More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0276 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0150  cell division protein FtsH, putative  51.64 
 
 		 700 aa  642    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0063  cell division protein FtsH  53.94 
 
 		 633 aa  659    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0016  cell division protein FtsH  60.9 
 
 		 658 aa  751    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0064  cell division protein FtsH  53.79 
 
 		 633 aa  657    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.651636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0060  cell division protein  53.79 
 
 		 633 aa  657    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0533  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.05 
 
 		 697 aa  649    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.37995  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0060  cell division protein  53.79 
 
 		 633 aa  657    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.527958  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0064  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.64 
 
 		 635 aa  681    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0064  cell division protein FtsH  53.79 
 
 		 633 aa  657    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550597  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5244  cell division protein FtsH  53.79 
 
 		 633 aa  658    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.293032 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0546  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.05 
 
 		 697 aa  649    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.73 
 
 		 632 aa  677    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0076  cell division protein FtsH  53.79 
 
 		 633 aa  657    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0454651  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0268  ATP-dependent metalloprotease FtsH  64.55 
 
 		 702 aa  794    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0072472  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0073  cell division protein FtsH  53.79 
 
 		 633 aa  657    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.755624 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0018  FtsH-2 peptidase  60.43 
 
 		 695 aa  729    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0188  ATP-dependent Zn protease  60.03 
 
 		 734 aa  694    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0276  ATP-dependent Zn protease  100 
 
 		 708 aa  1445    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00629107  normal  0.162688 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0404  ATP-dependent Zn protease  55.4 
 
 		 700 aa  670    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.083977  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0014  cell division protein  59.43 
 
 		 655 aa  735    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0072  cell division protein FtsH  53.79 
 
 		 633 aa  657    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.12055  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.47 
 
 		 639 aa  663    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.63 
 
 		 633 aa  660    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.96 
 
 		 602 aa  617  1e-175  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.92 
 
 		 611 aa  596  1e-169  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.42 
 
 		 639 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.05 
 
 		 615 aa  570  1e-161  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2029  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.02 
 
 		 628 aa  568  1e-160  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.45 
 
 		 630 aa  565  1e-160  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0229  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.59 
 
 		 608 aa  565  1e-160  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1721  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.85 
 
 		 628 aa  567  1e-160  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.54064  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1526  ATP-dependent zinc metallopeptidase  50.34 
 
 		 628 aa  564  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.41 
 
 		 620 aa  564  1.0000000000000001e-159  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0081  FtsH-2 peptidase. Metallo peptidase. MEROPS family M41, membrane protease FtsH catalytic subunit  55.95 
 
 		 693 aa  562  1.0000000000000001e-159  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00746794  normal  0.780653 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.01 
 
 		 610 aa  561  1e-158  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.82 
 
 		 610 aa  561  1e-158  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0095  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.31 
 
 		 599 aa  559  1e-158  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0204  Mername-AA223 peptidase  57.74 
 
 		 654 aa  556  1e-157  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.176031  normal  0.159439 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  47.37 
 
 		 614 aa  555  1e-156  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  47.94 
 
 		 638 aa  553  1e-156  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3083  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.95 
 
 		 640 aa  553  1e-156  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.81 
 
 		 612 aa  553  1e-156  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2170  peptidase M41, FtsH  47.62 
 
 		 627 aa  552  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.415072  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  45.77 
 
 		 608 aa  553  1e-156  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2188  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.91 
 
 		 649 aa  553  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350229  normal  0.438236 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.96 
 
 		 612 aa  554  1e-156  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2895  Mername-AA223 peptidase  57.83 
 
 		 682 aa  551  1e-155  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.21 
 
 		 643 aa  549  1e-155  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0145  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.67 
 
 		 657 aa  551  1e-155  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000285756  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0854  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.34 
 
 		 621 aa  551  1e-155  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.946153  normal  0.500418 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.15 
 
