More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3575 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03043  protease, ATP-dependent zinc-metallo  53.44 
 
 
644 aa  637    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000537455  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0529  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.44 
 
 
647 aa  637    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000027152  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1842  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.81 
 
 
640 aa  648    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  53.47 
 
 
614 aa  640    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5220  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.59 
 
 
631 aa  674    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23831  cell division protein FtsH2  75.29 
 
 
615 aa  879    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0657792 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  53.16 
 
 
638 aa  635    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3612  ATP-dependent metalloprotease  53.93 
 
 
644 aa  639    Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000242003  normal  0.275176 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.63 
 
 
602 aa  656    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0981  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.01 
 
 
637 aa  648    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38316  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.17 
 
 
630 aa  644    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3575  ATP-dependent metalloprotease FtsH  100 
 
 
616 aa  1242    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.873251 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.83 
 
 
637 aa  638    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0503698  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4255  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.92 
 
 
632 aa  721    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0659148 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.09 
 
 
615 aa  681    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3592  ATP-dependent metalloprotease  53.44 
 
 
647 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00319823  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1467  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.65 
 
 
644 aa  635    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179606  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0293  FtsH peptidase  55.52 
 
 
640 aa  652    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.41 
 
 
620 aa  649    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1595  cell division protein FtsH2  72.88 
 
 
615 aa  878    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.169685  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3663  ATP-dependent metalloprotease  53.44 
 
 
647 aa  637    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000724409  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3592  ATP-dependent metalloprotease  53.28 
 
 
647 aa  635    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000114537  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0575  FtsH peptidase  86.09 
 
 
613 aa  1051    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0102882  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2444  FtsH peptidase  58.83 
 
 
633 aa  670    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000343724  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3190  FtsH peptidase  61.95 
 
 
628 aa  711    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0440312  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  54.52 
 
 
616 aa  657    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09651  FtsH ATP-dependent protease-like protein  55.52 
 
 
640 aa  650    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.116112  normal  0.424003 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1852  ATP-dependent metalloprotease FtsH  84.43 
 
 
612 aa  1032    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3612  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2043  peptidase M41, FtsH  74.59 
 
 
617 aa  891    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0301  FtsH peptidase  75.33 
 
 
616 aa  892    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1438  FtsH peptidase  57.54 
 
 
639 aa  642    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.226378  normal  0.078862 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  54.83 
 
 
665 aa  643    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000097295  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  88.93 
 
 
616 aa  1068    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0801  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.61 
 
 
651 aa  640    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000253513  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0228  cell division protein FtsH2  72.15 
 
 
617 aa  905    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.288231  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0751  FtsH peptidase  55.2 
 
 
637 aa  660    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0297  FtsH peptidase  84.92 
 
 
613 aa  1056    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0942  FtsH peptidase  62.46 
 
 
630 aa  693    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3471  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.77 
 
 
650 aa  645    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00121984  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03061  cell division protein FtsH2  72.88 
 
 
615 aa  878    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3486  ATP-dependent metalloprotease  53.61 
 
 
647 aa  639    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000528036  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0566  ATP-dependent metalloprotease  53.65 
 
 
649 aa  639    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000344177  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0105  FtsH-2 peptidase  56.51 
 
 
645 aa  639    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0152057  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0522  ATP-dependent metalloprotease  53.44 
 
 
644 aa  637    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000177959  hitchhiker  0.00179189 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.85 
 
 
611 aa  648    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3474  ATP-dependent metalloprotease  53.44 
 
 
647 aa  637    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000879508  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08031  FtsH ATP-dependent protease-like protein  55.36 
 
 
637 aa  665    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3370  ATP-dependent metalloprotease  53.44 
 
 
647 aa  637    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.23805e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.26 
 
 
638 aa  643    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2834  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.65 
 
 
655 aa  643    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000517945  normal  0.0155634 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4361  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.35 
 
 
640 aa  647    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0081  FtsH-2 peptidase. Metallo peptidase. MEROPS family M41, membrane protease FtsH catalytic subunit  54.79 
 
