More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0404 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0268  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.97 
 
 
702 aa  723    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0072472  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0150  cell division protein FtsH, putative  50.58 
 
 
700 aa  649    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0063  cell division protein FtsH  54.69 
 
 
633 aa  649    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.76 
 
 
632 aa  666    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0016  cell division protein FtsH  58.48 
 
 
658 aa  724    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0064  cell division protein FtsH  54.85 
 
 
633 aa  652    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.651636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0060  cell division protein  54.85 
 
 
633 aa  652    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0060  cell division protein  54.85 
 
 
633 aa  652    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.527958  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0064  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.25 
 
 
635 aa  666    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.42 
 
 
633 aa  652    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0064  cell division protein FtsH  54.85 
 
 
633 aa  652    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550597  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.46 
 
 
639 aa  664    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0073  cell division protein FtsH  54.85 
 
 
633 aa  652    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.755624 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0546  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.47 
 
 
697 aa  647    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0076  cell division protein FtsH  54.85 
 
 
633 aa  652    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0454651  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0018  FtsH-2 peptidase  54.39 
 
 
695 aa  700    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0188  ATP-dependent Zn protease  64.8 
 
 
734 aa  749    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0276  ATP-dependent Zn protease  55.68 
 
 
708 aa  728    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00629107  normal  0.162688 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0404  ATP-dependent Zn protease  100 
 
 
700 aa  1419    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.083977  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0014  cell division protein  57.68 
 
 
655 aa  701    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5244  cell division protein FtsH  54.42 
 
 
633 aa  652    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.293032 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0072  cell division protein FtsH  54.26 
 
 
633 aa  649    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.12055  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0533  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.47 
 
 
697 aa  647    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.37995  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.8 
 
 
611 aa  598  1e-169  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  50.33 
 
 
638 aa  589  1e-167  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.65 
 
 
602 aa  587  1e-166  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.94 
 
 
639 aa  587  1e-166  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.3 
 
 
615 aa  575  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.3 
 
 
687 aa  571  1e-161  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  48.24 
 
 
616 aa  570  1e-161  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0081  FtsH-2 peptidase. Metallo peptidase. MEROPS family M41, membrane protease FtsH catalytic subunit  46.42 
 
 
693 aa  570  1e-161  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00746794  normal  0.780653 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2786  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.8 
 
 
601 aa  568  1e-161  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.51 
 
 
620 aa  566  1e-160  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0783  membrane protease FtsH catalytic subunit  49.43 
 
 
631 aa  568  1e-160  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000394436  unclonable  0.000000272669 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0981  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.35 
 
 
637 aa  565  1e-160  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38316  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2029  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.64 
 
 
628 aa  565  1e-160  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0095  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.03 
 
 
599 aa  565  1e-160  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0151  Mername-AA223 peptidase  55.77 
 
 
689 aa  565  1e-160  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1526  ATP-dependent zinc metallopeptidase  48.48 
 
 
628 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155575  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1721  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.64 
 
 
628 aa  565  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.54064  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0168  ATP-dependent metallopeptidase HflB  48.73 
 
 
764 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000170494  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2011  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.79 
 
 
639 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  47.69 
 
 
645 aa  562  1.0000000000000001e-159  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2472  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.31 
 
 
601 aa  565  1.0000000000000001e-159  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2611  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.19 
 
 
642 aa  558  1e-158  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728917  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.83 
 
 
648 aa  561  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202032  normal  0.0464003 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2852  membrane protease FtsH catalytic subunit  49.19 
 
 
640 aa  560  1e-158  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3196  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.14 
 
 
643 aa  561  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.766379  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3355  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.44 
 
 
647 aa  561  1e-158  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0224278  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4925  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.87 
 
 
640 aa  559  1e-158  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147921  normal  0.185615 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2617  FtsH peptidase  48.71 
 
 
641 aa  556  1e-157  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.258853  normal  0.61812 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2170  peptidase M41, FtsH  56.35 
 
