More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3396 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03043  protease, ATP-dependent zinc-metallo  76.85 
 
 		 644 aa  995    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000537455  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0529  ATP-dependent metalloprotease FtsH  76.96 
 
 		 647 aa  1001    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000027152  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2383  FtsH peptidase  61.86 
 
 		 639 aa  763    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  59.36 
 
 		 614 aa  720    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4718  ATP-dependent metalloprotease FtsH  66.04 
 
 		 637 aa  835    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.518421  normal  0.0121069 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2617  FtsH peptidase  62.48 
 
 		 641 aa  775    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.258853  normal  0.61812 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  68.33 
 
 		 638 aa  897    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3615  membrane protease FtsH catalytic subunit  66.1 
 
 		 640 aa  830    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0280177  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1526  ATP-dependent zinc metallopeptidase  57.93 
 
 		 628 aa  706    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1770  ATP-dependent metalloprotease FtsH  66.51 
 
 		 651 aa  842    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.292571  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3452  ATP-dependent metalloprotease FtsH  75.29 
 
 		 660 aa  964    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.380893  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1691  cell division protein FtsH  61.17 
 
 		 644 aa  712    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1197  cell division protein FtsH  86.62 
 
 		 649 aa  1149    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4497  cell division protein FtsH  65.61 
 
 		 634 aa  820    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.554573  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1482  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.32 
 
 		 628 aa  704    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427373  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1268  membrane protease FtsH catalytic subunit  63.08 
 
 		 640 aa  784    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399956  normal  0.37717 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2734  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.54 
 
 		 617 aa  706    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000099937  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0777  cell division protein FtsH  58.32 
 
 		 628 aa  704    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2842  cell division protease ftsH  67.36 
 
 		 639 aa  857    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2711  cell division protease ftsH  67.36 
 
 		 639 aa  857    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4187  peptidase M41, FtsH  65.45 
 
 		 634 aa  818    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000128423  normal  0.66671 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1738  membrane protease FtsH catalytic subunit  57.07 
 
 		 628 aa  654    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.83044  normal  0.291569 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0944  FtsH peptidase  61.53 
 
 		 626 aa  784    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.129158  normal  0.715931 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0811  ATP-dependent metalloprotease FtsH  71.47 
 
 		 663 aa  940    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.569146  hitchhiker  0.0043584 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2834  ATP-dependent metalloprotease FtsH  94.45 
 
 		 655 aa  1201    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000517945  normal  0.0155634 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2170  peptidase M41, FtsH  58 
 
 		 627 aa  721    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.415072  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0879  FtsH peptidase  54.2 
 
 		 611 aa  679    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1133  membrane protease FtsH catalytic subunit  64.88 
 
 		 630 aa  784    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0177636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2710  peptidase M41, FtsH  59.82 
 
 		 640 aa  688    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1013  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.16 
 
 		 621 aa  709    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0954  vesicle-fusing ATPase  85.71 
 
 		 650 aa  1119    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000306538  normal  0.326508 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1615  cell division protein FtsH  58.32 
 
 		 628 aa  704    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24975  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2569  peptidase M41, FtsH  71.17 
 
 		 641 aa  894    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000845189  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0772  membrane protease FtsH catalytic subunit  67.92 
 
 		 635 aa  826    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000087079  normal  0.0618887 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0665  membrane protease FtsH catalytic subunit  55.24 
 
 		 633 aa  637    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.735845  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  59.49 
 
 		 616 aa  715    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3355  ATP-dependent metalloprotease FtsH  65.89 
 
 		 647 aa  833    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0224278  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4439  FtsH peptidase  58.42 
 
 		 632 aa  705    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4584  ATP-dependent metalloprotease FtsH  66.04 
 
 		 634 aa  830    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0168  ATP-dependent metallopeptidase HflB  54.41 
 
 		 764 aa  712    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000170494  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3612  ATP-dependent metalloprotease  76.05 
 
 		 644 aa  987    Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000242003  normal  0.275176 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1288  cell division protein FtsH  58.32 
 
 		 628 aa  704    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.725972  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  58.48 
 
 		 608 aa  722    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1787  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.93 
 
 		 656 aa  714    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.124146 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  55.93 
 
 		 665 aa  727    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000097295  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0812  ATP-dependent metalloprotease FtsH  63.74 
 
 		 651 aa  810    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0310743  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2318  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.24 
 
