More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1606 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1606  ATP-dependent metalloprotease FtsH  100 
 
 
660 aa  1333    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.04 
 
 
637 aa  618  1e-176  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0503698  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4836  Microtubule-severing ATPase  53.58 
 
 
641 aa  607  9.999999999999999e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.25 
 
 
676 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0055  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.98 
 
 
671 aa  600  1e-170  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  51.32 
 
 
665 aa  598  1e-170  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000097295  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  50 
 
 
614 aa  592  1e-168  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.17 
 
 
612 aa  592  1e-168  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1787  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.62 
 
 
656 aa  588  1e-167  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.124146 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  48.83 
 
 
608 aa  586  1e-166  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1098  membrane protease FtsH catalytic subunit  49.92 
 
 
640 aa  586  1e-166  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.13074  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.71 
 
 
639 aa  588  1e-166  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1984  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.72 
 
 
659 aa  586  1e-166  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.614445 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.68 
 
 
612 aa  586  1e-166  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.66 
 
 
652 aa  584  1.0000000000000001e-165  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2734  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.25 
 
 
617 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000099937  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.26 
 
 
666 aa  576  1.0000000000000001e-163  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.302131  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1727  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.27 
 
 
636 aa  574  1.0000000000000001e-162  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0229617  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0725  FtsH peptidase  50.34 
 
 
612 aa  572  1.0000000000000001e-162  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48 
 
 
621 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3452  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.68 
 
 
660 aa  572  1e-161  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.380893  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.59 
 
 
602 aa  572  1e-161  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  48.74 
 
 
616 aa  572  1e-161  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3506  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.25 
 
 
638 aa  571  1e-161  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.75 
 
 
620 aa  566  1e-160  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0166  cell division protein FtsH  49.34 
 
 
651 aa  568  1e-160  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000721667  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2262  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.09 
 
 
641 aa  565  1e-160  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000538209  hitchhiker  0.0000000171199 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0064  FtsH peptidase  49.07 
 
 
637 aa  565  1e-160  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1599  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.08 
 
 
647 aa  567  1e-160  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.238697 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2636  cell division protein FtsH  49.09 
 
 
641 aa  565  1e-160  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.235612  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002603  cell division protein FtsH  48.67 
 
 
660 aa  567  1e-160  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000182706  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03404  hypothetical protein  48.67 
 
 
658 aa  564  1.0000000000000001e-159  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1207  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.41 
 
 
643 aa  565  1.0000000000000001e-159  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.390556  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.14 
 
 
615 aa  564  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1495  FtsH peptidase  48.99 
 
 
635 aa  565  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.629279  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4743  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.48 
 
 
638 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4509  membrane protease FtsH catalytic subunit  48.18 
 
 
652 aa  564  1.0000000000000001e-159  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2372  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.99 
 
 
635 aa  565  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2460  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.65 
 
 
635 aa  562  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03043  protease, ATP-dependent zinc-metallo  49.33 
 
 
644 aa  560  1e-158  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000537455  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0529  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.33 
 
 
647 aa  560  1e-158  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000027152  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3627  metalloprotease  47.85 
 
 
681 aa  560  1e-158  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.840583  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4500  ATP-dependent metalloprotease  49.33 
 
 
644 aa  560  1e-158  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000284191  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3474  ATP-dependent metalloprotease  49.33 
 
 
647 aa  560  1e-158  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000879508  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3736  ATP-dependent metalloprotease  48.68 
 
 
647 aa  559  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000470783  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3663  ATP-dependent metalloprotease  49.33 
 
 
647 aa  560  1e-158  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000724409  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02994  hypothetical protein  49.33 
 
 
644 aa  560  1e-158  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000535271  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2710  peptidase M41, FtsH  47.58 
 
 
640 aa  561  1e-158  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3602  ATP-dependent metalloprotease  48.68 
 
 
644 aa  559  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000683259  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3370  ATP-dependent metalloprotease  49.33 
 
 
647 aa  560  1e-158  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.23805e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0522  ATP-dependent metalloprotease  49.33 
 
