More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0014 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0150  cell division protein FtsH, putative  54.65 
 
 
700 aa  660    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0063  cell division protein FtsH  54.21 
 
 
633 aa  679    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0016  cell division protein FtsH  74.58 
 
 
658 aa  959    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0064  cell division protein FtsH  54.21 
 
 
633 aa  679    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.651636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0060  cell division protein  54.21 
 
 
633 aa  679    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0060  cell division protein  54.21 
 
 
633 aa  679    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.527958  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0064  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.32 
 
 
635 aa  687    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.91 
 
 
633 aa  679    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0064  cell division protein FtsH  54.21 
 
 
633 aa  679    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550597  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0072  cell division protein FtsH  55.27 
 
 
633 aa  677    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.12055  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0546  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.47 
 
 
697 aa  661    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5244  cell division protein FtsH  55.27 
 
 
633 aa  676    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.293032 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0076  cell division protein FtsH  54.21 
 
 
633 aa  679    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0454651  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0268  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.21 
 
 
702 aa  718    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0072472  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.3 
 
 
632 aa  687    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0073  cell division protein FtsH  54.21 
 
 
633 aa  679    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.755624 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.79 
 
 
639 aa  681    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0018  FtsH-2 peptidase  59.97 
 
 
695 aa  756    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0188  ATP-dependent Zn protease  57.74 
 
 
734 aa  659    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0276  ATP-dependent Zn protease  58.89 
 
 
708 aa  738    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00629107  normal  0.162688 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0404  ATP-dependent Zn protease  58.32 
 
 
700 aa  662    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.083977  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0014  cell division protein  100 
 
 
655 aa  1335    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0533  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.47 
 
 
697 aa  661    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.37995  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.09 
 
 
602 aa  631  1e-179  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.45 
 
 
611 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  50.55 
 
 
638 aa  596  1e-169  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.68 
 
 
615 aa  592  1e-168  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2472  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.64 
 
 
601 aa  592  1e-168  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2786  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.64 
 
 
601 aa  591  1e-167  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.08 
 
 
639 aa  587  1e-166  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2895  Mername-AA223 peptidase  51.76 
 
 
682 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0981  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.37 
 
 
637 aa  580  1e-164  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38316  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.08 
 
 
630 aa  582  1e-164  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.2 
 
 
643 aa  579  1e-164  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02180  membrane protease FtsH catalytic subunit  56.71 
 
 
759 aa  578  1.0000000000000001e-163  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.203861  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0081  FtsH-2 peptidase. Metallo peptidase. MEROPS family M41, membrane protease FtsH catalytic subunit  51.32 
 
 
693 aa  578  1.0000000000000001e-163  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00746794  normal  0.780653 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3627  metalloprotease  49.21 
 
 
681 aa  576  1.0000000000000001e-163  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.840583  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  49.92 
 
 
614 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.34 
 
 
620 aa  574  1.0000000000000001e-162  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0703  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.53 
 
 
650 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0142787  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1727  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.04 
 
 
636 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0229617  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  49.19 
 
 
616 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0783  membrane protease FtsH catalytic subunit  47.28 
 
 
631 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000394436  unclonable  0.000000272669 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3288  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.28 
 
 
657 aa  569  1e-161  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000787677  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.95 
 
 
612 aa  568  1e-161  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.79 
 
 
612 aa  568  1e-161  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3424  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.28 
 
 
657 aa  569  1e-161  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000853792  decreased coverage  0.000155742 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1975  FtsH peptidase  47.91 
 
 
639 aa  570  1e-161  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.182239  hitchhiker  0.00765382 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.64 
 
 
621 aa  568  1e-161  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3246  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.28 
 
 
657 aa  569  1e-161  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000231825  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002603  cell division protein FtsH  47.27 
 
 
660 aa  565  1e-160  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000182706  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.99 
 
 
608 aa  568  1e-160  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3452  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.14 
 
