More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_02471 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_0357  ATP-dependent metalloprotease FtsH  73.26 
 
 
613 aa  900    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0125367  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3313  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.06 
 
 
628 aa  667    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.711705 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4255  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.17 
 
 
632 aa  684    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0659148 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.73 
 
 
620 aa  638    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5220  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.09 
 
 
631 aa  649    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1595  cell division protein FtsH2  83.6 
 
 
615 aa  1023    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.169685  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0575  FtsH peptidase  72.29 
 
 
613 aa  889    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0102882  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2444  FtsH peptidase  53.41 
 
 
633 aa  639    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000343724  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3190  FtsH peptidase  58.29 
 
 
628 aa  684    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0440312  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08451  FtsH ATP-dependent protease-like protein  53.94 
 
 
637 aa  648    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0508625  hitchhiker  0.00322552 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03061  cell division protein FtsH2  83.44 
 
 
615 aa  1022    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2043  peptidase M41, FtsH  80.61 
 
 
617 aa  999    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0301  FtsH peptidase  80.74 
 
 
616 aa  998    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02481  cell division protein FtsH2  84.39 
 
 
602 aa  1062    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0228  cell division protein FtsH2  98.54 
 
 
617 aa  1233    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.288231  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0751  FtsH peptidase  53.59 
 
 
637 aa  644    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0297  FtsH peptidase  75.41 
 
 
613 aa  962    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0942  FtsH peptidase  57 
 
 
630 aa  674    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1852  ATP-dependent metalloprotease FtsH  73.29 
 
 
612 aa  904    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3612  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08031  FtsH ATP-dependent protease-like protein  53.66 
 
 
637 aa  647    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  72.8 
 
 
616 aa  887    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.43 
 
 
602 aa  653    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08411  FtsH ATP-dependent protease-like protein  53.75 
 
 
637 aa  643    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02581  cell division protein FtsH2  97.25 
 
 
619 aa  1205    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0630  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.39 
 
 
628 aa  656    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0145  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.04 
 
 
657 aa  638    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000285756  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.93 
 
 
615 aa  665    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0614  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.39 
 
 
628 aa  656    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  72.8 
 
 
616 aa  887    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3755  FtsH peptidase  73.54 
 
 
613 aa  913    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.916692 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4594  FtsH peptidase  56.8 
 
 
628 aa  672    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08041  FtsH ATP-dependent protease-like protein  53.82 
 
 
637 aa  649    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0315531  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02471  cell division protein FtsH2  100 
 
 
617 aa  1248    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3575  ATP-dependent metalloprotease FtsH  71.97 
 
 
616 aa  881    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.873251 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17504  predicted protein  57.41 
 
 
673 aa  666    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02481  cell division protein FtsH2  98.7 
 
 
617 aa  1236    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23831  cell division protein FtsH2  83.95 
 
 
615 aa  1004    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0657792 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35099  predicted protein  63.41 
 
 
651 aa  726    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.235498  decreased coverage  0.000591243 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3058  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.97 
 
 
628 aa  684    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0539417  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1438  FtsH peptidase  55.93 
 
 
639 aa  634  1e-180  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.226378  normal  0.078862 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.14 
 
 
639 aa  634  1e-180  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09651  FtsH ATP-dependent protease-like protein  53.33 
 
 
640 aa  631  1e-180  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.116112  normal  0.424003 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0293  FtsH peptidase  53.33 
 
 
640 aa  631  1e-179  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.24 
 
 
630 aa  628  1e-179  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.22 
 
 
643 aa  629  1e-179  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0998  FtsH peptidase  55.46 
 
 
632 aa  625  1e-178  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.438302  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15451  FtsH ATP-dependent protease-like protein  54.37 
 
 
638 aa  622  1e-177  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  52.55 
 
 
616 aa  624  1e-177  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2185  FtsH-2 peptidase  51.84 
 
 
627 aa  621  1e-177  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2834  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.2 
 
