More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4836 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1984  ATP-dependent metalloprotease FtsH  68.85 
 
 
659 aa  801    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.614445 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.39 
 
 
666 aa  654    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.302131  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4836  Microtubule-severing ATPase  100 
 
 
641 aa  1280    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1606  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.4 
 
 
660 aa  602  1.0000000000000001e-171  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  46.81 
 
 
614 aa  525  1e-147  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  46.71 
 
 
608 aa  524  1e-147  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.52 
 
 
621 aa  520  1e-146  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.32 
 
 
637 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0503698  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.07 
 
 
676 aa  513  1e-144  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0981  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.86 
 
 
637 aa  512  1e-144  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38316  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0706  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.01 
 
 
618 aa  513  1e-144  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.437381 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.58 
 
 
607 aa  513  1e-144  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1098  membrane protease FtsH catalytic subunit  47.51 
 
 
640 aa  515  1e-144  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.13074  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1727  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.85 
 
 
636 aa  511  1e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0229617  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.97 
 
 
639 aa  509  1e-143  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1599  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.08 
 
 
647 aa  511  1e-143  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.238697 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  46.39 
 
 
645 aa  509  1e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.74 
 
 
652 aa  509  1e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  45.61 
 
 
638 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.09 
 
 
612 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0064  FtsH peptidase  46.48 
 
 
637 aa  508  9.999999999999999e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4509  membrane protease FtsH catalytic subunit  45.62 
 
 
652 aa  506  9.999999999999999e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0055  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.38 
 
 
671 aa  505  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2522  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.76 
 
 
635 aa  504  1e-141  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000162887  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  47.75 
 
 
665 aa  502  1e-141  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000097295  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.76 
 
 
612 aa  504  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4925  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.39 
 
 
640 aa  500  1e-140  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147921  normal  0.185615 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2842  cell division protease ftsH  45 
 
 
639 aa  499  1e-140  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2711  cell division protease ftsH  45 
 
 
639 aa  499  1e-140  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0783  membrane protease FtsH catalytic subunit  45.17 
 
 
631 aa  500  1e-140  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000394436  unclonable  0.000000272669 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1736  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.64 
 
 
630 aa  499  1e-140  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.195499  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  45.35 
 
 
673 aa  500  1e-140  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3627  metalloprotease  44.66 
 
 
681 aa  497  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.840583  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.3 
 
 
648 aa  496  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202032  normal  0.0464003 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1207  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.3 
 
 
643 aa  496  1e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.390556  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3452  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.33 
 
 
660 aa  496  1e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.380893  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1691  cell division protein FtsH  47.39 
 
 
644 aa  497  1e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2734  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.32 
 
 
617 aa  496  1e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000099937  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1223  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.07 
 
 
651 aa  498  1e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.514183  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1635  cell division protein FtsH  47.56 
 
 
649 aa  498  1e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.771629  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2786  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.45 
 
 
601 aa  498  1e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2472  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.45 
 
 
601 aa  498  1e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1787  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.54 
 
 
656 aa  498  1e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.124146 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2617  FtsH peptidase  44.39 
 
 
641 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.258853  normal  0.61812 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0703  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.62 
 
 
650 aa  494  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0142787  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.18 
 
 
645 aa  492  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2383  FtsH peptidase  44.41 
 
 
639 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1475  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.41 
 
 
639 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3196  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.47 
 
 
643 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.766379  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1975  FtsH peptidase  46.68 
 
 
639 aa  492  9.999999999999999e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.182239  hitchhiker  0.00765382 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02481  cell division protein FtsH2  46.1 
 
 
617 aa  493  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2636  cell division protein FtsH  46.18 
 
 
641 aa  490  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.235612  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0944  FtsH peptidase  46.1 
 
 
626 aa  491  1e-137  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.129158  normal  0.715931 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1133  membrane protease FtsH catalytic subunit  45.08 
 
 
630 aa  489  1e-137  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0177636  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3471  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.56 
 
 
650 aa  491  1e-137  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00121984  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0228  cell division protein FtsH2  46.1 
 
 
617 aa  490  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.288231  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0660  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.35 
 
 
620 aa  489  1e-137  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.464509  normal  0.415833 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0483  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.04 
 
 
631 aa  489  1e-137  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000161272  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2262  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.18 
 
 
641 aa  490  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000538209  hitchhiker  0.0000000171199 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4423  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.05 
 
 
626 aa  489  1e-137  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.765362 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2011  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.8 
 
 
639 aa  489  1e-137  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.26 
 
 
615 aa  491  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42890  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.13 
 
 
637 aa  489  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2817  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.21 
 
 
634 aa  491  1e-137  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2624  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.57 
 
 
638 aa  489  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642505  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1268  membrane protease FtsH catalytic subunit  43.07 
 
 
640 aa  489  1e-137  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399956  normal  0.37717 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0566  ATP-dependent metalloprotease  45.39 
 
 
649 aa  490  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000344177  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0725  FtsH peptidase  44.35 
 
 
612 aa  491  1e-137  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2482  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.39 
 
 
622 aa  489  1e-137  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0283  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.19 
 
 
640 aa  489  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02471  cell division protein FtsH2  45.94 
 
 
617 aa  490  1e-137  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002603  cell division protein FtsH  44.3 
 
 
660 aa  486  1e-136  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000182706  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0879  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.94 
 
 
629 aa  486  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.200568  normal  0.0679699 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0366  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.32 
 
 
641 aa  486  1e-136  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.444728  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1526  ATP-dependent zinc metallopeptidase  44.26 
 
 
628 aa  485  1e-136  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155575  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.11 
 
 
611 aa  486  1e-136  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1440  cell division protein  45.44 
 
 
650 aa  485  1e-136  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2710  peptidase M41, FtsH  46.71 
 
 
640 aa  486  1e-136  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1467  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.67 
 
 
644 aa  486  1e-136  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179606  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0074  cell division protein  45.85 
 
 
645 aa  487  1e-136  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2569  peptidase M41, FtsH  46.61 
 
 
641 aa  488  1e-136  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000845189  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.75 
 
 
633 aa  488  1e-136  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33311  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.02 
 
 
645 aa  487  1e-136  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.107147  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2862  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.09 
 
 
629 aa  486  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198246  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1268  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.85 
 
 
631 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.972429  normal  0.432924 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1721  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.59 
 
 
628 aa  487  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.54064  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1506  ATP-dependent metallopeptidase HflB  45.44 
 
 
647 aa  486  1e-136  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.5 
 
 
643 aa  486  1e-136  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.83 
 
 
620 aa  486  1e-136  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2852  membrane protease FtsH catalytic subunit  44.39 
 
 
640 aa  486  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1262  FtsH peptidase  47.2 
 
 
629 aa  485  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4335  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.19 
 
 
640 aa  486  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0962233 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0816  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.03 
 
 
627 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3355  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.67 
 
 
647 aa  488  1e-136  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0224278  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2611  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.72 
 
 
642 aa  486  1e-136  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728917  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5386  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.52 
 
 
642 aa  487  1e-136  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.853585  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3352  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.71 
 
 
654 aa  487  1e-136  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000888182  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1297  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.85 
 
 
631 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.17526  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3654  ATP-dependent metalloprotease  44.28 
 
 
647 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000517371  normal  0.935097 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4743  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.27 
 
 
638 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>