 		 621 aa  549  1e-155  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02180  membrane protease FtsH catalytic subunit  45.64 
 
 		 759 aa  550  1e-155  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.203861  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3447  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.35 
 
 		 679 aa  548  1e-154  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.311187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1186  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.06 
 
 		 631 aa  546  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.21079 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1013  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.83 
 
 		 621 aa  547  1e-154  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0879  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.79 
 
 		 629 aa  547  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.200568  normal  0.0679699 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3627  metalloprotease  47.57 
 
 		 681 aa  546  1e-154  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.840583  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1262  FtsH peptidase  47.22 
 
 		 629 aa  547  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2786  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.1 
 
 		 601 aa  546  1e-154  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2472  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.78 
 
 		 601 aa  546  1e-154  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1174  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.06 
 
 		 631 aa  546  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.378107  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0206  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.66 
 
 		 617 aa  548  1e-154  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5386  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.72 
 
 		 642 aa  544  1e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.853585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1506  ATP-dependent metallopeptidase HflB  46.11 
 
 		 647 aa  542  1e-153  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3196  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.64 
 
 		 643 aa  544  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.766379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1512  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.89 
 
 		 628 aa  544  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0580139  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.22 
 
 		 607 aa  543  1e-153  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0777  cell division protein FtsH  48.89 
 
 		 628 aa  544  1e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0283  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.88 
 
 		 640 aa  543  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0580  cell division protein FtsH  48.89 
 
 		 628 aa  544  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.51431  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.88 
 
 		 648 aa  544  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202032  normal  0.0464003 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1615  cell division protein FtsH  48.89 
 
 		 628 aa  544  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24975  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4439  FtsH peptidase  48.89 
 
 		 632 aa  545  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2023  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.72 
 
 		 631 aa  542  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.39 
 
 		 640 aa  544  1e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2776  cell division protein FtsH  47.69 
 
 		 628 aa  544  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182791  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1482  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.89 
 
 		 628 aa  544  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427373  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4335  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.73 
 
 		 640 aa  542  1e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0962233 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1673  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.84 
 
 		 653 aa  542  1e-153  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.720537  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0816  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.72 
 
 		 627 aa  545  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2185  FtsH-2 peptidase  47.69 
 
 		 627 aa  545  1e-153  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  46.04 
 
 		 645 aa  545  1e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1268  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.72 
 
 		 631 aa  545  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.972429  normal  0.432924 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1297  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.72 
 
 		 631 aa  545  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.17526  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6874  cell division protein FtsH  46.76 
 
 		 638 aa  543  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0972491 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0627  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.63 
 
 		 682 aa  543  1e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0250398  normal  0.798069 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0085  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.84 
 
 		 619 aa  543  1e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0128077  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0571  cell division protein FtsH  48.89 
 
 		 628 aa  544  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1288  cell division protein FtsH  48.89 
 
 		 628 aa  544  1e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.725972  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2896  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.13 
 
 		 750 aa  541  9.999999999999999e-153  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0105  FtsH-2 peptidase  47.58 
 
 		 645 aa  540  9.999999999999999e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0152057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02030  membrane protease FtsH catalytic subunit  46.56 
 
 		 783 aa  539  9.999999999999999e-153  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000829689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4314  Mername-AA223 peptidase  57.23 
 
 		 753 aa  539  9.999999999999999e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0642  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.33 
 
 		 616 aa  541  9.999999999999999e-153  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1440  cell division protein  45.74 
 
 		 650 aa  540  9.999999999999999e-153  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4840  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.04 
 
 		 642 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3506  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.21 
 
 		 638 aa  539  9.999999999999999e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0151  Mername-AA223 peptidase  49.74 
 
 		 689 aa  540  9.999999999999999e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.57 
 
 		 652 aa  540  9.999999999999999e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35650  membrane protease FtsH catalytic subunit  44.93 
 
 		 798 aa  538  9.999999999999999e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.399414  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>