 
655 aa  619  1e-176  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000517945  normal  0.0155634 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1197  cell division protein FtsH  52.05 
 
 
649 aa  615  1e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1842  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.67 
 
 
640 aa  615  1e-175  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3396  microtubule-severing ATPase  52.53 
 
 
659 aa  616  1e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000536506  decreased coverage  0.000042164 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0463  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.52 
 
 
655 aa  615  1e-175  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.35 
 
 
630 aa  615  1e-175  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.810549  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  52.15 
 
 
608 aa  616  1e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.67 
 
 
640 aa  615  1e-175  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2664  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.28 
 
 
656 aa  617  1e-175  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00646659 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.18 
 
 
639 aa  616  1e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.88 
 
 
652 aa  617  1e-175  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0229  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.61 
 
 
608 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2841  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.72 
 
 
657 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000356985  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  51.4 
 
 
614 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4361  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.27 
 
 
640 aa  613  9.999999999999999e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0064  cell division protein FtsH  53.01 
 
 
633 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.651636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0060  cell division protein  53.01 
 
 
633 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0060  cell division protein  53.01 
 
 
633 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.527958  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3288  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.72 
 
 
657 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000787677  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0073  cell division protein FtsH  53.01 
 
 
633 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.755624 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0076  cell division protein FtsH  53.01 
 
 
633 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0454651  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0064  cell division protein FtsH  53.01 
 
 
633 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550597  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3424  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.72 
 
 
657 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000853792  decreased coverage  0.000155742 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1000  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.7 
 
 
656 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000544697  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3246  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.72 
 
 
657 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000231825  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0081  FtsH-2 peptidase. Metallo peptidase. MEROPS family M41, membrane protease FtsH catalytic subunit  53.95 
 
 
693 aa  613  9.999999999999999e-175  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00746794  normal  0.780653 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0072  cell division protein FtsH  53.01 
 
 
633 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.12055  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1019  membrane protease FtsH catalytic subunit  52.05 
 
 
657 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000780208  hitchhiker  0.000608132 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1084  membrane protease FtsH catalytic subunit  52.05 
 
 
657 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000445375  normal  0.0888545 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1121  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.47 
 
 
652 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000570756  unclonable  0.00000000000918847 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0983  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.14 
 
 
657 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000296667  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1023  membrane protease FtsH catalytic subunit  51.89 
 
 
657 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000161981  hitchhiker  0.0000832625 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  51.73 
 
 
638 aa  610  1e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0063  cell division protein FtsH  53.01 
 
 
633 aa  611  1e-173  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5244  cell division protein FtsH  52.52 
 
 
633 aa  609  1e-173  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.293032 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.88 
 
 
638 aa  610  1e-173  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0981  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.47 
 
 
637 aa  610  1e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38316  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1806  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.66 
 
 
651 aa  610  1e-173  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266956  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0095  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.83 
 
 
599 aa  609  1e-173  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3067  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.2 
 
 
650 aa  610  1e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000774852  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.23 
 
 
637 aa  609  1e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0503698  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0954  vesicle-fusing ATPase  51.38 
 
 
650 aa  608  1e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000306538  normal  0.326508 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3568  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.03 
 
 
657 aa  608  1e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000520805  hitchhiker  0.00000681699 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3736  ATP-dependent metalloprotease  52.22 
 
 
647 aa  606  9.999999999999999e-173  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000470783  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.28 
 
 
607 aa  606  9.999999999999999e-173  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.36 
 
 
633 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0105  FtsH-2 peptidase  53.52 
 
 
645 aa  607  9.999999999999999e-173  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0152057  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3602  ATP-dependent metalloprotease  52.22 
 
 
644 aa  606  9.999999999999999e-173  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000683259  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0725  FtsH peptidase  49.84 
 
 
612 aa  607  9.999999999999999e-173  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0801  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.05 
 
 
651 aa  607  9.999999999999999e-173  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000253513  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.41 
 
 
676 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>