More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2482 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2482  ATP-dependent metalloprotease FtsH  100 
 
 
622 aa  1268    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0660  ATP-dependent metalloprotease FtsH  78.26 
 
 
620 aa  1003    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.464509  normal  0.415833 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2182  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.61 
 
 
621 aa  741    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.863514  normal  0.57475 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3044  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.01 
 
 
646 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000897526  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.75 
 
 
637 aa  574  1.0000000000000001e-162  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0503698  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.91 
 
 
607 aa  565  1e-160  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0725  FtsH peptidase  47.43 
 
 
612 aa  565  1e-160  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.51 
 
 
676 aa  566  1e-160  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.88 
 
 
602 aa  563  1.0000000000000001e-159  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3575  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.82 
 
 
616 aa  562  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.873251 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0706  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.51 
 
 
618 aa  562  1.0000000000000001e-159  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.437381 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  49.33 
 
 
616 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0168  ATP-dependent metallopeptidase HflB  48.85 
 
 
764 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000170494  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  50.08 
 
 
665 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000097295  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.25 
 
 
652 aa  562  1.0000000000000001e-159  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  48.04 
 
 
614 aa  560  1e-158  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1133  membrane protease FtsH catalytic subunit  48.59 
 
 
630 aa  560  1e-158  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0177636  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  48.24 
 
 
608 aa  560  1e-158  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0297  FtsH peptidase  49.34 
 
 
613 aa  560  1e-158  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1727  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.71 
 
 
636 aa  560  1e-158  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0229617  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.59 
 
 
630 aa  560  1e-158  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002603  cell division protein FtsH  45.34 
 
 
660 aa  555  1e-157  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000182706  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0166  cell division protein FtsH  46.77 
 
 
651 aa  552  1e-156  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000721667  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03404  hypothetical protein  45.89 
 
 
658 aa  553  1e-156  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.09 
 
 
615 aa  553  1e-156  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.34 
 
 
621 aa  552  1e-156  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  47.84 
 
 
638 aa  551  1e-155  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1268  membrane protease FtsH catalytic subunit  48.03 
 
 
640 aa  549  1e-155  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399956  normal  0.37717 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.24 
 
 
612 aa  549  1e-155  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1599  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.73 
 
 
647 aa  550  1e-155  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.238697 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.03 
 
 
611 aa  551  1e-155  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03043  protease, ATP-dependent zinc-metallo  47.1 
 
 
644 aa  545  1e-154  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000537455  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0529  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.1 
 
 
647 aa  545  1e-154  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000027152  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3486  ATP-dependent metalloprotease  47.26 
 
 
647 aa  548  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000528036  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3663  ATP-dependent metalloprotease  47.1 
 
 
647 aa  545  1e-154  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000724409  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2817  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.74 
 
 
634 aa  545  1e-154  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3592  ATP-dependent metalloprotease  46.77 
 
 
647 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00319823  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0522  ATP-dependent metalloprotease  47.1 
 
 
644 aa  545  1e-154  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000177959  hitchhiker  0.00179189 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3654  ATP-dependent metalloprotease  46.6 
 
 
647 aa  545  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000517371  normal  0.935097 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3592  ATP-dependent metalloprotease  46.77 
 
 
647 aa  545  1e-154  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000114537  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3471  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.93 
 
 
650 aa  547  1e-154  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00121984  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3370  ATP-dependent metalloprotease  47.1 
 
 
647 aa  545  1e-154  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.23805e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3474  ATP-dependent metalloprotease  46.77 
 
 
647 aa  545  1e-154  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000879508  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02994  hypothetical protein  47.1 
 
 
644 aa  545  1e-154  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000535271  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3555  ATP-dependent metalloprotease  46.77 
 
 
647 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00594001  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3485  ATP-dependent metalloprotease  46.77 
 
 
647 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000163816  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3612  ATP-dependent metalloprotease  47.26 
 
 
644 aa  545  1e-154  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000242003  normal  0.275176 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4500  ATP-dependent metalloprotease  46.77 
 
 
644 aa  545  1e-154  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000284191  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1317  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.63 
 
 
638 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  47.97 
 
 
673 aa  545  1e-154  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0954  vesicle-fusing ATPase  48.09 
 