 
693 aa  640    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00746794  normal  0.780653 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3352  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.77 
 
 
654 aa  647    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000888182  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0483  ATP-dependent metalloprotease  53.28 
 
 
643 aa  642    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000499281  normal  0.35106 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08411  FtsH ATP-dependent protease-like protein  55.2 
 
 
637 aa  660    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0357  ATP-dependent metalloprotease FtsH  86.42 
 
 
613 aa  1047    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0125367  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.81 
 
 
640 aa  648    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02994  hypothetical protein  53.44 
 
 
644 aa  637    Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000535271  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02481  cell division protein FtsH2  74.79 
 
 
602 aa  908    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0145  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.44 
 
 
657 aa  646    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000285756  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1806  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.8 
 
 
651 aa  636    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266956  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2185  FtsH-2 peptidase  60.75 
 
 
627 aa  642    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17504  predicted protein  58.26 
 
 
673 aa  648    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  53.48 
 
 
645 aa  636    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0614  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.07 
 
 
628 aa  682    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.25 
 
 
639 aa  655    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3654  ATP-dependent metalloprotease  53.28 
 
 
647 aa  636    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000517371  normal  0.935097 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3485  ATP-dependent metalloprotease  53.44 
 
 
647 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000163816  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3755  FtsH peptidase  87.89 
 
 
613 aa  1072    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.916692 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4594  FtsH peptidase  58.96 
 
 
628 aa  691    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4500  ATP-dependent metalloprotease  53.44 
 
 
644 aa  637    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000284191  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0630  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.07 
 
 
628 aa  682    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3555  ATP-dependent metalloprotease  53.44 
 
 
647 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00594001  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02581  cell division protein FtsH2  71.68 
 
 
619 aa  892    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  88.93 
 
 
616 aa  1068    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3313  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.59 
 
 
628 aa  696    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.711705 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08041  FtsH ATP-dependent protease-like protein  55.27 
 
 
637 aa  664    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0315531  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.73 
 
 
652 aa  644    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08451  FtsH ATP-dependent protease-like protein  58.03 
 
 
637 aa  660    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0508625  hitchhiker  0.00322552 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.68 
 
 
643 aa  657    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2664  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.03 
 
 
656 aa  650    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00646659 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02471  cell division protein FtsH2  71.94 
 
 
617 aa  906    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35099  predicted protein  65.74 
 
 
651 aa  752    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.235498  decreased coverage  0.000591243 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0229  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.17 
 
 
608 aa  635    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02481  cell division protein FtsH2  72.43 
 
 
617 aa  911    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3058  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.68 
 
 
628 aa  705    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0539417  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3736  ATP-dependent metalloprotease  52.62 
 
 
647 aa  634  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000470783  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3424  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.73 
 
 
657 aa  633  1e-180  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000853792  decreased coverage  0.000155742 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1197  cell division protein FtsH  52.06 
 
 
649 aa  634  1e-180  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3568  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.88 
 
 
657 aa  633  1e-180  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000520805  hitchhiker  0.00000681699 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3246  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.73 
 
 
657 aa  633  1e-180  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000231825  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2569  peptidase M41, FtsH  53.9 
 
 
641 aa  634  1e-180  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000845189  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3288  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.73 
 
 
657 aa  633  1e-180  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000787677  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  53.4 
 
 
608 aa  632  1e-180  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3396  microtubule-severing ATPase  52.66 
 
 
659 aa  632  1e-180  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000536506  decreased coverage  0.000042164 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1019  membrane protease FtsH catalytic subunit  52.06 
 
 
657 aa  634  1e-180  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000780208  hitchhiker  0.000608132 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1084  membrane protease FtsH catalytic subunit  52.06 
 
 
657 aa  634  1e-180  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000445375  normal  0.0888545 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1023  membrane protease FtsH catalytic subunit  51.89 
 
 
657 aa  633  1e-180  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000161981  hitchhiker  0.0000832625 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.38 
 
 
612 aa  632  1e-180  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.91 
 
 
645 aa  632  1e-180  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.107147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>