 
644 aa  560  1e-158  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000177959  hitchhiker  0.00179189 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.33 
 
 
634 aa  559  1e-158  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0483  ATP-dependent metalloprotease  48.84 
 
 
643 aa  560  1e-158  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000499281  normal  0.35106 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0283  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.18 
 
 
640 aa  560  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  48.76 
 
 
645 aa  560  1e-158  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1975  FtsH peptidase  47.87 
 
 
639 aa  559  1e-158  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.182239  hitchhiker  0.00765382 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0168  ATP-dependent metallopeptidase HflB  46.98 
 
 
764 aa  561  1e-158  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000170494  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  48.82 
 
 
673 aa  560  1e-158  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3985  ATP-dependent metalloprotease  48.51 
 
 
647 aa  557  1e-157  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000069949  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.26 
 
 
617 aa  558  1e-157  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00193369  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3612  ATP-dependent metalloprotease  48.91 
 
 
644 aa  556  1e-157  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000242003  normal  0.275176 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.76 
 
 
611 aa  556  1e-157  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.25 
 
 
630 aa  556  1e-157  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.810549  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3471  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.99 
 
 
650 aa  556  1e-157  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00121984  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1736  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.66 
 
 
630 aa  556  1e-157  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.195499  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6874  cell division protein FtsH  47.65 
 
 
638 aa  556  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0972491 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1818  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.98 
 
 
638 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192895  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4141  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.15 
 
 
638 aa  558  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.88 
 
 
607 aa  557  1e-157  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2522  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.4 
 
 
635 aa  556  1e-157  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000162887  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3592  ATP-dependent metalloprotease  49.16 
 
 
647 aa  557  1e-157  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000114537  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1317  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.15 
 
 
638 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3555  ATP-dependent metalloprotease  48.99 
 
 
647 aa  556  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00594001  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3592  ATP-dependent metalloprotease  48.99 
 
 
647 aa  556  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00319823  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3485  ATP-dependent metalloprotease  48.99 
 
 
647 aa  556  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000163816  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4335  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.18 
 
 
640 aa  556  1e-157  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0962233 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3083  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.09 
 
 
640 aa  556  1e-157  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.22 
 
 
643 aa  554  1e-156  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1268  membrane protease FtsH catalytic subunit  48.75 
 
 
640 aa  553  1e-156  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399956  normal  0.37717 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0981  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.9 
 
 
637 aa  552  1e-156  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38316  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2617  FtsH peptidase  48.68 
 
 
641 aa  552  1e-156  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.258853  normal  0.61812 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3352  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.91 
 
 
654 aa  554  1e-156  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000888182  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0566  ATP-dependent metalloprotease  48.99 
 
 
649 aa  555  1e-156  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000344177  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.38 
 
 
645 aa  553  1e-156  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.92 
 
 
610 aa  555  1e-156  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0706  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.86 
 
 
618 aa  552  1e-156  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.437381 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3486  ATP-dependent metalloprotease  48.83 
 
 
647 aa  555  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000528036  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.24 
 
 
627 aa  552  1e-156  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.28 
 
 
648 aa  552  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202032  normal  0.0464003 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2786  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.6 
 
 
601 aa  552  1e-156  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.75 
 
 
641 aa  553  1e-156  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.450794 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0954  vesicle-fusing ATPase  48.59 
 
 
650 aa  555  1e-156  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000306538  normal  0.326508 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3654  ATP-dependent metalloprotease  48.83 
 
 
647 aa  555  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000517371  normal  0.935097 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0801  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49 
 
 
651 aa  551  1e-155  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000253513  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3044  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.95 
 
 
646 aa  551  1e-155  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000897526  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0483  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.58 
 
 
631 aa  549  1e-155  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000161272  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.18 
 
 
640 aa  549  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.610912  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2852  membrane protease FtsH catalytic subunit  49.07 
 
 
640 aa  551  1e-155  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2472  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.43 
 
 
601 aa  550  1e-155  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5386  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.02 
 
 
642 aa  550  1e-155  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.853585  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>