 
650 aa  548  1e-154  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000306538  normal  0.326508 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2569  peptidase M41, FtsH  47.12 
 
 
641 aa  543  1e-153  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000845189  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.06 
 
 
639 aa  543  1e-153  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3352  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.1 
 
 
654 aa  542  1e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000888182  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.92 
 
 
612 aa  545  1e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  47.21 
 
 
645 aa  544  1e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0801  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.43 
 
 
651 aa  542  1e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000253513  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0566  ATP-dependent metalloprotease  46.37 
 
 
649 aa  545  1e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000344177  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.88 
 
 
643 aa  544  1e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3452  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.61 
 
 
660 aa  538  9.999999999999999e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.380893  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3627  metalloprotease  47.05 
 
 
681 aa  539  9.999999999999999e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.840583  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0483  ATP-dependent metalloprotease  46.92 
 
 
643 aa  540  9.999999999999999e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000499281  normal  0.35106 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0081  FtsH-2 peptidase. Metallo peptidase. MEROPS family M41, membrane protease FtsH catalytic subunit  46.69 
 
 
693 aa  540  9.999999999999999e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00746794  normal  0.780653 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4335  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.94 
 
 
640 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0962233 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0944  FtsH peptidase  48.26 
 
 
626 aa  541  9.999999999999999e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.129158  normal  0.715931 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0283  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.1 
 
 
640 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0575  FtsH peptidase  48.69 
 
 
613 aa  539  9.999999999999999e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0102882  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1787  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.09 
 
 
656 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.124146 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1736  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.42 
 
 
630 aa  538  9.999999999999999e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.195499  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.01 
 
 
627 aa  538  9.999999999999999e-153  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0064  FtsH peptidase  46 
 
 
637 aa  541  9.999999999999999e-153  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2185  FtsH-2 peptidase  48.68 
 
 
627 aa  541  9.999999999999999e-153  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0981  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.64 
 
 
637 aa  541  9.999999999999999e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38316  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2834  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.28 
 
 
655 aa  536  1e-151  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000517945  normal  0.0155634 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.15 
 
 
616 aa  535  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1852  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.1 
 
 
612 aa  538  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3612  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3083  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.11 
 
 
640 aa  536  1e-151  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0055  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.93 
 
 
671 aa  535  1e-151  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3985  ATP-dependent metalloprotease  46.09 
 
 
647 aa  535  1e-151  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000069949  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0228  cell division protein FtsH2  45.73 
 
 
617 aa  535  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.288231  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0483  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.85 
 
 
631 aa  536  1e-151  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000161272  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1207  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.9 
 
 
643 aa  536  1e-151  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.390556  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1818  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.82 
 
 
638 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192895  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3602  ATP-dependent metalloprotease  46.26 
 
 
644 aa  537  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000683259  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0783  membrane protease FtsH catalytic subunit  45.94 
 
 
631 aa  535  1e-151  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000394436  unclonable  0.000000272669 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1606  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.31 
 
 
660 aa  538  1e-151  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3736  ATP-dependent metalloprotease  46.26 
 
 
647 aa  538  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000470783  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02481  cell division protein FtsH2  48.72 
 
 
602 aa  538  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5386  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.61 
 
 
642 aa  537  1e-151  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.853585  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.15 
 
 
616 aa  535  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.15 
 
 
645 aa  537  1e-151  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.107147  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2383  FtsH peptidase  48.12 
 
 
639 aa  538  1e-151  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1076  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.57 
 
 
701 aa  536  1e-151  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0074  cell division protein  47.15 
 
 
645 aa  536  1e-151  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1475  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.12 
 
 
639 aa  538  1e-151  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0206  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.2 
 
 
617 aa  533  1e-150  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1197  cell division protein FtsH  45.93 
 
 
649 aa  533  1e-150  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4509  membrane protease FtsH catalytic subunit  46.03 
 
 
652 aa  533  1e-150  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1223  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.99 
 
 
651 aa  532  1e-150  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.514183  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1098  membrane protease FtsH catalytic subunit  46.7 
 
 
640 aa  532  1e-150  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.13074  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>