 		 633 aa  637    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0771513  normal  0.541776 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6874  cell division protein FtsH  60.18 
 
 		 638 aa  692    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0972491 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0166  cell division protein FtsH  73.15 
 
 		 651 aa  969    Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000721667  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2841  ATP-dependent metalloprotease FtsH  85.82 
 
 		 657 aa  1155    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000356985  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0483  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.77 
 
 		 631 aa  761    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000161272  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1098  membrane protease FtsH catalytic subunit  60.78 
 
 		 640 aa  744    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.13074  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3246  ATP-dependent metalloprotease FtsH  86.36 
 
 		 657 aa  1161    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000231825  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2776  cell division protein FtsH  58.48 
 
 		 628 aa  705    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182791  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1495  FtsH peptidase  55.19 
 
 		 635 aa  667    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.629279  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1818  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.53 
 
 		 638 aa  699    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192895  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0076  membrane protease FtsH catalytic subunit  59.6 
 
 		 644 aa  699    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.597348  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0423  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.98 
 
 		 636 aa  686    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1098  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.54 
 
 		 610 aa  671    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0627303  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0535  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.19 
 
 		 627 aa  644    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000788844  unclonable  0.00000000175333 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2011  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61 
 
 		 639 aa  759    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2720  membrane protease FtsH catalytic subunit  64.23 
 
 		 641 aa  782    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000311283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4743  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.18 
 
 		 638 aa  692    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0783  membrane protease FtsH catalytic subunit  61.21 
 
 		 631 aa  785    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000394436  unclonable  0.000000272669 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2852  membrane protease FtsH catalytic subunit  62.31 
 
 		 640 aa  766    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1262  FtsH peptidase  55.8 
 
 		 629 aa  709    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1000  ATP-dependent metalloprotease FtsH  86.65 
 
 		 656 aa  1163    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000544697  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4141  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.35 
 
 		 638 aa  694    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3081  ATP-dependent metalloprotease FtsH  63.09 
 
 		 655 aa  792    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.312439  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3506  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.46 
 
 		 638 aa  695    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2020  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.39 
 
 		 628 aa  656    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.185769 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2188  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.92 
 
 		 649 aa  721    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350229  normal  0.438236 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  73.34 
 
 		 627 aa  947    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0064  FtsH peptidase  55.22 
 
 		 637 aa  681    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0366  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.48 
 
 		 641 aa  713    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.444728  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1599  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.75 
 
 		 647 aa  687    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.238697 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0816  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.03 
 
 		 627 aa  705    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1512  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.32 
 
 		 628 aa  704    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0580139  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1635  cell division protein FtsH  58.1 
 
 		 649 aa  714    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.771629  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1571  ATP-dependent metalloprotease FtsH  73.94 
 
 		 656 aa  944    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000144806  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  59.11 
 
 		 645 aa  717    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0571  cell division protein FtsH  58.32 
 
 		 628 aa  704    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4509  membrane protease FtsH catalytic subunit  56.7 
 
 		 652 aa  708    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0725  FtsH peptidase  71.22 
 
 		 612 aa  926    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0566  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.07 
 
 		 633 aa  635    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2611  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.72 
 
 		 642 aa  759    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1019  membrane protease FtsH catalytic subunit  85.65 
 
 		 657 aa  1152    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000780208  hitchhiker  0.000608132 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1084  membrane protease FtsH catalytic subunit  86.68 
 
 		 657 aa  1152    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000445375  normal  0.0888545 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1975  FtsH peptidase  67.74 
 
 		 639 aa  856    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.182239  hitchhiker  0.00765382 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0983  ATP-dependent metalloprotease FtsH  86.49 
 
 		 657 aa  1173    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000296667  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0580  cell division protein FtsH  58.32 
 
 		 628 aa  704    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.51431  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2412  membrane protease FtsH catalytic subunit  58.83 
 
 		 628 aa  664    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.278023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1174  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.92 
 
 		 631 aa  700    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.378107  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62860  cell division protein FtsH  67.24 
 
 		 639 aa  822    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1297  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.42 
 
 		 631 aa  706    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.17526  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.42 
 
 		 652 aa  709    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  60.37 
 
 		 673 aa  737    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1023  membrane protease FtsH catalytic subunit  86.49 
 
 		 657 aa  1156    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000161981  hitchhiker  0.0000832625 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0211  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.2 
 
 		 655 aa  752    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.86 
 
 		 621 aa  718    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>