More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4017 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.76 
 
 		 687 aa  687    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  67.7 
 
 		 760 aa  915    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0298  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.3 
 
 		 753 aa  730    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0835  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.17 
 
 		 671 aa  758    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0343776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2895  Mername-AA223 peptidase  60.15 
 
 		 682 aa  747    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.24 
 
 		 671 aa  769    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.066161 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35650  membrane protease FtsH catalytic subunit  63.32 
 
 		 798 aa  947    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.399414  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0627  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.06 
 
 		 682 aa  688    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0250398  normal  0.798069 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2987  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.14 
 
 		 669 aa  682    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.832035  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13642  cell division protein ftsH (membrane-bound protease)  68.67 
 
 		 760 aa  963    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052338 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5156  Mername-AA223 peptidase  66.45 
 
 		 784 aa  957    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4314  Mername-AA223 peptidase  54.1 
 
 		 753 aa  730    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0538  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.97 
 
 		 659 aa  679    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0673684  normal  0.0150565 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9175  Microtubule-severing ATPase  60.36 
 
 		 656 aa  744    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  100 
 
 		 793 aa  1612    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8426  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.1 
 
 		 672 aa  742    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32090  membrane protease FtsH catalytic subunit  57.43 
 
 		 684 aa  704    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0559  ATP-dependent metalloprotease FtsH  68.72 
 
 		 801 aa  968    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12800  membrane protease FtsH catalytic subunit  53.36 
 
 		 704 aa  635    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.113847  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4770  Mername-AA223 peptidase  66.84 
 
 		 783 aa  959    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24780  membrane protease FtsH catalytic subunit  55.28 
 
 		 698 aa  650    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4744  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.96 
 
 		 669 aa  784    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000616135 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3447  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.7 
 
 		 679 aa  746    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.311187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1416  ATP-dependent metalloprotease FtsH  74.96 
 
 		 794 aa  966    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0495193  normal  0.256654 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0313  ATP-dependent metalloprotease FtsH  68.46 
 
 		 743 aa  911    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4505  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.18 
 
 		 672 aa  732    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0151  Mername-AA223 peptidase  57.05 
 
 		 689 aa  679    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4970  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.06 
 
 		 685 aa  712    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.259213 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2104  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.97 
 
 		 677 aa  659    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  64.49 
 
 		 684 aa  678    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.447508 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0204  Mername-AA223 peptidase  60.82 
 
 		 654 aa  752    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.176031  normal  0.159439 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01240  membrane protease FtsH catalytic subunit  58.25 
 
 		 696 aa  684    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0444  Mername-AA223 peptidase  58.79 
 
 		 681 aa  665    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4856  Mername-AA223 peptidase  66.84 
 
 		 783 aa  959    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5372  ATP-dependent metalloprotease FtsH  69.39 
 
 		 781 aa  981    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00418248 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0616  ATP-dependent metalloprotease FtsH  65.64 
 
 		 662 aa  793    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2185  FtsH-2 peptidase  62.13 
 
 		 627 aa  631  1e-179  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1673  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.76 
 
 		 653 aa  627  1e-178  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.720537  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.97 
 
 		 643 aa  626  1e-178  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.59 
 
 		 639 aa  625  1e-177  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.08 
 
 		 615 aa  624  1e-177  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1806  ATP-dependent metalloprotease FtsH  64.57 
 
 		 651 aa  616  1e-175  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266956  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1848  ATP-dependent Zn protease  52.69 
 
 		 697 aa  605  1.0000000000000001e-171  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.702512  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.49 
 
 		 611 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02180  membrane protease FtsH catalytic subunit  61.13 
 
 		 759 aa  605  1.0000000000000001e-171  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.203861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0145  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60 
 
 		 657 aa  604  1.0000000000000001e-171  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000285756  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.88 
 
 		 602 aa  602  1.0000000000000001e-171  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0150  cell division protein FtsH, putative  51.82 
 
