  1e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.66681 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03043  protease, ATP-dependent zinc-metallo  51.99 
 
 		 644 aa  606  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000537455  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0529  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.99 
 
 		 647 aa  606  9.999999999999999e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000027152  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3663  ATP-dependent metalloprotease  51.99 
 
 		 647 aa  606  9.999999999999999e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000724409  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002603  cell division protein FtsH  51.82 
 
 		 660 aa  607  9.999999999999999e-173  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000182706  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0483  ATP-dependent metalloprotease  52.32 
 
 		 643 aa  607  9.999999999999999e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000499281  normal  0.35106 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1133  membrane protease FtsH catalytic subunit  52.17 
 
 		 630 aa  606  9.999999999999999e-173  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0177636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3352  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.32 
 
 		 654 aa  607  9.999999999999999e-173  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000888182  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3471  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.32 
 
 		 650 aa  606  9.999999999999999e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00121984  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3370  ATP-dependent metalloprotease  51.99 
 
 		 647 aa  606  9.999999999999999e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.23805e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0206  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.68 
 
 		 617 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.33 
 
 		 614 aa  605  9.999999999999999e-173  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4500  ATP-dependent metalloprotease  51.99 
 
 		 644 aa  606  9.999999999999999e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000284191  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02994  hypothetical protein  51.99 
 
 		 644 aa  606  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000535271  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1673  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.71 
 
 		 653 aa  606  9.999999999999999e-173  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.720537  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3474  ATP-dependent metalloprotease  51.99 
 
 		 647 aa  607  9.999999999999999e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000879508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0522  ATP-dependent metalloprotease  51.99 
 
 		 644 aa  606  9.999999999999999e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000177959  hitchhiker  0.00179189 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1787  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.26 
 
 		 656 aa  608  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.124146 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3592  ATP-dependent metalloprotease  51.82 
 
 		 647 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000114537  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1475  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.33 
 
 		 639 aa  603  1.0000000000000001e-171  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2383  FtsH peptidase  50.33 
 
 		 639 aa  603  1.0000000000000001e-171  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1268  membrane protease FtsH catalytic subunit  50.5 
 
 		 640 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399956  normal  0.37717 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0566  ATP-dependent metalloprotease  52.15 
 
 		 649 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000344177  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03404  hypothetical protein  51.65 
 
 		 658 aa  602  1.0000000000000001e-171  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.61 
 
 		 612 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1571  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.22 
 
 		 656 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000144806  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.61 
 
 		 612 aa  604  1.0000000000000001e-171  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0801  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.66 
 
 		 651 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000253513  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1975  FtsH peptidase  52.64 
 
 		 639 aa  603  1.0000000000000001e-171  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.182239  hitchhiker  0.00765382 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.31 
 
 		 607 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3736  ATP-dependent metalloprotease  51.49 
 
 		 647 aa  601  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000470783  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1197  cell division protein FtsH  52.01 
 
 		 649 aa  600  1e-170  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2817  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.83 
 
 		 634 aa  600  1e-170  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3396  microtubule-severing ATPase  52.01 
 
 		 659 aa  600  1e-170  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000536506  decreased coverage  0.000042164 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2834  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.49 
 
 		 655 aa  601  1e-170  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000517945  normal  0.0155634 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3985  ATP-dependent metalloprotease  51.32 
 
 		 647 aa  599  1e-170  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000069949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0166  cell division protein FtsH  51.32 
 
 		 651 aa  599  1e-170  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000721667  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0725  FtsH peptidase  50.9 
 
 		 612 aa  598  1e-170  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3602  ATP-dependent metalloprotease  51.49 
 
 		 644 aa  601  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000683259  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0954  vesicle-fusing ATPase  51.74 
 
 		 650 aa  599  1e-170  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000306538  normal  0.326508 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3246  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.24 
 
 		 657 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000231825  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1736  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.82 
 
 		 630 aa  596  1e-169  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.195499  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2841  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.85 
 
 		 657 aa  596  1e-169  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000356985  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.12 
 
 		 634 aa  598  1e-169  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1121  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.24 
 
 		 652 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000570756  unclonable  0.00000000000918847 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>