 
627 aa  556  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.415072  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0703  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.36 
 
 
650 aa  556  1e-157  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0142787  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  47.66 
 
 
608 aa  556  1e-157  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1020  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.21 
 
 
659 aa  555  1e-157  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000208375  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0854  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.92 
 
 
621 aa  556  1e-157  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.946153  normal  0.500418 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01240  membrane protease FtsH catalytic subunit  56.24 
 
 
696 aa  555  1e-157  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1013  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.49 
 
 
621 aa  557  1e-157  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1223  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.08 
 
 
651 aa  556  1e-157  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.514183  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.8 
 
 
630 aa  554  1e-156  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  47.07 
 
 
614 aa  552  1e-156  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1635  cell division protein FtsH  50.25 
 
 
649 aa  553  1e-156  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.771629  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0944  FtsH peptidase  48.45 
 
 
626 aa  554  1e-156  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.129158  normal  0.715931 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3627  metalloprotease  48.89 
 
 
681 aa  554  1e-156  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.840583  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1475  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.47 
 
 
639 aa  555  1e-156  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2383  FtsH peptidase  48.47 
 
 
639 aa  555  1e-156  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2460  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.64 
 
 
635 aa  553  1e-156  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.59 
 
 
645 aa  555  1e-156  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0714  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.88 
 
 
634 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.87442  normal  0.0617842 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1268  membrane protease FtsH catalytic subunit  47.76 
 
 
640 aa  554  1e-156  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399956  normal  0.37717 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0229  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50 
 
 
608 aa  554  1e-156  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2188  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.15 
 
 
649 aa  555  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350229  normal  0.438236 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62860  cell division protein FtsH  48.79 
 
 
639 aa  553  1e-156  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.49 
 
 
652 aa  555  1e-156  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1736  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.18 
 
 
630 aa  555  1e-156  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.195499  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.55 
 
 
621 aa  554  1e-156  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5471  cell division protein FtsH  48.79 
 
 
642 aa  553  1e-156  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42890  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.35 
 
 
637 aa  550  1e-155  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4718  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.04 
 
 
637 aa  551  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.518421  normal  0.0121069 
 
 
-
 
NC_004310  BR1691  cell division protein FtsH  50.08 
 
 
644 aa  551  1e-155  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0145  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.25 
 
 
657 aa  551  1e-155  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000285756  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.29 
 
 
676 aa  550  1e-155  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2624  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.97 
 
 
638 aa  551  1e-155  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642505  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02180  membrane protease FtsH catalytic subunit  46.96 
 
 
759 aa  550  1e-155  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.203861  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1495  FtsH peptidase  48.48 
 
 
635 aa  551  1e-155  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.629279  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2372  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.48 
 
 
635 aa  551  1e-155  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4584  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.04 
 
 
634 aa  551  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794949  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4719  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.72 
 
 
634 aa  549  1e-155  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2185  FtsH-2 peptidase  48.65 
 
 
627 aa  549  1e-155  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1975  FtsH peptidase  48.3 
 
 
639 aa  550  1e-155  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.182239  hitchhiker  0.00765382 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8426  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.89 
 
 
672 aa  548  1e-154  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2895  Mername-AA223 peptidase  56.85 
 
 
682 aa  546  1e-154  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  45.76 
 
 
665 aa  546  1e-154  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000097295  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0297  FtsH peptidase  48.71 
 
 
613 aa  545  1e-154  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2817  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.98 
 
 
634 aa  548  1e-154  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02481  cell division protein FtsH2  48.48 
 
 
617 aa  547  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0725  FtsH peptidase  52.15 
 
 
612 aa  548  1e-154  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1852  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.48 
 
 
612 aa  548  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3612  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02471  cell division protein FtsH2  48.17 
 
 
617 aa  548  1e-154  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2522  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.71 
 
 
635 aa  546  1e-154  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000162887  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>