More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0706 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0706  ATP-dependent metalloprotease FtsH  100 
 
 
618 aa  1265    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.437381 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.43 
 
 
652 aa  627  1e-178  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.51 
 
 
637 aa  624  1e-177  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0503698  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.06 
 
 
621 aa  624  1e-177  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  48.6 
 
 
614 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  49.92 
 
 
616 aa  600  1e-170  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  47.93 
 
 
608 aa  600  1e-170  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  50.75 
 
 
665 aa  598  1e-170  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000097295  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0172  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.5 
 
 
646 aa  599  1e-170  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0660  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.58 
 
 
620 aa  599  1e-170  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.464509  normal  0.415833 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.66 
 
 
612 aa  600  1e-170  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0055  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.25 
 
 
671 aa  595  1e-169  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2734  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.63 
 
 
617 aa  596  1e-169  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000099937  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1727  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.57 
 
 
636 aa  597  1e-169  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0229617  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.88 
 
 
612 aa  598  1e-169  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  50.25 
 
 
638 aa  592  1e-168  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.76 
 
 
676 aa  593  1e-168  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2522  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.93 
 
 
635 aa  589  1e-167  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000162887  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3627  metalloprotease  48.59 
 
 
681 aa  585  1e-166  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.840583  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0064  FtsH peptidase  49.75 
 
 
637 aa  588  1e-166  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  48.74 
 
 
645 aa  585  1e-166  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1975  FtsH peptidase  49.16 
 
 
639 aa  585  1e-166  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.182239  hitchhiker  0.00765382 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1787  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.17 
 
 
656 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.124146 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2182  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.51 
 
 
621 aa  582  1.0000000000000001e-165  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.863514  normal  0.57475 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3044  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.59 
 
 
646 aa  581  1e-164  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000897526  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0272  peptidase M41, FtsH  51.6 
 
 
639 aa  579  1e-164  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.520053  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0168  ATP-dependent metallopeptidase HflB  47.64 
 
 
764 aa  579  1e-164  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000170494  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1635  cell division protein FtsH  49.75 
 
 
649 aa  579  1e-164  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.771629  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4509  membrane protease FtsH catalytic subunit  47.01 
 
 
652 aa  579  1e-164  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.87 
 
 
639 aa  580  1e-164  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1691  cell division protein FtsH  49.58 
 
 
644 aa  578  1.0000000000000001e-163  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0944  FtsH peptidase  47.25 
 
 
626 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.129158  normal  0.715931 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5386  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.76 
 
 
642 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.853585  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1722  peptidase M41, FtsH  46.99 
 
 
631 aa  575  1.0000000000000001e-163  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.139159 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1223  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.41 
 
 
651 aa  576  1.0000000000000001e-163  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.514183  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2482  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.51 
 
 
622 aa  576  1.0000000000000001e-163  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2617  FtsH peptidase  47.25 
 
 
641 aa  575  1.0000000000000001e-163  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.258853  normal  0.61812 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4840  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.6 
 
 
642 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199013  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4335  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.26 
 
 
640 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0962233 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1180  cell division protein FtsH  47.95 
 
 
617 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334987  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.6 
 
 
642 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.496993  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4925  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.26 
 
 
640 aa  573  1.0000000000000001e-162  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147921  normal  0.185615 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3196  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.48 
 
 
643 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.766379  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.21 
 
 
645 aa  573  1.0000000000000001e-162  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2569  peptidase M41, FtsH  47.07 
 
 
641 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000845189  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0981  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.15 
 
 
637 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38316  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1317  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.54 
 
 
638 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4743  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.13 
 
 
638 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0283  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.42 
 
 
640 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.31 
 
 
648 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202032  normal  0.0464003 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0463  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.52 
 
 
662 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0426  FtsH peptidase  47.09 
 
 
652 aa  574  1.0000000000000001e-162  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.405966  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.28 
 
 
617 aa  568  1e-161  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00193369  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1475  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.76 
 
 
639 aa  568  1e-161  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.23 
 
 
615 aa  570  1e-161  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1207  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.4 
 
 
643 aa  571  1e-161  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.390556  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1133  membrane protease FtsH catalytic subunit  47.51 
 
 
630 aa  569  1e-161  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0177636  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2383  FtsH peptidase  46.76 
 
 
639 aa  568  1e-161  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2460  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.5 
 
 
635 aa  569  1e-161  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3083  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.61 
 
 
640 aa  571  1e-161  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1818  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.37 
 
 
638 aa  570  1e-161  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192895  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2852  membrane protease FtsH catalytic subunit  46.85 
 
 
640 aa  570  1e-161  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3506  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.96 
 
 
638 aa  568  1e-161  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3355  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.9 
 
 
647 aa  570  1e-161  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0224278  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  47.93 
 
 
673 aa  569  1e-161  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0366  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.99 
 
 
641 aa  571  1e-161  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.444728  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.42 
 
 
633 aa  570  1e-161  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33311  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2372  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.5 
 
 
635 aa  567  1e-160  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1770  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.16 
 
 
651 aa  565  1e-160  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.292571  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1495  FtsH peptidase  47.5 
 
 
635 aa  567  1e-160  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.629279  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4141  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.37 
 
 
638 aa  567  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.95 
 
 
620 aa  566  1e-160  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0358  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.7 
 
 
652 aa  567  1e-160  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1268  membrane protease FtsH catalytic subunit  46.96 
 
 
640 aa  566  1e-160  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399956  normal  0.37717 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.12 
 
 
607 aa  565  1e-160  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.32 
 
 
639 aa  565  1e-160  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.01 
 
 
640 aa  567  1e-160  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.26 
 
 
640 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.610912  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6874  cell division protein FtsH  48.44 
 
 
638 aa  565  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0972491 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2710  peptidase M41, FtsH  48.26 
 
 
640 aa  562  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2817  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.67 
 
 
634 aa  562  1.0000000000000001e-159  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2611  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.26 
 
 
642 aa  562  1.0000000000000001e-159  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728917  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.73 
 
 
634 aa  563  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1990  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.71 
 
 
659 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.144891  normal  0.186322 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2262  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.66 
 
 
641 aa  562  1.0000000000000001e-159  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000538209  hitchhiker  0.0000000171199 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.12 
 
 
611 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2636  cell division protein FtsH  46.66 
 
 
641 aa  562  1.0000000000000001e-159  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.235612  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0206  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.59 
 
 
617 aa  558  1e-158  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0780  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.01 
 
 
643 aa  560  1e-158  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0715854 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1229  cell division protein  47.59 
 
 
646 aa  561  1e-158  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000211886  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0391  peptidase M41, FtsH  46.32 
 
 
662 aa  560  1e-158  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0150338  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2393  FtsH peptidase  47.53 
 
 
619 aa  559  1e-158  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00023499  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1098  membrane protease FtsH catalytic subunit  47.18 
 
 
640 aa  561  1e-158  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.13074  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.93 
 
 
610 aa  558  1e-158  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2011  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.59 
 
 
639 aa  560  1e-158  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1599  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.49 
 
 
647 aa  561  1e-158  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.238697 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.93 
 
 
610 aa  559  1e-158  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0483  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.39 
 
 
631 aa  557  1e-157  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000161272  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2884  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.96 
 
 
623 aa  555  1e-157  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.402765  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.26 
 
 
641 aa  556  1e-157  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.450794 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>