More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3029 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.56 
 
 
608 aa  660    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0370  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.72 
 
 
604 aa  655    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000686263  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.48 
 
 
639 aa  652    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2664  ATP-dependent metalloprotease FtsH  69.13 
 
 
656 aa  847    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00646659 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4361  ATP-dependent metalloprotease FtsH  69.33 
 
 
640 aa  885    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.29 
 
 
607 aa  637    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.49 
 
 
643 aa  752    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  52.63 
 
 
665 aa  638    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000097295  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50 
 
 
615 aa  645    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3029  ATP-dependent metalloprotease FtsH  100 
 
 
651 aa  1325    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0253083  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.58 
 
 
611 aa  649    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2185  FtsH-2 peptidase  61.55 
 
 
627 aa  647    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  51.82 
 
 
645 aa  637    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0145  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.25 
 
 
657 aa  642    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000285756  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  68.3 
 
 
638 aa  887    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.91 
 
 
676 aa  640    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_333  ATP-dependent metalloprotease, cell division protein  61.55 
 
 
499 aa  640    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000228185  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  51.6 
 
 
616 aa  634  1e-180  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  51.03 
 
 
608 aa  634  1e-180  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1806  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.38 
 
 
651 aa  632  1e-180  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266956  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.96 
 
 
620 aa  630  1e-179  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.92 
 
 
630 aa  628  1e-178  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.53 
 
 
637 aa  628  1e-178  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0503698  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0229  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.95 
 
 
608 aa  626  1e-178  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0081  FtsH-2 peptidase. Metallo peptidase. MEROPS family M41, membrane protease FtsH catalytic subunit  50.32 
 
 
693 aa  626  1e-178  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00746794  normal  0.780653 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1787  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.92 
 
 
656 aa  625  1e-178  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.124146 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  50.56 
 
 
614 aa  624  1e-177  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02180  membrane protease FtsH catalytic subunit  59.07 
 
 
759 aa  622  1e-177  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.203861  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1727  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.96 
 
 
636 aa  624  1e-177  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0229617  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  51.11 
 
 
673 aa  622  1e-177  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.76 
 
 
602 aa  622  1e-177  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0297  FtsH peptidase  56.99 
 
 
613 aa  619  1e-176  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0064  FtsH peptidase  49.76 
 
 
637 aa  620  1e-176  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.48 
 
 
610 aa  617  1e-175  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.28 
 
 
610 aa  616  1e-175  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0055  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.96 
 
 
671 aa  617  1e-175  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0105  FtsH-2 peptidase  58.29 
 
 
645 aa  617  1e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0152057  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3575  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.55 
 
 
616 aa  616  1e-175  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.873251 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.62 
 
 
630 aa  615  1e-175  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.810549  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0283  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.43 
 
 
640 aa  617  1e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.48 
 
 
621 aa  617  1e-175  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.16 
 
 
612 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1852  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.82 
 
 
612 aa  614  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3612  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.84 
 
 
645 aa  614  9.999999999999999e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.63 
 
 
640 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.610912  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3627  metalloprotease  50.63 
 
 
681 aa  612  9.999999999999999e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.840583  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.84 
 
 
612 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4335  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.87 
 
 
640 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0962233 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.83 
 
 
652 aa  613  9.999999999999999e-175  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3083  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.23 
 
 
640 aa  612  9.999999999999999e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2617  FtsH peptidase  50.08 
 
 
641 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.258853  normal  0.61812 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0073  cell division protein FtsH  49.21 
 
 
633 aa  610  1e-173  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.755624 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0063  cell division protein FtsH  49.21 
 
 
633 aa  609  1e-173  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2734  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.79 
 
 
617 aa  610  1e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000099937  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0064  cell division protein FtsH  49.21 
 
 
633 aa  610  1e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.651636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0060  cell division protein  49.21 
 
 
633 aa  610  1e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0060  cell division protein  49.21 
 
 
633 aa  610  1e-173  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.527958  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0944  FtsH peptidase  50.08 
 
 
626 aa  610  1e-173  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.129158  normal  0.715931 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0076  cell division protein FtsH  49.21 
 
 
633 aa  610  1e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0454651  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0064  cell division protein FtsH  49.21 
 
 
633 aa  610  1e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550597  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0228  cell division protein FtsH2  50.55 
 
 
617 aa  608  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.288231  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2817  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.84 
 
 
634 aa  611  1e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5386  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.4 
 
 
642 aa  608  1e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.853585  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0725  FtsH peptidase  53.36 
 
 
612 aa  611  1e-173  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1673  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.42 
 
 
653 aa  610  1e-173  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.720537  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0095  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.54 
 
 
599 aa  610  1e-173  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0780  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.84 
 
 
643 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0715854 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3196  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.67 
 
 
643 aa  608  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.766379  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1475  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.6 
 
 
639 aa  605  9.999999999999999e-173  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1268  membrane protease FtsH catalytic subunit  48.74 
 
 
640 aa  608  9.999999999999999e-173  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399956  normal  0.37717 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0168  ATP-dependent metallopeptidase HflB  57.06 
 
 
764 aa  607  9.999999999999999e-173  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000170494  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1635  cell division protein FtsH  51.66 
 
 
649 aa  607  9.999999999999999e-173  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.771629  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02481  cell division protein FtsH2  50.23 
 
 
617 aa  607  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9175  Microtubule-severing ATPase  48.78 
 
 
656 aa  605  9.999999999999999e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02471  cell division protein FtsH2  50.23 
 
 
617 aa  607  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.47 
 
 
648 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202032  normal  0.0464003 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0072  cell division protein FtsH  48.74 
 
 
633 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.12055  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2852  membrane protease FtsH catalytic subunit  49.44 
 
 
640 aa  607  9.999999999999999e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0642  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.83 
 
 
616 aa  607  9.999999999999999e-173  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.82 
 
 
639 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3755  FtsH peptidase  51.34 
 
 
613 aa  605  9.999999999999999e-173  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.916692 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4925  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.92 
 
 
640 aa  605  9.999999999999999e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147921  normal  0.185615 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.24 
 
 
642 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.496993  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2383  FtsH peptidase  49.6 
 
 
639 aa  605  9.999999999999999e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4840  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.24 
 
 
642 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199013  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.64 
 
 
640 aa  607  9.999999999999999e-173  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0801  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.6 
 
 
651 aa  605  9.999999999999999e-173  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000253513  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0981  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.45 
 
 
637 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38316  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1691  cell division protein FtsH  51.49 
 
 
644 aa  605  1.0000000000000001e-171  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0064  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.27 
 
 
635 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002603  cell division protein FtsH  49.2 
 
 
660 aa  602  1.0000000000000001e-171  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000182706  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0575  FtsH peptidase  50.79 
 
 
613 aa  602  1.0000000000000001e-171  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0102882  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5244  cell division protein FtsH  48.74 
 
 
633 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.293032 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1223  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.32 
 
 
651 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.514183  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.21 
 
 
632 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.75 
 
 
633 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1098  membrane protease FtsH catalytic subunit  50.24 
 
 
640 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.13074  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8426  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.89 
 
 
672 aa  603  1.0000000000000001e-171  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  50.24 
 
 
638 aa  601  1e-170  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0483  ATP-dependent metalloprotease  50.4 
 
 
643 aa  601  1e-170  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000499281  normal  0.35106 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>