 
660 aa  568  1e-160  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.380893  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0780  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.59 
 
 
643 aa  568  1e-160  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0715854 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0105  FtsH-2 peptidase  49.68 
 
 
645 aa  566  1e-160  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0152057  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.15 
 
 
610 aa  567  1e-160  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1019  membrane protease FtsH catalytic subunit  46.44 
 
 
657 aa  565  1e-160  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000780208  hitchhiker  0.000608132 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1084  membrane protease FtsH catalytic subunit  45.36 
 
 
657 aa  565  1e-160  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000445375  normal  0.0888545 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0095  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.76 
 
 
599 aa  566  1e-160  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1121  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.7 
 
 
652 aa  565  1e-160  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000570756  unclonable  0.00000000000918847 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3355  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.42 
 
 
647 aa  568  1e-160  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0224278  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.99 
 
 
610 aa  565  1e-160  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1526  ATP-dependent zinc metallopeptidase  47.85 
 
 
628 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155575  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3396  microtubule-severing ATPase  45.43 
 
 
659 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000536506  decreased coverage  0.000042164 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1197  cell division protein FtsH  46.54 
 
 
649 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1721  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.05 
 
 
628 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.54064  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1970  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.9 
 
 
656 aa  562  1.0000000000000001e-159  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000729584  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  48.42 
 
 
608 aa  565  1.0000000000000001e-159  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1506  ATP-dependent metallopeptidase HflB  48.37 
 
 
647 aa  562  1.0000000000000001e-159  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0168  ATP-dependent metallopeptidase HflB  46.89 
 
 
764 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000170494  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2841  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.13 
 
 
657 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000356985  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  47.21 
 
 
645 aa  564  1.0000000000000001e-159  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0983  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.91 
 
 
657 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000296667  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1023  membrane protease FtsH catalytic subunit  46.28 
 
 
657 aa  565  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000161981  hitchhiker  0.0000832625 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03404  hypothetical protein  47.18 
 
 
658 aa  563  1.0000000000000001e-159  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1467  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.34 
 
 
644 aa  565  1.0000000000000001e-159  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179606  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4718  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.22 
 
 
637 aa  559  1e-158  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.518421  normal  0.0121069 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2711  cell division protease ftsH  47.79 
 
 
639 aa  561  1e-158  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3568  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.65 
 
 
657 aa  560  1e-158  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000520805  hitchhiker  0.00000681699 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.67 
 
 
645 aa  560  1e-158  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.107147  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42890  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.16 
 
 
637 aa  559  1e-158  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2834  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.35 
 
 
655 aa  559  1e-158  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000517945  normal  0.0155634 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8426  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.12 
 
 
672 aa  561  1e-158  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1268  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.3 
 
 
631 aa  559  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.972429  normal  0.432924 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0166  cell division protein FtsH  46.38 
 
 
651 aa  559  1e-158  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000721667  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2636  cell division protein FtsH  49.04 
 
 
641 aa  561  1e-158  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.235612  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4925  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.28 
 
 
640 aa  559  1e-158  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147921  normal  0.185615 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.34 
 
 
640 aa  559  1e-158  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.01 
 
 
648 aa  560  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202032  normal  0.0464003 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2029  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.89 
 
 
628 aa  560  1e-158  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1186  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.22 
 
 
631 aa  559  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.21079 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0055  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.92 
 
 
671 aa  560  1e-158  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.05 
 
 
607 aa  559  1e-158  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0370  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.41 
 
 
604 aa  561  1e-158  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000686263  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2896  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.61 
 
 
750 aa  558  1e-158  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1174  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.22 
 
 
631 aa  559  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.378107  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0151  Mername-AA223 peptidase  57.4 
 
 
689 aa  558  1e-158  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1297  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.3 
 
 
631 aa  559  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.17526  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.53 
 
 
652 aa  559  1e-158  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0074  cell division protein  49.33 
 
 
645 aa  558  1e-158  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>