 		 700 aa  599  1e-170  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0546  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.62 
 
 		 697 aa  601  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.57 
 
 		 632 aa  599  1e-170  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0533  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.62 
 
 		 697 aa  601  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.37995  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0064  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.15 
 
 		 635 aa  597  1e-169  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0229  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.67 
 
 		 608 aa  598  1e-169  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2896  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.71 
 
 		 750 aa  593  1e-168  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.72 
 
 		 620 aa  592  1e-168  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  58.6 
 
 		 614 aa  592  1e-167  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3627  metalloprotease  52.31 
 
 		 681 aa  590  1e-167  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.840583  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.16 
 
 		 648 aa  591  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202032  normal  0.0464003 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.22 
 
 		 639 aa  591  1e-167  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3196  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.98 
 
 		 643 aa  590  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.766379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0095  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.59 
 
 		 599 aa  591  1e-167  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.65 
 
 		 640 aa  588  1e-166  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0780  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.33 
 
 		 643 aa  585  1.0000000000000001e-165  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0715854 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1132  ATP-dependent metallopeptidase HflB  51.14 
 
 		 769 aa  584  1.0000000000000001e-165  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  57.97 
 
 		 608 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1098  membrane protease FtsH catalytic subunit  54.94 
 
 		 640 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.13074  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0105  FtsH-2 peptidase  52.74 
 
 		 645 aa  584  1.0000000000000001e-165  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0152057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.95 
 
 		 645 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0081  FtsH-2 peptidase. Metallo peptidase. MEROPS family M41, membrane protease FtsH catalytic subunit  56.92 
 
 		 693 aa  584  1.0000000000000001e-165  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00746794  normal  0.780653 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3083  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.16 
 
 		 640 aa  585  1.0000000000000001e-165  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_002936  DET0391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.22 
 
 		 608 aa  580  1e-164  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1317  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.04 
 
 		 638 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3029  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.11 
 
 		 651 aa  578  1e-164  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0253083  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.38 
 
 		 633 aa  581  1e-164  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1818  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.14 
 
 		 638 aa  579  1e-164  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192895  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4743  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.33 
 
 		 638 aa  579  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3506  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.11 
 
 		 638 aa  582  1e-164  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02030  membrane protease FtsH catalytic subunit  57.93 
 
 		 783 aa  579  1e-164  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000829689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_333  ATP-dependent metalloprotease, cell division protein  58.37 
 
 		 499 aa  580  1e-164  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000228185  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5244  cell division protein FtsH  60.38 
 
 		 633 aa  580  1e-164  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.293032 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0063  cell division protein FtsH  60.72 
 
 		 633 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0064  cell division protein FtsH  60.72 
 
 		 633 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.651636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0060  cell division protein  60.72 
 
 		 633 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0060  cell division protein  60.72 
 
 		 633 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.527958  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0072  cell division protein FtsH  60.72 
 
 		 633 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.12055  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2710  peptidase M41, FtsH  55.68 
 
 		 640 aa  578  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4423  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.07 
 
 		 626 aa  576  1.0000000000000001e-163  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.765362 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0076  cell division protein FtsH  60.72 
 
 		 633 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0454651  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0064  cell division protein FtsH  60.72 
 
 		 633 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550597  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4509  membrane protease FtsH catalytic subunit  58.4 
 
 		 652 aa  578  1.0000000000000001e-163  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.47 
 
 		 638 aa  576  1.0000000000000001e-163  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5386  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.37 
 
 		 642 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.853585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.65 
 
 		 630 aa  578  1.0000000000000001e-163  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  59.47 
 
 		 645 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0073  cell division protein FtsH  60.72 
 
 		 633 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.755624 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.4 
 
 		 621 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0370  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.89 
 
 		 604 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000686263  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4335  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.98 
 
 		 640 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0962233 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4141  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.49 
 
 		 638 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4361  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.77 
 
 		 640 aa  575  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193811 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>